杭州空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-07

reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,例如成熟的B,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某一疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過1萬,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。自主研發(fā)PanoCell單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái)。杭州空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

基于10X Geomics 動(dòng)態(tài)微流控技術(shù),利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),形成短片段,單細(xì)胞ATAC測(cè)序在表觀基因組學(xué)水平上,揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問題,區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性,獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的重要突破:分析每個(gè)細(xì)胞數(shù)千個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)開放區(qū)域,識(shí)別細(xì)胞類型和細(xì)胞狀態(tài);識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤;探究驅(qū)動(dòng)細(xì)胞類型和狀態(tài)之間基因表達(dá)差異的非編碼序列;探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當(dāng)前重要的多組學(xué)研究基因表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的手段。武漢全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái)豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。

同恒檢測(cè)可以實(shí)現(xiàn)方法開發(fā)驗(yàn)證、配方成分檢測(cè)、元素分析測(cè)定、綜合解決方案、結(jié)構(gòu)分析確證、指定成分分析、腐蝕分析、模擬實(shí)驗(yàn)、未知物成分分析、異物分析工業(yè)診斷、含量檢測(cè)測(cè)定等服務(wù)項(xiàng)目,業(yè)務(wù)范圍不僅涵蓋了傳統(tǒng)的日化、消費(fèi)品、金屬、材料、保健食品、農(nóng)藥、紡織、涂料、醫(yī)療;還包含了現(xiàn)代熱點(diǎn)的5G通訊、人工智能、新能源產(chǎn)業(yè);從精密的半導(dǎo)體芯片、生物制藥、細(xì)菌病毒到宏觀的橋梁建筑、航天工業(yè)、工業(yè)生產(chǎn),同恒檢測(cè)始終堅(jiān)持為您提供精益求精的服務(wù)。

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過雙文庫構(gòu)建,實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。

高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(“Next-generation” sequencing),以能一次并行對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing)足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的 分析成為可能,所以又被稱為深度測(cè)序(deep sequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。單細(xì)胞測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。杭州單細(xì)胞TCR測(cè)序數(shù)據(jù)分析

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。杭州空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

免疫組庫是功能相似的n多細(xì)胞的統(tǒng)稱。而“免疫”是指免疫細(xì)胞,特指T/B淋巴細(xì)胞?!癝o~免疫組庫”(Immune Repertoire,IR),指某個(gè)體,特定時(shí)間點(diǎn)下,所有功能多樣性T/B淋巴細(xì)胞的總和。T/B細(xì)胞利用細(xì)胞表面受體(TCR/BCR)識(shí)別和結(jié)合抗原,介導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生針對(duì)性的免疫應(yīng)答,發(fā)揮免疫功能并做好記錄備案,如果該抗原再次入侵可迅速作出反應(yīng),作為健康衛(wèi)士守護(hù)肌體城池。基因片段V(D)J (Variable-可變區(qū); Diversity-多樣區(qū); joining-連接區(qū);) 會(huì)發(fā)生隨機(jī)重組,各基因片段可變形式分別為,V區(qū)(52種),D區(qū)(2種),J區(qū)(13種),配合V(D)J片段中堿基的插入和缺失,進(jìn)一步相互間的排列組合存在1012種以上組合形式,以此構(gòu)成了TCR和BCR多樣性的來源,而這種多樣性正是適應(yīng)性免疫系統(tǒng)能夠識(shí)別眾多抗原的基礎(chǔ)。杭州空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于閔行區(qū)新駿環(huán)路138號(hào)2幢2F。公司自成立以來,以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié),公司旗下單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序深受客戶的喜愛。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。烈冰生物立足于全國市場(chǎng),依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力,融合前沿的技術(shù)理念,飛快響應(yīng)客戶的變化需求。