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蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究案例:作為一種常見的******,脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲存過程中會污染谷物和飼料。DON在動物中會引起厭食和生長遲緩在內(nèi)的一系列不良反應(yīng)。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對鼠C2C12細胞進行了研究,分析DON對成肌細胞分化的影響。研究結(jié)果表明,DON通過下調(diào)細胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路來影響成肌細胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機制研究中的重要作用。中文標題:霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過下調(diào)細胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路影響成肌細胞分化研究對象:脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2C12細胞發(fā)表期刊:EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影響因子:6.291發(fā)表時間:2021年10月發(fā)表單位:中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所運用生物技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、免疫熒光、免疫印跡、PCRlabel free蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)原理。福建蛋白組學(xué)研究
TMTpro-16plex等標記試劑已經(jīng)發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實驗設(shè)計,16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺的蛋白組學(xué)近年來備受青睞,穩(wěn)定同位素標記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標記蛋白組,18個樣本以內(nèi),可實現(xiàn)一次標記和分級,避免了多批次標記引入的批次效應(yīng),能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時對更多蛋白質(zhì)鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。安徽蛋白組學(xué) 武漢公司蛋白質(zhì)組學(xué)多組學(xué)分析蛋白質(zhì)組學(xué)研究進展。
通過蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細胞活化來減輕嚴重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標題:大黃素通過抑制胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細胞活化減輕嚴重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時間:2021年10月合作單位:四川大學(xué)華西醫(yī)院運用生物技術(shù):TMT標記定量蛋白組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學(xué)的理解,加速了靶向***的進程。中國科學(xué)家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征,如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結(jié)果。蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動物,細胞樣品,酵母,微生物.。
為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊列和大腦區(qū)域,使用 TMT標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個隊列的所有組織,為每個隊列生成蛋白質(zhì)共表達網(wǎng)絡(luò),并評估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個隊列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊列和大腦區(qū)域(圖2b)。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā),建立蛋白共表達網(wǎng)絡(luò),綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標志物,并為治療帶來希望。歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。江蘇蛋白組學(xué)平臺建設(shè)
蛋白組學(xué)常見研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物。福建蛋白組學(xué)研究
作者進行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標志物來預(yù)測DKD狀態(tài)。五種機器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測的準確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果。總的來說,組合多組學(xué)標志物模型是一種強有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測DKD進展的潛在生物標志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測DKD的**標志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的組合可以提高預(yù)測和診斷DKD的準確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學(xué)的生物標志物可用于DKD的預(yù)警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數(shù)據(jù)資源。福建蛋白組學(xué)研究
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