本文作者開發(fā)的一種基于敞開式空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質譜成像(AFADESI-MSI)的空間代謝組學技術,可以實現(xiàn)大腦功能區(qū)域小分子極性代謝物的檢測,發(fā)掘微區(qū)特定代謝途徑的變化;結合代謝網(wǎng)絡映射方法,對大鼠腦的代謝網(wǎng)絡作圖,并用于東莨菪堿***的阿爾茨海默病模型大腦微區(qū)的病理過程解析。這篇文章證實了空間代謝組學技術在神經學發(fā)展、行為與認知、精神與退行性疾病以及腦**研究領域的廣泛應用前景。大腦的結構極為復雜,且主要功能區(qū)域的調節(jié)機制與小分子代謝物密切相關?;谏V-質譜聯(lián)用的傳統(tǒng)代謝組學方法無法滿足大腦復雜微區(qū)代謝物的定性、定量和定位表征的需求。歐易生物空間代謝組學為廣大研究者提供一站式服務。四川空間代謝組學在植物葉片
收集了15名前列腺*患者共計45份新鮮冷凍組織**樣本,進行空間代謝組學分析。從而實現(xiàn)對良性區(qū)域和**、NCE(包括正常腺體和增生)和**的不同組織類型的代謝組和脂質組學研究。樣品和分析概述成功鑒定了 27 種代謝物和 44 種脂質,發(fā)現(xiàn)NCE(非*上皮細胞)、基質細胞和**組織代謝存在明顯差異。歐易生物鹿明生物豐富的項目實戰(zhàn)經驗1、已落地執(zhí)行項目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。山西空間代謝組學優(yōu)勢空間代謝組技術流程 。
展示了空間代謝組成像技術的應用。這一分析***表明脫髓鞘后新形成的髓鞘具有與正常髓鞘不同的脂質成分。因此,這種HSL方法學可能**提高目前對多發(fā)性硬化癥再髓鞘形成的理解,并可能為多發(fā)性硬化癥研究中評估再髓鞘形成***提供一種新的策略。此外,HSL方法可以針對***的組織量身定做,為生物醫(yī)學科學中的脂質結構和成分提供至關重要的見解。該研究開發(fā)了一種基于拉曼光譜、解吸電噴霧電離質譜(空間代謝組學)和免疫熒光成像的相關脂質組成像(HSL)方法,研究多發(fā)性硬化癥病變中的再髓鞘形成與正常髓鞘不同的脂質成分。結果通過對脂質結構和成分的研究為再髓鞘化***提供可能性。
AFADESI-MSI空間代謝組學:中文標題:一種基于分子組織學的高靈敏高覆蓋質譜成像方法用于檢測功能性代謝物研究對象:大鼠腎臟,大鼠腦和人食道*組織發(fā)表期刊:AdvancedScience影響因子:16.806運用生物技術:AFADESI-MSI空間代謝組學2018年11月中國醫(yī)學科學院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發(fā)表的研究論文,通過優(yōu)化的空氣動力輔助解吸電噴霧質譜成像(AFADESI-MSI)技術,繪制了生物樣本中超過1500種代謝物的空間分布圖譜,將功能代謝物的時空變化與組織結構和生物功能聯(lián)系起來。本研究開發(fā)了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法,用于原位分析組織上的代謝物并發(fā)現(xiàn)特異性生物標志物。通過非靶向分析,在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數(shù)千種代謝物,為分子組織學研究提供了有力的分析工具。質譜成像空間代謝組學方法及其應用研究進展。
通過空間代謝組學檢測到正常腎臟與MYC誘導的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發(fā)現(xiàn)兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。?;鶄孺溳^短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現(xiàn)增加趨勢,然后開始減少,但?;鶄孺溳^長的PG含量持續(xù)增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實驗證明,MYC的誘導和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達豐度(圖6D)。結果顯示,MYC參與調節(jié)FA生成和相關基因的表達。質譜成像技術可以實現(xiàn)生物上千代謝物的定性。福建空間代謝組學
空間分辨代謝組學進展和挑戰(zhàn)。四川空間代謝組學在植物葉片
1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質量數(shù)范圍50-500Da,質譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡分析原始數(shù)據(jù)經過轉化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結果;在獲取差異代謝物的高分辨率質譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡信息。大腦中復雜網(wǎng)絡可視化使用Cyctoscope軟件完成。四川空間代謝組學在植物葉片
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