生物技術(shù)酵母文庫規(guī)格

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-03

酵母文庫:細(xì)菌鞭毛蛋白是一種重要的細(xì)菌毒力因子,可刺激動(dòng)植物細(xì)胞中的分子免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。脊椎動(dòng)物識(shí)別鞭毛蛋白和建立有效免疫反應(yīng)的詳細(xì)機(jī)制已經(jīng)被揭示;然而,無脊椎動(dòng)物是否能夠識(shí)別鞭毛蛋白仍未可知。2022年1月24日,山東大學(xué)王顯偉團(tuán)隊(duì)在PLOSPATHOGENS(IF:6.823)上發(fā)表了題為“Shoc2regnizesbacterialflagellinandmediatesantibacterialErk/Statsignalinginaninvertebrate”的研究論文,揭示了MjShoc2可以與鞭毛蛋白FlaA互作,引發(fā)一系列炎癥反應(yīng),促使對蝦抵抗細(xì)菌***,為無脊椎動(dòng)物對鞭毛蛋白的感知機(jī)制提供了見解。該項(xiàng)目中所用的對蝦酵母文庫由歐易生物構(gòu)建。Gateway方法酵母雙雜交文庫構(gòu)建核系統(tǒng)與膜系。生物技術(shù)酵母文庫規(guī)格

酵母雜交試驗(yàn):隨著分子生物學(xué)研究進(jìn)入以蛋白質(zhì)組學(xué)為標(biāo)志的后基因組時(shí)代,蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-DNA相互作用已成為互作組學(xué)研究的熱門主題。人類基因粗略約編碼2萬種蛋白,只算一對一的相互作用種類也有12萬到100萬種。而加上動(dòng)態(tài)變化,每個(gè)物種、個(gè)體、細(xì)胞中都存在著一張張不同的互作網(wǎng)絡(luò)圖,這一張張圖譜中,蘊(yùn)藏著各種生命的奧秘。有兩種通用的相互作用組圖譜繪制方式:第一種酵母雜交試驗(yàn),通過偶聯(lián)基因表達(dá)體現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)發(fā)生直接相互作用的蛋白對。第二種是通過抗體/標(biāo)簽分離純化復(fù)合體,然后用質(zhì)譜鑒定復(fù)合體內(nèi)部組分,識(shí)別直接相互作用或間接相互作用的蛋白質(zhì)。兩種高通量方法彼此互補(bǔ),相互驗(yàn)證。海南品質(zhì)酵母文庫報(bào)價(jià)酵母文庫"酵母"和"文庫"有什么不同。

進(jìn)行了酵母雙雜交文庫的篩選,結(jié)果顯示鈣依賴的種子特異性蛋白激酶SPK可以與OsNF-YB9相互作用,分段截取互作驗(yàn)證顯示OsNF-YB9的N端是互作所必須的(圖a-b),并通過雙熒光分子互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)、BiFC、體外GST-pulldown實(shí)驗(yàn)得以證實(shí)(圖c-e)。亞細(xì)胞定位顯示SPK主要在細(xì)胞質(zhì)中表達(dá),OsNF-YB9在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中都有表達(dá),共表達(dá)SPK和OsNF-YB9***促進(jìn)了OsNF-YB9的入核(圖f),表明SPK和OsNF-YB9的相互作用可能促進(jìn)了OsNF-YB9從細(xì)胞質(zhì)向細(xì)胞核的運(yùn)輸。RT-PCR顯示SPK在發(fā)育中的種子中高表達(dá),在5DAF開始***,并在10-30DAF維持高表達(dá)水平(圖a-b)。spk敲除突變體種子中堊白率的增加(圖c-e),但粒形和粒重與野生型沒有***差別。

小歐從2018年即開始關(guān)注酵母雜交與高通量測序相結(jié)合的技術(shù)發(fā)展,如2017年CaoGang老師等發(fā)表的RLL-Y2H技術(shù),實(shí)現(xiàn)了文庫篩文庫可能,該技術(shù)通過對酵母雙雜常用載體的改造,并結(jié)合高通量測序,可直接獲得AD-BD互作蛋白對。所用方法相當(dāng)巧妙,感興趣的同學(xué)請點(diǎn)擊《當(dāng)酵母雙雜交遇到高通量測序》。鈕老師團(tuán)隊(duì)之前的研究已經(jīng)鑒定了DAL1作為一種保守的針葉樹年齡生物標(biāo)記基因,在油松從營養(yǎng)生長到生殖生長的時(shí)相轉(zhuǎn)變過程中起重要作用。為了進(jìn)一步理解年齡效應(yīng)如何驅(qū)動(dòng)針葉樹的發(fā)育,闡明與DAL1相關(guān)的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)很關(guān)鍵。鈕老師團(tuán)隊(duì)利用傳統(tǒng)的Y2H篩選技術(shù)結(jié)合NGS測序技術(shù),優(yōu)化得到了Y2H-seq技術(shù),與傳統(tǒng)的篩選測序相比,大幅度節(jié)省了時(shí)間和實(shí)驗(yàn)成本。酵母文庫已知蛋白互作靈活定制建庫。

通過酵母雙雜篩選實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步研究AaWRKY9蛋白功能,結(jié)果篩選到了與AaWRKY9互作的AaJAZ9蛋白,并通過Y2H、BiFC、CoIP等進(jìn)行了驗(yàn)證確認(rèn)。JAZs是JA介導(dǎo)的植物相應(yīng)中的負(fù)向調(diào)控因子,在毛狀體和老葉中高表達(dá),在芽尖和嫩葉中表達(dá)量低。為確認(rèn)AaJAZ9是否抑制了AaWRKY9在促進(jìn)青蒿素積累過程中的轉(zhuǎn)錄***功能,通過雙熒光素酶報(bào)告基因檢測實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),當(dāng)AaWRKY9與AaJAZ9共表達(dá)時(shí),其轉(zhuǎn)錄活性被抑制,而使用MeJA處理后,這種抑制作用被抵消,且AaWRKY9轉(zhuǎn)錄活性增強(qiáng),反向驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。說明JA可以通過降解JAZ9,提高AaWRKY9轉(zhuǎn)錄活性,促進(jìn)青蒿素生物合成。酵母三雜交系統(tǒng)原理酵母雙雜交文庫構(gòu)建。甘肅生物技術(shù)酵母文庫

不懂就問,酵母文庫實(shí)驗(yàn)室究竟長啥樣?擁有十余年豐富的文庫構(gòu)建。生物技術(shù)酵母文庫規(guī)格

通過酵母雙雜交進(jìn)行篩選,結(jié)果顯示 SWC6 可以在藍(lán)光下與 CRY1 相互作用(圖 A-C)。同樣,酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)顯示 CRY2 也可以在藍(lán)光下與 SWC6 相互作用(圖 D)。并通過 pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 實(shí)驗(yàn)(圖 E-L)證實(shí) CRY1、CRY2 與 SWC6 的結(jié)合是藍(lán)光依賴性的。SWC6 是真核生物中已報(bào)道的 SWR1 復(fù)合物亞基,負(fù)責(zé)催化 H2A.Z 在染色質(zhì)上的替換。已報(bào)道 SWR1 復(fù)合物中 SWC6 可以與 ARP6 亞基結(jié)合。Pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 實(shí)驗(yàn)(圖 A-H)顯示,CRY1、CRY2 可以藍(lán)光依賴性與 ARP6 結(jié)合。生物技術(shù)酵母文庫規(guī)格

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