溫州單細(xì)胞BCR測(cè)序

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-04

免疫組庫(kù)是功能相似的n多細(xì)胞的統(tǒng)稱。而“免疫”是指免疫細(xì)胞,特指T/B淋巴細(xì)胞。“So~免疫組庫(kù)”(Immune Repertoire,IR),指某個(gè)體,特定時(shí)間點(diǎn)下,所有功能多樣性T/B淋巴細(xì)胞的總和。T/B細(xì)胞利用細(xì)胞表面受體(TCR/BCR)識(shí)別和結(jié)合抗原,介導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生針對(duì)性的免疫應(yīng)答,發(fā)揮免疫功能并做好記錄備案,如果該抗原再次入侵可迅速作出反應(yīng),作為健康衛(wèi)士守護(hù)肌體城池?;蚱蜼(D)J (Variable-可變區(qū); Diversity-多樣區(qū); joining-連接區(qū);) 會(huì)發(fā)生隨機(jī)重組,各基因片段可變形式分別為,V區(qū)(52種),D區(qū)(2種),J區(qū)(13種),配合V(D)J片段中堿基的插入和缺失,進(jìn)一步相互間的排列組合存在1012種以上組合形式,以此構(gòu)成了TCR和BCR多樣性的來(lái)源,而這種多樣性正是適應(yīng)性免疫系統(tǒng)能夠識(shí)別眾多抗原的基礎(chǔ)。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。溫州單細(xì)胞BCR測(cè)序

免疫組庫(kù)測(cè)序有必要做嗎? 對(duì)于十的十二次方個(gè)以上的抗原識(shí)別基數(shù)來(lái)說(shuō),群體和個(gè)體間的免疫組庫(kù)的豐富程度能夠直接反應(yīng)機(jī)體免疫系統(tǒng)情況,通常TCR/BCR的亞型越多,機(jī)體識(shí)別病原的能力越強(qiáng),越不容易患病,但超過(guò)一定限度,也容易引發(fā)自身免疫性疾病。且機(jī)體的免疫組庫(kù)也不是一成不變的,會(huì)隨著年齡,環(huán)境,藥物,患病等等因素,免疫組庫(kù)多樣性也時(shí)刻處于動(dòng)態(tài)變化當(dāng)中。由此,將免疫組庫(kù)測(cè)序用于臨床診斷和診療上,有助于對(duì)群體或個(gè)體間進(jìn)行免疫監(jiān)測(cè),探究相關(guān)疾病和免疫應(yīng)答的關(guān)系,監(jiān)測(cè)免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制。常州單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與單細(xì)胞測(cè)序的結(jié)果不同,這里存在一個(gè)概念叫做Number of Spots under tissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn)。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá)。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了。如果組織沒(méi)有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒(méi)有基因表達(dá),即無(wú)有效Spot位點(diǎn)。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,也就是說(shuō)組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。

烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國(guó)際前沿、整合添加多項(xiàng)國(guó)際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果,詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Raw data(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過(guò)程后,就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進(jìn)行Spot的Cluster的過(guò)程,熟悉單細(xì)胞測(cè)序的研究者知道,Cluster在單細(xì)胞測(cè)序中往往表示為細(xì)胞的類型,也就是說(shuō)能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype(當(dāng)然分情況也會(huì)有不同)。而在空轉(zhuǎn)中,也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性,導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域,或者說(shuō)是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì),為獲得示組織內(nèi)真實(shí)表達(dá)水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保障。杭州BD VDJ測(cè)序價(jià)格

烈冰智造PanoCell單細(xì)胞捕獲,媲美國(guó)際主流的單細(xì)胞平臺(tái)。溫州單細(xì)胞BCR測(cè)序

10X Genomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細(xì)胞,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,并通過(guò)微流控技術(shù),將之輸入到油相孔道中。這時(shí)候,就形成了一個(gè)個(gè)油滴后輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),進(jìn)而完成細(xì)胞中RNA的捕獲過(guò)程。溫州單細(xì)胞BCR測(cè)序

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