合肥scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

烈冰生物為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程： 對(duì)于不同用戶和實(shí)驗(yàn)，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(tái)（如 BD FACSMelody），是上游樣本富集的良好選擇。此外，我們具備BD Rhapsody單細(xì)胞成像儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測試，幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細(xì)胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜，可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，完成測序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具，即使沒有經(jīng)驗(yàn)的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息；助力醫(yī)療健康時(shí)代！合肥scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

Single Cell Sequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)（NGS，Next Generation Sequencing）分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了，如何獲得單個(gè)細(xì)胞？如果無法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞？單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬級(jí)別以上，如果被檢測的測序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞？單細(xì)胞測序成本非常高，尤其是需要測2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候，如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無法普及。所以，正因?yàn)檫@些問題的存在使得高通量測序在單個(gè)細(xì)胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足，直到幾個(gè)單細(xì)胞測序突破性技術(shù)的誕生。上海烈冰生物單細(xì)胞平臺(tái)烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。

單細(xì)胞測序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求，首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征，即堿基測序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

針對(duì)單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中，并且測序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例，細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn)，當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候，結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候，選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn)；否則，選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合，通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔，在這個(gè)空間，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)（Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理）。通過微孔板的物理分隔，將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠，一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中。這樣，每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠，那么在每一個(gè)磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，這個(gè)抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。搭配BD FACSMelody流式分選儀，全線搭建BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺(tái)。蘇州單細(xì)胞測序服務(wù)

自2019年起，烈冰生物BD單細(xì)胞測序平臺(tái)已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。合肥scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

對(duì)于稀有樣本，或細(xì)胞量比較少的稀有組織，樣本中每一粒細(xì)胞都很珍貴，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)該種類型的樣本能實(shí)現(xiàn)友好包容，如果在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中，我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢愋秃椭苽鋯渭?xì)胞懸液方法的不同，容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況。也會(huì)和您探討是否考慮去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物的操作，以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因?yàn)?，死亡的?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會(huì)導(dǎo)致檢測的背景噪聲，并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí)，對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測后，需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作），以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量。合肥scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢，交通便利，環(huán)境優(yōu)美，是一家服務(wù)型企業(yè)。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù)，是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè)。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，具有單細(xì)胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細(xì)胞多組學(xué)測序等多項(xiàng)業(yè)務(wù)。烈冰生物將以真誠的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品，為彼此贏得全新的未來！