單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的另一應(yīng)用領(lǐng)域是發(fā)現(xiàn)亞細(xì)胞成分的基因表達(dá)譜,例如對(duì)在神經(jīng)元的軸突或樹(shù)突部分特異表達(dá)的基因的轉(zhuǎn)錄組的分析,這些基因往往對(duì)細(xì)胞的生物學(xué)功能發(fā)揮著重要作用。但是,鑒于目前的技術(shù)手段,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序仍然存在覆蓋率低的弊端,導(dǎo)致除mRNA以 外的長(zhǎng)非編碼RNAs難以檢測(cè),并且不能區(qū)分正義鏈與反義鏈。但隨著技術(shù)的發(fā)展這些局限性會(huì)被逐步優(yōu)化和改進(jìn)。歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部致力于為廣大科研工作者提供周到、貼心、專(zhuān)業(yè)的技術(shù)服務(wù),專(zhuān)注于以客戶的口碑鑄就品牌形象。目前大家關(guān)注較多的是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),單細(xì)胞層面多組學(xué)。青海包含什么單細(xì)胞測(cè)序(5)成本高動(dòng)輒幾萬(wàn)的成本在一定程度上限制了單細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)用。當(dāng)...
單細(xì)胞技術(shù)光明的前景也催生了國(guó)內(nèi)諸多科技創(chuàng)新型企業(yè)角逐單細(xì)胞市場(chǎng)。像成立于 18 年的新格元,致力于開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)便可靠的單細(xì)胞組學(xué)技術(shù),擁有自主產(chǎn)權(quán)的儀器,試劑和生物信息分析軟件等整體解決方案。也獲得了多家資本方的青睞。15 年成立的尋因生物,也自主開(kāi)發(fā)了高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序試劑盒,加速推動(dòng)了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用。萬(wàn)乘基因也建立了自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的設(shè)備,試劑和分析平臺(tái),不久即將市場(chǎng)化推廣??;萆锸菫閿?shù)不多的將單細(xì)胞技術(shù)走向臨床的公司之一,其開(kāi)發(fā)出的單細(xì)胞分選設(shè)備已獲得臨床醫(yī)療器械注冊(cè)。來(lái)自哈佛團(tuán)隊(duì)的墨卓生物也開(kāi)發(fā)出了高通量單細(xì)胞測(cè)序系統(tǒng),基于分析標(biāo)簽和授權(quán)的油包水技術(shù),實(shí)現(xiàn)了高效率的細(xì)胞捕獲...
在這個(gè)飛速發(fā)展的測(cè)序時(shí)代,DNA和RNA測(cè)序已經(jīng)逐漸成為“實(shí)驗(yàn)室中的家常菜”。若要評(píng)選出目前很受歡迎的一道菜,那恐怕非單細(xì)胞RNA測(cè)序莫屬。以往,研究人員通常利用RNA測(cè)序(RNA-seq)來(lái)檢測(cè)樣本中的所有RNA轉(zhuǎn)錄本,以發(fā)現(xiàn)新型RNA,或開(kāi)展基因表達(dá)分析。不過(guò),測(cè)序的對(duì)象往往是組織樣本或細(xì)胞群,這使得細(xì)胞之間的差異有可能被平均值所掩蓋。自2013年被《Nature Methods》評(píng)為年度技術(shù)以來(lái),這項(xiàng)技術(shù)正被迅速地采用,發(fā)表文獻(xiàn)的數(shù)量也在逐年遞增。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)業(yè)已成為生命科學(xué)研究的基礎(chǔ)技術(shù)手段,為人們理解生命現(xiàn)象背后的機(jī)制提供了數(shù)據(jù)。山東有什么單細(xì)胞測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個(gè)...
單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個(gè)細(xì)胞 RNA 含量很少,擴(kuò)增和捕獲效率的微小變化,就可能在細(xì)胞間產(chǎn)生與生物學(xué)無(wú)關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本,可能會(huì)因?yàn)榧兇獾募夹g(shù)原因而不盡相同,矯正和過(guò)矯正也仍是數(shù)據(jù)處理中非常棘手的一件事情。動(dòng)輒幾萬(wàn)的成本在一定程度上限制了單細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)用。當(dāng)前主流的技術(shù)還是以國(guó)外技術(shù)為主,不過(guò)隨著國(guó)內(nèi)單細(xì)胞儀器公司的研發(fā)推進(jìn),在不久的將來(lái),單細(xì)胞測(cè)序的價(jià)格一定會(huì)有大幅的下降,會(huì)讓更多的科研工作者使用到單細(xì)胞技術(shù),推動(dòng)生命科學(xué)研究。高通量單細(xì)胞Chromium X儀器系列的投入使用,勢(shì)必給單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展注入新動(dòng)力...
2021 年 1 月,山東大學(xué)齊魯醫(yī)院泌尿外科李巖老師發(fā)表了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜和上皮亞群分化特征的相關(guān)成果,文章的 10x Genomics 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)和分析工作由歐易生物提供。該研究對(duì)小鼠的膀胱上皮進(jìn)行了高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,繪制了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜,發(fā)現(xiàn)了一種可能與宿主反應(yīng)和傷口愈合有關(guān)的新型 Plxna4+ 膀胱尿路上皮細(xì)胞,以及一群由 ASPM 標(biāo)記的基底樣細(xì)胞,可能是膀胱尿路上皮祖細(xì)胞。通過(guò) SCENIC 分析確定了調(diào)控尿路上皮細(xì)胞分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)了膀胱疾病相關(guān)調(diào)控基因在不同尿路上皮細(xì)胞亞群中存在差異表達(dá)。該研究解析了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞的特征,為膀胱...
單細(xì)胞測(cè)序自2013年被《Nature Methods》評(píng)為年度技術(shù)以來(lái),這項(xiàng)技術(shù)正被迅速地采用,是目前火熱的技術(shù)之一。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)業(yè)已成為生命科學(xué)研究的基礎(chǔ)技術(shù)手段,為人們理解生命現(xiàn)象背后的機(jī)制提供了數(shù)據(jù)。自公司推出單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)服務(wù)以來(lái),逐步得到了廣大客戶的認(rèn)可與采納。歐易生物是國(guó)內(nèi)較早開(kāi)展單細(xì)胞測(cè)序分析的公司之一。目前擁有10x Genomics及BD Rhapsody兩個(gè)單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),以及完整、系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析技術(shù)和流程。除了能夠進(jìn)行常規(guī)的scRNA-seq(single-cell RNA sequencing),還能夠進(jìn)行凍存樣本的snRNA-seq(single-nucle...
h5Seurat 文件格式是專(zhuān)門(mén)為存儲(chǔ)和分析多模態(tài)單細(xì)胞和空間表達(dá)數(shù)據(jù)而設(shè)計(jì)的,比如 CITE-seq 或 10X Visium 技術(shù)。它能夠保存所有分子信息和相關(guān)描述的數(shù)據(jù),包括降維信息、空間坐標(biāo)以及細(xì)胞群標(biāo)簽等。HDF 是用于存儲(chǔ)和分發(fā)科學(xué)數(shù)據(jù)的一種自我描述、多對(duì)象文件格式。HDF 由美國(guó)國(guó)家超級(jí)計(jì)算應(yīng)用中心(NCSA)創(chuàng)建,以滿足不同群體的科學(xué)家在不同工程項(xiàng)目領(lǐng)域之需要。后來(lái)由一個(gè)非盈利組織 HDF Group 支持,其版本包括了 HDF4 和現(xiàn)在大量使用的 HDF5。高通量單細(xì)胞技術(shù)的確是一個(gè)具有劃時(shí)代意義的技術(shù)。西藏介紹單細(xì)胞測(cè)序產(chǎn)品單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析主要用于在全基因組范圍內(nèi)挖掘基...
研究者利用特異性的PD-L1抑制劑——阿特珠單抗(atezolizumab),對(duì)產(chǎn)生耐藥性的患者進(jìn)行***,取得了很好的效果,臨床表現(xiàn)顯示**逐漸縮小。該研究為利用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)開(kāi)展精細(xì)的臨床***提供了新的思路和方案,顯示出單細(xì)胞測(cè)序可以作為**的檢測(cè)手段,為臨床***方案的確定提供詳細(xì)的信息,幫助醫(yī)生確定更具針對(duì)性的方案,以取得更加良好的***效果。這一研究再次印證了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)在未來(lái)的精細(xì)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的巨大應(yīng)用潛力,將幫助醫(yī)生開(kāi)展更有效的***,為患者帶來(lái)新的希望。單細(xì)胞技術(shù)光明的前景也催生了國(guó)內(nèi)諸多科技創(chuàng)新型企業(yè)角逐單細(xì)胞市場(chǎng)。江西單細(xì)胞測(cè)序活動(dòng)(5)成本高動(dòng)輒幾萬(wàn)的成本在一定程度上限制...
過(guò)去 5 年里,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究,讓科研人員以更廣的維度來(lái)研究生命的本質(zhì)。隨著 2013 年單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)被 Nature Methods 雜志評(píng)選為年度技術(shù);2019 年單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)再次被 Nature Methods 雜志評(píng)選為年度技術(shù)。進(jìn)一步說(shuō)明單細(xì)胞測(cè)序未來(lái)在基礎(chǔ)科研乃至醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等各個(gè)應(yīng)用研究領(lǐng)域具有無(wú)限的潛力,將是未來(lái)科學(xué)發(fā)展的重要方向。單細(xì)胞技術(shù)光明的前景也催生了國(guó)內(nèi)諸多科技創(chuàng)新型企業(yè)角逐單細(xì)胞市場(chǎng)。當(dāng)前主流的單細(xì)胞技術(shù)都集中在轉(zhuǎn)錄層面上,其實(shí)單細(xì)胞蛋白組,單細(xì)胞代謝組等都是生命科學(xué)研究等重要內(nèi)容。云南單細(xì)胞測(cè)序費(fèi)用2021年3月3...
本研究為通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)進(jìn)行精細(xì)***提供了一個(gè)經(jīng)典范例,顯示出單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)未來(lái)在臨床檢測(cè)、確定***方案等方面的巨大應(yīng)用前景。細(xì)胞是生命活動(dòng)的基本功能單位。不同類(lèi)型細(xì)胞之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)成了生命的基礎(chǔ)。研究對(duì)象的這一“基本屬性”決定了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是我們解析各種生命現(xiàn)象、揭示各種病理學(xué)機(jī)制的**強(qiáng)有力的技術(shù)手段。這一領(lǐng)域的進(jìn)展必將為基礎(chǔ)研究以及臨床研究、乃至工程學(xué)應(yīng)用帶來(lái)全新的手段和方法,為我們攻克各種疾病提供新的技術(shù),為人類(lèi)健康與發(fā)展帶來(lái)福祉。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)業(yè)已成為生命科學(xué)研究的基礎(chǔ)技術(shù)手段,為人們理解生命現(xiàn)象背后的機(jī)制提供了數(shù)據(jù)。江西單細(xì)胞測(cè)序多少錢(qián)過(guò)去 5 年里,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù),其原理是將多細(xì)胞生物分離的單個(gè)細(xì)胞中微量的轉(zhuǎn)錄組mRNA 通過(guò)高效擴(kuò)增后再進(jìn)行高通量測(cè)序。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能夠有效解決組織樣本無(wú)法**的細(xì)胞異質(zhì)性難題以及常規(guī)RNA-seq 被掩蓋的細(xì)胞群內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性難題,有助于發(fā)現(xiàn)新的稀有細(xì)胞類(lèi)型,并深入了解發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。近年來(lái),已有多種單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)及平臺(tái)應(yīng)用而生。其中,基于微流控技術(shù)的平臺(tái)通量有限,基于板型技術(shù)的平臺(tái)有耗時(shí)的熒光***細(xì)胞分選過(guò)程,近來(lái)基于液滴技術(shù)的平臺(tái)的10xGenomi...
子宮腺肌癥(AM)是常見(jiàn)的良性慢性婦科疾病,目前對(duì)于這種疾病的確切發(fā)病機(jī)制尚不清楚。單細(xì)胞 RNA 測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)可以揭示罕見(jiàn)的亞群,探索遺傳和功能的異質(zhì)性,并揭示每個(gè)細(xì)胞的獨(dú)特性。因此,本文作者利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在單細(xì)胞水平上識(shí)別異位病變和正位子宮內(nèi)膜之間的基因表達(dá)模式的變化,并探索一種潛在的新的 AM 發(fā)病機(jī)制。本文單細(xì)胞測(cè)序和分析部分由歐易生物提供技術(shù)支持。抑制 EET 和 VM 形成可能是一種潛在的預(yù)防 AM 的策略。本文為后人對(duì) AM 的探究提供重要參考價(jià)值。當(dāng)前主流的單細(xì)胞技術(shù)都集中在轉(zhuǎn)錄層面上,其實(shí)單細(xì)胞蛋白組,單細(xì)胞代謝組等都是生命科學(xué)研究等重要內(nèi)容。四川...
2021年12月,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院楊倩教授及生命科學(xué)學(xué)院林建副教授,于Cell&Bioscience(IF:7.133) 在線發(fā)表了IBDV ***雞法氏囊的單細(xì)胞測(cè)序的***研究成果。研究工作內(nèi)容的主要承擔(dān)者為Abid Ullah Shah博士。歐易生物提供高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(10x Genoimics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序)技術(shù)支持。該研究從雞傳染性法氏囊病毒的鼻腔***入手,一方面***闡述了IBDV 通過(guò)雞鼻腔傳播至法氏囊的傳播途徑及病毒***主要靶細(xì)胞;另一方面,研究初步闡明家禽細(xì)胞應(yīng)用RNAi抵抗IBDV的分子機(jī)制,為高效防控家禽RNA病毒奠定理論基礎(chǔ)。國(guó)內(nèi)從事單細(xì)胞技術(shù)開(kāi)發(fā)...
子宮腺肌癥(AM)是常見(jiàn)的良性慢性婦科疾病,目前對(duì)于這種疾病的確切發(fā)病機(jī)制尚不清楚。單細(xì)胞 RNA 測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)可以揭示罕見(jiàn)的亞群,探索遺傳和功能的異質(zhì)性,并揭示每個(gè)細(xì)胞的獨(dú)特性。因此,本文作者利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在單細(xì)胞水平上識(shí)別異位病變和正位子宮內(nèi)膜之間的基因表達(dá)模式的變化,并探索一種潛在的新的 AM 發(fā)病機(jī)制。本文單細(xì)胞測(cè)序和分析部分由歐易生物提供技術(shù)支持。抑制 EET 和 VM 形成可能是一種潛在的預(yù)防 AM 的策略。本文為后人對(duì) AM 的探究提供重要參考價(jià)值。早期受技術(shù)限制,單細(xì)胞層面的研究往往***在單個(gè)細(xì)胞或者微量群體細(xì)胞水平,能夠檢測(cè)到的信息相對(duì)有限。廣東...
子宮內(nèi)膜異位癥是一種常見(jiàn)的、良性的婦科疾病,與盆腔疼痛和不孕有關(guān),其特征是異位子宮內(nèi)膜樣組織常被月經(jīng)周期***改變。該病影響全球6% - 10%的女性人口,主要是育齡女性。此外,其高度可變的癥狀使診斷具有挑戰(zhàn)性,經(jīng)常導(dǎo)致誤診。目前尚無(wú)有效的***措施,主要原因是其病因和發(fā)病機(jī)制尚不明確。本研究作者通過(guò)scRNA-seq技術(shù)進(jìn)行分析,從包括來(lái)自子宮內(nèi)膜異位癥女性的異位子宮內(nèi)膜、正位子宮內(nèi)膜和來(lái)自健康女性的正常子宮內(nèi)膜三組樣本中提取了大約55,000個(gè)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以創(chuàng)建一個(gè)子宮內(nèi)膜異位癥的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜。單細(xì)胞測(cè)序自2013年被《Nature Methods》評(píng)為年度技術(shù)以來(lái)這項(xiàng)技術(shù)正被迅...
肝*是全球**相關(guān)死亡的第四大原因,肝細(xì)胞*(HCC)是肝*的主要形式。目前對(duì)于肝*的***手段通常是手術(shù)切除,但較高的術(shù)后復(fù)發(fā)率降低了患者的生存率,尤其是術(shù)后 2 年內(nèi)的早期復(fù)發(fā)占整體 HCC 復(fù)發(fā)病例的 70%。本研究中作者通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)υl(fā)及早期復(fù)發(fā)性 HCC 患者的**微環(huán)境進(jìn)行深入探索,試圖發(fā)現(xiàn)更有效的***策略。 材料:原發(fā)及早期復(fù)發(fā)性肝細(xì)胞***及配對(duì)*旁組織 期刊:Cell 方法:MIRALCS, 10x Genomics 影響因子:38.635 研究目的:描述原發(fā)及早期復(fù)發(fā)性 HCC **微環(huán)境特征。經(jīng)單細(xì)胞測(cè)序及生信分析顯示,對(duì)照組較實(shí)驗(yàn)組的應(yīng)激基因表達(dá)有明顯的升高...
單細(xì)胞懸液制備難于標(biāo)準(zhǔn)化。 基于酶學(xué)的樣本處理方法,大都會(huì)存在一定程度的解離偏好性,即不同的酶處理不同的組織往往會(huì)有不太一樣的「效果」,而這種效果不僅*反應(yīng)在細(xì)胞得率,細(xì)胞活性和細(xì)胞碎片等參數(shù)上,往往也會(huì)在**終細(xì)胞類(lèi)型有所反映,比如可能會(huì)導(dǎo)致部分稀有細(xì)胞的丟失,細(xì)胞比例的失真等,從而偏離組織的真實(shí)狀態(tài)。另外,細(xì)胞懸液的制備過(guò)程較長(zhǎng),通常需要3-5小時(shí),這個(gè)過(guò)程會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞處于「應(yīng)激狀態(tài)」中,轉(zhuǎn)錄的過(guò)程可能已經(jīng)發(fā)生變化,偏離臨床實(shí)驗(yàn)的終點(diǎn)設(shè)計(jì),會(huì)對(duì)結(jié)果的判斷造成一定的影響。針對(duì)如上問(wèn)題,歐易團(tuán)隊(duì)從已發(fā)表的高影響力的文獻(xiàn)中,匯總出針對(duì)不同類(lèi)型組織的處理方法,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果與文獻(xiàn)并軌(同頻)...
2021 年 1 月,山東大學(xué)齊魯醫(yī)院泌尿外科李巖老師發(fā)表了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜和上皮亞群分化特征的相關(guān)成果,文章的 10x Genomics 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)和分析工作由歐易生物提供。該研究對(duì)小鼠的膀胱上皮進(jìn)行了高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,繪制了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜,發(fā)現(xiàn)了一種可能與宿主反應(yīng)和傷口愈合有關(guān)的新型 Plxna4+ 膀胱尿路上皮細(xì)胞,以及一群由 ASPM 標(biāo)記的基底樣細(xì)胞,可能是膀胱尿路上皮祖細(xì)胞。通過(guò) SCENIC 分析確定了調(diào)控尿路上皮細(xì)胞分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)了膀胱疾病相關(guān)調(diào)控基因在不同尿路上皮細(xì)胞亞群中存在差異表達(dá)。該研究解析了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞的特征,為膀胱...
單細(xì)胞生物學(xué)**近幾年是非常熱門(mén)的研究方向。在這一領(lǐng)域中,**前沿的則是單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)。傳統(tǒng)測(cè)序方法一次處理成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,得到的變異水平也是成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的平均后水平。但是,就如同世界上沒(méi)有完全相同的兩片樹(shù)葉一樣,沒(méi)有兩個(gè)細(xì)胞是完全相同的。所以,單細(xì)胞測(cè)序?qū)τ谘芯繂蝹€(gè)細(xì)胞就顯得至關(guān)重要。單細(xì)胞測(cè)序可以揭示出每個(gè)細(xì)胞獨(dú)特的微妙變化,甚至可以揭示全新的細(xì)胞類(lèi)型。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可謂是科技發(fā)展史上的一大創(chuàng)舉,它極大地推進(jìn)了基因組學(xué)領(lǐng)域,使不同細(xì)胞類(lèi)型得以精細(xì)區(qū)分,使得科學(xué)家們?cè)趩渭?xì)胞水平進(jìn)行分子機(jī)制研究成為可能。歐易生物重磅推出?單細(xì)胞測(cè)序用動(dòng)物組織細(xì)胞懸液制備試劑盒?,助你快速獲得高質(zhì)量的單細(xì)胞懸...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù),其原理是將多細(xì)胞生物分離的單個(gè)細(xì)胞中微量的轉(zhuǎn)錄組mRNA 通過(guò)高效擴(kuò)增后再進(jìn)行高通量測(cè)序。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能夠有效解決組織樣本無(wú)法**的細(xì)胞異質(zhì)性難題以及常規(guī)RNA-seq 被掩蓋的細(xì)胞群內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性難題,有助于發(fā)現(xiàn)新的稀有細(xì)胞類(lèi)型,并深入了解發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。近年來(lái),已有多種單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)及平臺(tái)應(yīng)用而生。其中,基于微流控技術(shù)的平臺(tái)通量有限,基于板型技術(shù)的平臺(tái)有耗時(shí)的熒光***細(xì)胞分選過(guò)程,近來(lái)基于液滴技術(shù)的平臺(tái)的10xGenomi...
h5Seurat 文件格式是專(zhuān)門(mén)為存儲(chǔ)和分析多模態(tài)單細(xì)胞和空間表達(dá)數(shù)據(jù)而設(shè)計(jì)的,比如 CITE-seq 或 10X Visium 技術(shù)。它能夠保存所有分子信息和相關(guān)描述的數(shù)據(jù),包括降維信息、空間坐標(biāo)以及細(xì)胞群標(biāo)簽等。HDF 是用于存儲(chǔ)和分發(fā)科學(xué)數(shù)據(jù)的一種自我描述、多對(duì)象文件格式。HDF 由美國(guó)國(guó)家超級(jí)計(jì)算應(yīng)用中心(NCSA)創(chuàng)建,以滿足不同群體的科學(xué)家在不同工程項(xiàng)目領(lǐng)域之需要。后來(lái)由一個(gè)非盈利組織 HDF Group 支持,其版本包括了 HDF4 和現(xiàn)在大量使用的 HDF5。真正實(shí)現(xiàn)技術(shù)國(guó)產(chǎn)化,大幅降低成本,加速科研向臨床的轉(zhuǎn)化,讓單細(xì)胞技術(shù)為生命健康服務(wù)。甘肅單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)費(fèi)食管鱗狀細(xì)胞...
歐易生物是國(guó)內(nèi)少數(shù)具備10×Genomics和BD RhapsodyTM單細(xì)胞測(cè)序雙平臺(tái)的機(jī)構(gòu)之一,在醫(yī)學(xué)和農(nóng)林方向提供專(zhuān)業(yè)的單細(xì)胞建庫(kù)測(cè)序及分析服務(wù),包括5’端和3’端基因表達(dá)分析、免疫組庫(kù)分析(TCR/BCR)、ATAC分析和表面蛋白分析等。歐易生物單細(xì)胞平臺(tái)具有豐富的項(xiàng)目處理經(jīng)驗(yàn),每年成功處理單細(xì)胞樣本上千例;專(zhuān)業(yè)的售后團(tuán)隊(duì),數(shù)十位生信**和研發(fā)工程師為您的項(xiàng)目保駕護(hù)航;優(yōu)化課題設(shè)計(jì),解讀數(shù)據(jù),讓客戶感受有“溫度的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)服務(wù)。 當(dāng)下,單細(xì)胞測(cè)序是研究**火的技術(shù)手段之一,尤其是在**學(xué)、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)、再生醫(yī)學(xué)和精細(xì)醫(yī)療方向。重慶單細(xì)胞測(cè)序銷(xiāo)售價(jià)格復(fù)雜的生物系統(tǒng)由單個(gè)細(xì)胞的協(xié)同功...
單細(xì)胞RNA-seq能夠**地提供每個(gè)細(xì)胞的RNA表達(dá)譜,并鑒定異質(zhì)細(xì)胞群中的稀有細(xì)胞。盡管**異質(zhì)性可歸因于累積突變,但即使是遺傳上相同的細(xì)胞在相同環(huán)境下也可能表現(xiàn)出基因和蛋白表達(dá)水平的差異,從而導(dǎo)致耐藥性的產(chǎn)生。單細(xì)胞RNA-seq就能夠發(fā)現(xiàn)這些稀有個(gè)體。當(dāng)然,單細(xì)胞RNA-seq的開(kāi)展絕非易事,需要用到一系列前列技術(shù)。大家首先要高效分離單細(xì)胞,然后進(jìn)行RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄、文庫(kù)制備和測(cè)序,***再通過(guò)生物信息學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。高通量單細(xì)胞Chromium X儀器系列的投入使用,勢(shì)必給單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展注入新動(dòng)力,提速了科研研究進(jìn)程。內(nèi)蒙古是什么單細(xì)胞測(cè)序(4)分析的個(gè)性化與標(biāo)準(zhǔn)化伴隨越...
由于每個(gè)單細(xì)胞都是獨(dú)特的,不可能開(kāi)展重復(fù)實(shí)驗(yàn)并評(píng)估噪音。因此,必須采取一些質(zhì)量控制手段,以確保數(shù)據(jù)的可靠性。**建議,向每個(gè)細(xì)胞裂解液中加入已知序列和數(shù)量的合成mRNA,如外源RNA對(duì)照聯(lián)盟(ERCC)開(kāi)發(fā)的加標(biāo)RNA。這些RNA的讀數(shù)將提供樣本間差異的信息。總的來(lái)說(shuō),單細(xì)胞水平的轉(zhuǎn)錄組分析可以揭示細(xì)胞群體中的細(xì)胞異質(zhì)性,強(qiáng)調(diào)了個(gè)別細(xì)胞的與眾不同。此外,同時(shí)分析多種分子(如DNA、RNA和蛋白質(zhì))的方法也不斷被開(kāi)發(fā)出來(lái)。這種更***的單細(xì)胞組圖有望進(jìn)一步加深我們對(duì)生物學(xué)過(guò)程的了解,對(duì)未來(lái)的科研及臨床研究大有裨益。隨著空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的出現(xiàn),獲得了組織空間維度的表達(dá)圖譜,完成了組織空間異質(zhì)性的分析...
inferCNV 是一款 R 包,用來(lái)探索**單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中體細(xì)胞大規(guī)模染色體拷貝數(shù)變異,例如整個(gè)染色體或大片段染色體的擴(kuò)增(gain)或缺失(loss)。通過(guò)與一組參考的“正常”細(xì)胞比較,探索**基因組不同位置的基因表達(dá)強(qiáng)度來(lái)實(shí)現(xiàn)。通過(guò)熱圖顯示每條染色體上的相對(duì)表達(dá)強(qiáng)度,在以正常細(xì)胞作為參考的情況下可以直觀地判斷**基因組上的哪些區(qū)域是過(guò)表達(dá)和低表達(dá)。為了提高推斷結(jié)果的可靠性,inferCNV 采用幾種 residual expression 過(guò)濾方法減少數(shù)據(jù)中噪聲信號(hào),從而發(fā)現(xiàn)真正的 CNV 的信號(hào)。過(guò)去 5 年里,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究。寧夏單細(xì)...
單細(xì)胞技術(shù)已經(jīng)應(yīng)用于研究機(jī)體各個(gè)***和組織的發(fā)育和疾病機(jī)理。目前大家關(guān)注較多的是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),單細(xì)胞層面多組學(xué),如基因組、表觀組、蛋白組和代謝組等目前還存在一定的瓶頸,未來(lái)技術(shù)和設(shè)備的升級(jí),勢(shì)必會(huì)擴(kuò)大單細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)用范圍。單細(xì)胞測(cè)序也是實(shí)現(xiàn)精細(xì)醫(yī)療的重要工具。在解答**異質(zhì)性,**免疫***,如發(fā)現(xiàn)/確認(rèn)新的靶點(diǎn)等方面可以提供很大幫助。單細(xì)胞在許多領(lǐng)域都占有一席之地,對(duì)于**早期的診斷、追蹤以及個(gè)體化***具有重要意義。2.作為國(guó)內(nèi)首批引入Chromium X平臺(tái)的公司,歐易生物的百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞研究Chromium X 儀器正式落地。陜西單細(xì)胞測(cè)序歡迎來(lái)電腸道的自主調(diào)節(jié)需要腸神經(jīng)系統(tǒng)(ENS...
單細(xì)胞生物學(xué)**近幾年是非常熱門(mén)的研究方向。在這一領(lǐng)域中,**前沿的則是單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)。傳統(tǒng)測(cè)序方法一次處理成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,得到的變異水平也是成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的平均后水平。但是,就如同世界上沒(méi)有完全相同的兩片樹(shù)葉一樣,沒(méi)有兩個(gè)細(xì)胞是完全相同的。所以,單細(xì)胞測(cè)序?qū)τ谘芯繂蝹€(gè)細(xì)胞就顯得至關(guān)重要。單細(xì)胞測(cè)序可以揭示出每個(gè)細(xì)胞獨(dú)特的微妙變化,甚至可以揭示全新的細(xì)胞類(lèi)型。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可謂是科技發(fā)展史上的一大創(chuàng)舉,它極大地推進(jìn)了基因組學(xué)領(lǐng)域,使不同細(xì)胞類(lèi)型得以精細(xì)區(qū)分,使得科學(xué)家們?cè)趩渭?xì)胞水平進(jìn)行分子機(jī)制研究成為可能。除了能夠進(jìn)行常規(guī)的scRNA-seq,還能夠進(jìn)行凍存樣本的snRNA-seq,為各種類(lèi)型...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的另一應(yīng)用領(lǐng)域是發(fā)現(xiàn)亞細(xì)胞成分的基因表達(dá)譜,例如對(duì)在神經(jīng)元的軸突或樹(shù)突部分特異表達(dá)的基因的轉(zhuǎn)錄組的分析,這些基因往往對(duì)細(xì)胞的生物學(xué)功能發(fā)揮著重要作用。但是,鑒于目前的技術(shù)手段,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序仍然存在覆蓋率低的弊端,導(dǎo)致除mRNA以 外的長(zhǎng)非編碼RNAs難以檢測(cè),并且不能區(qū)分正義鏈與反義鏈。但隨著技術(shù)的發(fā)展這些局限性會(huì)被逐步優(yōu)化和改進(jìn)。歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部致力于為廣大科研工作者提供周到、貼心、專(zhuān)業(yè)的技術(shù)服務(wù),專(zhuān)注于以客戶的口碑鑄就品牌形象。除了能夠進(jìn)行常規(guī)的scRNA-seq,還能夠進(jìn)行凍存樣本的snRNA-seq,為各種類(lèi)型生物樣本提供解決方案。廣東按需求單細(xì)胞測(cè)序(4)分析...
歐易生物單細(xì)胞測(cè)序近期高分文章不斷,在接下來(lái)的幾篇單細(xì)胞文獻(xiàn)解讀軟文里,我們將為大家持續(xù)送上近期合作發(fā)表的單細(xì)胞文獻(xiàn)解讀。本篇文章為大家解讀今年5月由上海交通大學(xué)附屬上海市第一人民醫(yī)院劉堃團(tuán)隊(duì)在Diabetes(IF9.461)期刊發(fā)表的關(guān)于2型糖尿病小鼠視網(wǎng)膜組織的分子圖譜和異質(zhì)性的相關(guān)成果。 材料:3只2型糖尿病模型小鼠(db/db);3只對(duì)照小鼠(db/m)的視網(wǎng)膜組織 期刊:Diabetes 發(fā)表時(shí)間:2021年5月 方法:歐易生物10xGenomicsscRNA-seq 早期受技術(shù)限制,單細(xì)胞層面的研究往往***在單個(gè)細(xì)胞或者微量群體細(xì)胞水平,能夠檢測(cè)到的...
歐易生物是國(guó)內(nèi)少數(shù)具備10×Genomics和BD RhapsodyTM單細(xì)胞測(cè)序雙平臺(tái)的機(jī)構(gòu)之一,在醫(yī)學(xué)和農(nóng)林方向提供專(zhuān)業(yè)的單細(xì)胞建庫(kù)測(cè)序及分析服務(wù),包括5’端和3’端基因表達(dá)分析、免疫組庫(kù)分析(TCR/BCR)、ATAC分析和表面蛋白分析等。歐易生物單細(xì)胞平臺(tái)具有豐富的項(xiàng)目處理經(jīng)驗(yàn),每年成功處理單細(xì)胞樣本上千例;專(zhuān)業(yè)的售后團(tuán)隊(duì),數(shù)十位生信**和研發(fā)工程師為您的項(xiàng)目保駕護(hù)航;優(yōu)化課題設(shè)計(jì),解讀數(shù)據(jù),讓客戶感受有“溫度的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)服務(wù)。 高通量單細(xì)胞Chromium X儀器系列的投入使用,勢(shì)必給單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展注入新動(dòng)力,提速了科研研究進(jìn)程。陜西介紹單細(xì)胞測(cè)序多少錢(qián)2021 年 1...