武漢10X Genomics單細胞測序數(shù)據(jù)分析

Fluidigm C1平臺作為應用于單細胞測序（Single Cell RNA Sequencing）領域的商業(yè)化分選技術，基于富魯達（Fluidigm?）的微流控技術，大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞，進行各類的Single-Cell測序建庫。當然，通量還是比較小。但不可否認的是，現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測序，仍然在采用這樣的技術，如Single Cell DNA-Seq，Single Cell ATAC-Seq等，都是采用此技術進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說，至少在10X和BD，或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測序技術之前，C1仍然會是市場上的重要組成部分。截至2021年10月，烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章近20篇。武漢10X Genomics單細胞測序數(shù)據(jù)分析

單細胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個共同過程，即分離RNA并將其轉化為cDNA進行分析。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA，然后將其轉化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構建新一代測序文庫，從而測定整個轉錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點，并通過熒光測定表達水平。RT-qPCR限于已知靶點，而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉錄組基因表達分析。然而，這兩者只能提供細胞群體內(nèi)基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應容器中。然后用細胞特異性的條形碼標記RNA，確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞。與RNA-seq相似，帶有條形碼的cDNA也被用于構建新一代測序文庫，從而能夠對每個細胞的整個轉錄組進行基因表達測定。長沙二代測序單細胞測序服務機構烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序實驗平臺。

單細胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？ 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗，100+組織類型解離protocol，精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系，確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗，珍貴樣本無法使用？ 烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術，確保凍存組織使用。 珍貴樣本，細胞數(shù)量太少，消化背景雜無法做單細胞？ 采用國際認可的10X Genomics，BD Rhapsody雙平臺模式，根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少，背景雜也能做單細胞。 單細胞RNA分類精度不足，部分細胞無法細分？ 烈冰同時采用單細胞蛋白質(zhì)組與單細胞轉錄組測序技術，真正做到從上游到下游的全流程檢測，確保超高的細胞分類精度。

RNA測序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉錄組學方法作為一類強大的工具，可提供混合樣本的基因表達平均數(shù)據(jù)，幫助科學家開始揭示這種異質(zhì)性。隨后，技術創(chuàng)新的飛躍在單細胞技術上達到新高度——使得科學家能夠定義細胞類型特異的基因表達，從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅動其表達模式的細胞異質(zhì)性。這讓研究人員能夠更詳細地表征組織異質(zhì)性，鑒定稀有細胞類型，并逐個細胞地仔細分析其分子機制。當獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實的圖譜后，研究人員就有了更為堅實可靠的知識基礎，并能在這個基礎上規(guī)劃下一步實驗，以獲取更深入的可行動見解。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺，5000+項目檢驗，真實可信賴。

烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商，經(jīng)過多年實戰(zhàn)，擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗，實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實戰(zhàn)總結搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領域對大數(shù)據(jù)分析的需求。高通量測序實驗平臺，包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊，為您的科學研究保駕護航。單細胞科聯(lián)合空間轉錄組，展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況，揭示精細病理區(qū)域中“喚醒”的信號通路。高通量測序單細胞測序價格

單細胞測序數(shù)據(jù)分析，認準烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺。武漢10X Genomics單細胞測序數(shù)據(jù)分析

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù)，能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入gene list構建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。武漢10X Genomics單細胞測序數(shù)據(jù)分析

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