上海10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題，10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量，這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說，都會更實用。同時依托Random Cell Label技術(shù)，使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象，相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說，影響幾乎可以忽略不計（10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果，顯示無影響。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。上海10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

科研的魅力之處，在于無窮盡的探尋生命的本底，通過單細(xì)胞測序，我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致，那么不禁要問一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運調(diào)控機制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面，而不可否認(rèn)的是，此時空間坐標(biāo)的記錄，像一個還未長大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。重慶10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)機構(gòu)烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程單細(xì)胞測序服務(wù)。

關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒灅颖局苽洌@與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過酶促或機械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個基本原則，那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。

作為單細(xì)胞測序的一個重要里程碑，10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution，此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測序和分析，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況，并通過對復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析，繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體，單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。經(jīng)驗豐富的實驗團(tuán)隊，為獲得示組織內(nèi)真實表達(dá)水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保障。

Single Cell Sequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)（NGS，Next Generation Sequencing）分析每一個單個細(xì)胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了，如何獲得單個細(xì)胞？如果無法獲得單個細(xì)胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個細(xì)胞？單個組織細(xì)胞群體通常在百萬級別以上，如果被檢測的測序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個細(xì)胞？單細(xì)胞測序成本非常高，尤其是需要測2000~3000個以上的細(xì)胞的時候，如果單個細(xì)胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無法普及。所以，正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細(xì)胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足，直到幾個突破性技術(shù)的誕生。附加流式分選細(xì)胞表面Marker，對于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定，助力高要求測序項目。上海10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

烈冰一站式單細(xì)胞測序服務(wù)：立足科學(xué)研究，解碼生命本質(zhì)。上海10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì)，因為這可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間，以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時間，它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險，而且每個團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計數(shù)，又降低了細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性。此外，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團(tuán)塊的速度更快。對于這些細(xì)胞，必須盡量減少制備和使用之間的時間差。上海10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù)，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司，致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提?**的單細(xì)胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細(xì)胞多組學(xué)測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺，以應(yīng)用為重點，以服務(wù)為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價值，提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時代，對自身的建設(shè)毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。