上海代謝組學(xué)和腸道菌群相關(guān)分析

非靶代謝組學(xué)研究：2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶(hù)重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團(tuán)隊(duì)在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果，通過(guò)采用非靶代謝組學(xué)和基因表達(dá)芯片，發(fā)現(xiàn)了適應(yīng)酸性微環(huán)境的胰腺導(dǎo)管腺* (PDAC)細(xì)胞具有更強(qiáng)的轉(zhuǎn)移和增殖能力。

代謝組學(xué)顯示適應(yīng)酸性微環(huán)境的 PDAC 細(xì)胞中葡萄糖增加、糖酵解減少，而轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)現(xiàn)適應(yīng)酸性微環(huán)境細(xì)胞中的差異表達(dá)基因主要為細(xì)胞外基質(zhì)修飾和 Hippo 信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)基因。MMP1 在在適應(yīng)酸性微環(huán)境細(xì)胞中上調(diào)**為明顯，實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了其由 YAP/TAZ 通路介導(dǎo)，而被 AMPK抑制。該研究確認(rèn)了代謝重編程通過(guò)AMPK/ YAP /MMP1軸促進(jìn)適應(yīng)酸性微環(huán)境的 PDAC 細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移。 讀懂代謝組學(xué) 代謝組學(xué)的研究范疇。上海代謝組學(xué)和腸道菌群相關(guān)分析

土壤代謝組學(xué)：銀納米顆粒（AgNPs）是使用*****的工程納米材料之一，泄露可能導(dǎo)致顆粒在土壤中積累，并對(duì)環(huán)境造成未知風(fēng)險(xiǎn)。有報(bào)告指出AgNPs可能通過(guò)影響根系分泌物間接對(duì)微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響，但對(duì)其機(jī)理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征，但當(dāng)前有關(guān)NPs暴露對(duì)土壤微生物群落影響的研究不包括對(duì)土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關(guān)信息，鑒于它們的已知功能，人們可以對(duì)土壤生物化學(xué)的變化提出合理假設(shè)。本文作者利用16S rRNA基因測(cè)序和非靶向代謝組學(xué)方法，研究了AgNPs對(duì)土壤微生物群落的長(zhǎng)期影響。浙江代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)代謝組學(xué)多年質(zhì)譜組學(xué)系統(tǒng)研究經(jīng)驗(yàn)。

糞便代謝組分析，中文標(biāo)題：二烯丙基二硫化物(DADS)通過(guò)調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物來(lái)保護(hù)小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對(duì)象：小鼠糞便發(fā)表期刊：FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子：5.293發(fā)表時(shí)間：2022年1月7日合作單位：復(fù)旦大學(xué)上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學(xué)科運(yùn)用生物技術(shù)：糞便代謝組分析（由鹿明生物提供技術(shù)支持）、微生物16SrRNA測(cè)序。文章通過(guò)建立DSS 誘導(dǎo)的腸道白色念珠菌小鼠模型，模擬人類(lèi)腸道******。一方面證實(shí)了白色念珠菌可以增強(qiáng) DSS 結(jié)腸炎的嚴(yán)重程度，另一方面通過(guò)微生物組學(xué)和代謝組學(xué)等手段確認(rèn)了 DADS ***可以改善腸道生態(tài)失調(diào)（改變腸道微生物群和代謝物）、腸道通透性和全身炎癥反應(yīng)。深入了解 DADS ***的效果可能會(huì)為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。

糞便LC-MS代謝組學(xué)研究方法，2022年，復(fù)旦大學(xué)上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學(xué)科唐建國(guó)教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果，通過(guò)糞便微生物16SrRNA測(cè)序和糞便LC-MS代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了DADS***減輕了DSS誘導(dǎo)下腸道白色念珠菌***，并改變了小鼠腸道微生物群落結(jié)構(gòu)和代謝特征，探究了DADS可以調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物并保護(hù)腸道屏障的內(nèi)在機(jī)理，為***白色念珠菌***提供了理論依據(jù)。對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析-代謝組學(xué)。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法：2021年10月，廣東石油化工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果，通過(guò)GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝，丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達(dá)的代謝物被下調(diào)，表明有機(jī)磷阻燃劑對(duì)代謝功能和關(guān)鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機(jī)磷阻燃劑對(duì)環(huán)境產(chǎn)生的風(fēng)險(xiǎn)提供了新的見(jiàn)解?？臻g代謝組學(xué) 代謝組學(xué)測(cè)序原理 代謝組學(xué)研究?jī)r(jià)格。江蘇代謝組學(xué) 平臺(tái)

代謝組學(xué)行業(yè)解決方案和技術(shù)服務(wù)流程。上海代謝組學(xué)和腸道菌群相關(guān)分析

代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)，中文標(biāo)題：基于代謝組學(xué)分析的百菌清、多菌靈、咪鮮胺及其二元和三元混合物對(duì)斑馬魚(yú)胚胎和仔魚(yú)的健康風(fēng)險(xiǎn)研究對(duì)象：斑馬魚(yú)胚胎和仔魚(yú)發(fā)表期刊：JournalofHazardousMaterials影響因子：10.588運(yùn)用生物技術(shù)：代謝組學(xué)環(huán)境毒理學(xué)浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營(yíng)養(yǎng)所風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合浙江工業(yè)大學(xué)在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應(yīng)機(jī)制研究中取得新進(jìn)展，作者：楊桂玲，王彥華，李健，王豆，鮑志偉，王強(qiáng)（通訊作者），靳遠(yuǎn)詳（共同通訊作者），在JournalofHazardousMaterials期刊發(fā)表的文章，通過(guò)代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)的多組學(xué)整合分析技術(shù)來(lái)闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚(yú)早期發(fā)育階段的復(fù)雜病理生理和毒性通路。研究認(rèn)為獲得的數(shù)據(jù)可以為不同類(lèi)型殺菌劑及其混合物對(duì)水生生物的毒性提供理論依據(jù)。上海代謝組學(xué)和腸道菌群相關(guān)分析

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