長沙BD VDJ單細胞轉錄組測序

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數大約在50k左右；每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數普遍較少，導致基因中位數下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等，他們的基因表達數較高，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此，我們對細胞數量以及基因中位數確認時，需要考察實際組織的細胞組成。豐富的測序和數據分析經驗，烈冰配套全程個性化、定制化地數據分析服務。長沙BD VDJ單細胞轉錄組測序

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析，越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數據集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列（包括T細胞和B細胞受體）以及用于了解表觀基因組調控的開放染色質區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數據，研究人員的獲益更多，包括保留珍貴樣本、提高生產力、減少因批次效應引起的錯誤，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時間）。溫州scRNA單細胞服務機構烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復雜疾病研究的測序。

什么時候要用到去死細胞的操作呢？跟進烈冰生物多年單細胞測序服務經驗來看，當細胞懸液進行質量和活性檢測后，考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細胞大量死亡，可能已經丟失了原組織內的細胞比例和狀態(tài)，失真嚴重，建議重新收集樣本進行新的實驗，保證數據的高質量和實驗結果的準確性。但需要注意到，去除死細胞的操作會損失一定的細胞數量，因此希望您在提供樣本時，盡可能提供足量的細胞，以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題，BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低，一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉錄組的變化，在對細胞進行清洗和計數后，單細胞懸液應當保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應當在3min鐘內將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細胞的不同性質，因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間，以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如，有些細胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時間，它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離，增加了堵塞的風險，而且每個團塊被當成單細胞計數，又降低了細胞計數的準確性。此外，有些細胞更加粘稠，形成團塊的速度更快。對于這些細胞，必須盡量減少制備和使用之間的時間差。深度的單細胞測序數據解讀助力醫(yī)療健康大時代。

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數據分析平臺，針對龐大的單細胞測序數據，能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入gene list構建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調節(jié)寬、高和系數比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。截至2022年6月，烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章30+篇。廣州BD VDJ單細胞平臺

個性化制定測序項目方面，滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。長沙BD VDJ單細胞轉錄組測序

相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題，BD平臺普遍提供的細胞數量都在1000-10000不等的測序細胞量，特殊研究需求的項目，可提供上限40000個細胞的捕獲量（單個樣本）。這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，對于基于基因表達進行準確細胞分型上，無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說，都會更實用。此外針對特殊項目研究，如需要捕獲和分析脆弱的細胞，如粒細胞、中性粒細胞、CAR-T細胞、干細胞、移植瘤細胞、骨髓瘤細胞等，烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能，滿足您的實際需求。長沙BD VDJ單細胞轉錄組測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢，是一家專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發(fā)、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業(yè)務，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】公司。專業(yè)的團隊大多數員工都有多年工作經驗，熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能，致力于發(fā)展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌。公司以用心服務為重點價值，希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力，將生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發(fā)、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業(yè)務，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】等業(yè)務進行到底。自公司成立以來，一直秉承“以質量求生存，以信譽求發(fā)展”的經營理念，始終堅持以客戶的需求和滿意為重點，為客戶提供良好的單細胞測序，生物大數據云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序，從而使公司不斷發(fā)展壯大。