蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究案例:作為一種常見的******,脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲(chǔ)存過程中會(huì)污染谷物和飼料。DON在動(dòng)物中會(huì)引起厭食和生長(zhǎng)遲緩在內(nèi)的一系列不良反應(yīng)。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)鼠C2C12細(xì)胞進(jìn)行了研究,分析DON對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響。研究結(jié)果表明,DON通過下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路來影響成肌細(xì)胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機(jī)制研究中的重要作用。中文標(biāo)題:霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路影響成肌細(xì)胞分化研究對(duì)象:脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2C12細(xì)胞發(fā)表期刊:EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影響因子:6.291發(fā)表時(shí)間:2021年10月發(fā)表單位:中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所運(yùn)用生物技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、免疫熒光、免疫印跡、PCRlabel free蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)原理。福建蛋白組學(xué)研究
TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對(duì)于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會(huì)是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺(tái)的蛋白組學(xué)近年來備受青睞,穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組,18個(gè)樣本以內(nèi),可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級(jí),避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng),能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時(shí)對(duì)更多蛋白質(zhì)鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個(gè)技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。安徽蛋白組學(xué) 武漢公司蛋白質(zhì)組學(xué)多組學(xué)分析蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展。
通過蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細(xì)胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化來減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標(biāo)題:大黃素通過抑制胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對(duì)象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時(shí)間:2021年10月合作單位:四川大學(xué)華西醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
label-free蛋白定量策略進(jìn)行蛋白組學(xué)的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細(xì)胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對(duì)該**生物學(xué)的理解,加速了靶向***的進(jìn)程。中國(guó)科學(xué)家選取了103例未經(jīng)***的中國(guó)肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進(jìn)行蛋白組學(xué)的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對(duì)蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測(cè)序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征,如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結(jié)果。蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動(dòng)物,細(xì)胞樣品,酵母,微生物.。
為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊(duì)列和大腦區(qū)域,使用 TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個(gè)隊(duì)列的所有組織,為每個(gè)隊(duì)列生成蛋白質(zhì)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),并評(píng)估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個(gè)隊(duì)列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊(duì)列和大腦區(qū)域(圖2b)。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā),建立蛋白共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標(biāo)志物,并為治療帶來希望。歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。江蘇蛋白組學(xué)平臺(tái)建設(shè)
蛋白組學(xué)常見研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物。福建蛋白組學(xué)研究
作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果。總的來說,組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的組合可以提高預(yù)測(cè)和診斷DKD的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學(xué)的生物標(biāo)志物可用于DKD的預(yù)警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數(shù)據(jù)資源。福建蛋白組學(xué)研究
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