代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學,中文標題:基于代謝組學分析的百菌清、多菌靈、咪鮮胺及其二元和三元混合物對斑馬魚胚胎和仔魚的健康風險研究對象:斑馬魚胚胎和仔魚發(fā)表期刊:JournalofHazardousMaterials影響因子:10.588運用生物技術:代謝組學環(huán)境毒理學浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營養(yǎng)所風險評估研究團隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應機制研究中取得新進展,作者:楊桂玲,王彥華,李健,王豆,鮑志偉,王強(通訊作者),靳遠詳(共同通訊作者),在JournalofHazardousMaterials期刊發(fā)表的文章,通過代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學的多組學整合分析技術來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發(fā)育階段的復雜病理生理和毒性通路。研究認為獲得的數(shù)據(jù)可以為不同類型殺菌劑及其混合物對水生生物的毒性提供理論依據(jù)。代謝組學熱圖聚類分析 火山圖 散點圖如何繪制。北京什么是代謝組學
非靶代謝組學研究:2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通過采用非靶代謝組學和基因表達芯片,發(fā)現(xiàn)了適應酸性微環(huán)境的胰腺導管腺* (PDAC)細胞具有更強的轉(zhuǎn)移和增殖能力。
代謝組學顯示適應酸性微環(huán)境的 PDAC 細胞中葡萄糖增加、糖酵解減少,而轉(zhuǎn)錄組學發(fā)現(xiàn)適應酸性微環(huán)境細胞中的差異表達基因主要為細胞外基質(zhì)修飾和 Hippo 信號傳導相關基因。MMP1 在在適應酸性微環(huán)境細胞中上調(diào)**為明顯,實驗驗證了其由 YAP/TAZ 通路介導,而被 AMPK抑制。該研究確認了代謝重編程通過AMPK/ YAP /MMP1軸促進適應酸性微環(huán)境的 PDAC 細胞的增殖和轉(zhuǎn)移。 浙江代謝組學 關聯(lián)分析常用的代謝組學相關數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。
LC-MS非靶向代謝組學研究方法,2021年11月,寧波大學海洋科學學院王春琳團隊在Frontiers in Marine Science期刊發(fā)表了題為“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通過LC-MS非靶向代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了氨基酸和能量代謝是參與青蟹適應鹽度變化的主要因素,而脂質(zhì)代謝物起輔助作用。中文標題:青蟹在適應鹽度急劇下降過程中的代謝變化研究對象:青蟹發(fā)表期刊:FrontiersinMarineScience影響因子:4.912發(fā)表時間:2021年11月2日合作單位:寧波大學應用海洋生物技術教育部重點實驗室運用生物技術:LC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術支持)
LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目:糞便微生物可以區(qū)分酒精性肝炎引起的酒精攝入量,但不能區(qū)分疾病的嚴重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*樣本類型:人糞便*檢測平臺:LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測為了表征酒精性肝炎有關的糞便微生物生態(tài)學,考察微生物組變化和疾病嚴重程度的關系,推斷微生物生態(tài)學變化的功能相關性,本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的糞便微生物組與健康(HC)和重度飲酒對照組(HDC)進行比較,通過16SrRNA基因測序鑒定微生物群分類,使用LC/MS平臺測量糞便短鏈脂肪酸(SCFA)含量。重度飲酒患者與健康對照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比,均可以發(fā)現(xiàn)明顯的微生物組特征分布。但微生物分類不能區(qū)分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,糞便中短鏈脂肪酸與產(chǎn)生SCFA的微生物菌群均減少,可以推斷出,酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化,與酒精性肝炎的嚴重程度無關。代謝組學——研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。
LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例,中文標題:***通絡***通過***和抗氧化作用預防及延緩糖尿病視網(wǎng)膜病變發(fā)展的機制研究研究對象:大鼠發(fā)表期刊:Biomedicine&Pharmacotherapy影響因子:6.529發(fā)表時間:2022年2月合作單位:中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術:LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)。文章通過對中藥***—***通絡方改善糖尿病病理方面的深入研究,表明在預防及***方面和微觀層面均起到了***效果。同時,也探究出***通絡方的內(nèi)在作用機制。也為糖尿病視網(wǎng)膜病變的早期***,提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學有助于對中藥成分進行***的分析,為藥物機制提供參考。代謝組學——后基因組時代新熱點。浙江靶向定量代謝組學
非靶標代謝組學預實驗,周期短,報告快,專業(yè)可信耐。北京什么是代謝組學
GC-MS非靶向代謝組:隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關注,本篇為2020年2月,南京大學環(huán)境學院課題組在Environmental Science & Technology雜志(IF=9.028)發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術對土壤微生物組和代謝組學分析技術的獨特結合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。標題:銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊:EnvironmentalScience&Technology影響因子:9.028發(fā)表時間:2020年2月合作單位:南京大學環(huán)境學院運用生物技術:16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術支持)。北京什么是代謝組學
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