北京10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

Fluidigm C1平臺(tái)作為應(yīng)用于單細(xì)胞測(cè)序（Single Cell RNA Sequencing）領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù)，基于富魯達(dá)（Fluidigm?）的微流控技術(shù)，大約在幾個(gè)小時(shí)中可以捕獲96個(gè)左右的細(xì)胞，進(jìn)行各類的Single-Cell測(cè)序建庫(kù)。當(dāng)然，通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是，現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測(cè)序，仍然在采用這樣的技術(shù)，如Single Cell DNA-Seq，Single Cell ATAC-Seq等，都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫(kù)。所以可以說(shuō)，至少在10X和BD，或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測(cè)序技術(shù)之前，C1仍然會(huì)是市場(chǎng)上的重要組成部分。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過雙文庫(kù)構(gòu)建，實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。北京10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

10× Genomics單細(xì)胞方案要求使用具有較高活性的單細(xì)胞懸液。在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中，我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢愋秃椭苽鋯渭?xì)胞懸液方法的不同，容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況。去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物對(duì)獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因?yàn)?，死亡的?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái)。這種cell-free RNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲，并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí)，對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后，需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作），以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量。陜西10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。

烈冰生物搭建近10臺(tái)10XGemomics平臺(tái)，目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供鼓舞，10X微流體“雙十字”交叉系統(tǒng)為8或16通道系統(tǒng)，每個(gè)通道上限可捕獲20000細(xì)胞，16通道一次可檢測(cè)細(xì)胞范圍為百萬(wàn)級(jí)別的細(xì)胞水平。此外，單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)65%，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型，利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究；細(xì)胞可適性高，對(duì)細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類型無(wú)限制。細(xì)胞捕獲周期較短，能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離，無(wú)需人工操作，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫(kù)構(gòu)建的所有的測(cè)序準(zhǔn)備工作。

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（Single Cell Browser），不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您，詳情請(qǐng)咨詢烈冰生物。烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)。

關(guān)于10X Genomics單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類型和樣本制備 ：10X平臺(tái)在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、無(wú)細(xì)胞隨便、極少的細(xì)胞團(tuán)塊，且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10X Genomics平臺(tái)兼容。一般來(lái)說(shuō)，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的，因此，必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn)，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液，烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助。深度的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型。北京10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)（Single Cell Sequencing）從一種新興的研究角度，借助已有的高通量測(cè)序手段，幫助研究者在樣本中細(xì)胞的異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了Bulk Population Sequencing所無(wú)法解決的問題。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來(lái)支撐。BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備，保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評(píng)估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的準(zhǔn)確質(zhì)控。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)，在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對(duì)單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后，又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持，幫助研究者在單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域收獲更多的成果。北京10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè)，技術(shù)力量雄厚。烈冰生物是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè)，一直“以人為本，服務(wù)于社會(huì)”的經(jīng)營(yíng)理念;“誠(chéng)守信譽(yù)，持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，具有單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等多項(xiàng)業(yè)務(wù)。烈冰生物自成立以來(lái)，一直堅(jiān)持走正規(guī)化、專業(yè)化路線，得到了廣大客戶及社會(huì)各界的普遍認(rèn)可與大力支持。