廣西介紹單細胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-06-28

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在單個細胞水平對mRNA 進行高通量測序的一項新技術(shù),其原理是將多細胞生物分離的單個細胞中微量的轉(zhuǎn)錄組mRNA 通過高效擴增后再進行高通量測序。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序能夠有效解決組織樣本無法**的細胞異質(zhì)性難題以及常規(guī)RNA-seq 被掩蓋的細胞群內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性難題,有助于發(fā)現(xiàn)新的稀有細胞類型,并深入了解發(fā)育過程中的表達調(diào)控機制。近年來,已有多種單細胞測序技術(shù)及平臺應(yīng)用而生。其中,基于微流控技術(shù)的平臺通量有限,基于板型技術(shù)的平臺有耗時的熒光***細胞分選過程,近來基于液滴技術(shù)的平臺的10xGenomics 憑借其單次成千上萬的細胞通量、周期短及成本低成為目前主流的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序平臺。單細胞蛋白組和代謝組受制于質(zhì)譜儀器的靈敏度,目前還存在一定的難度。廣西介紹單細胞測序

過去 5 年里,單細胞測序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究,讓科研人員以更廣的維度來研究生命的本質(zhì)。隨著 2013 年單細胞測序技術(shù)被 Nature Methods 雜志評選為年度技術(shù);2019 年單細胞多組學(xué)技術(shù)再次被 Nature Methods 雜志評選為年度技術(shù)。進一步說明單細胞測序未來在基礎(chǔ)科研乃至醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等各個應(yīng)用研究領(lǐng)域具有無限的潛力,將是未來科學(xué)發(fā)展的重要方向。國內(nèi)從事單細胞技術(shù)開發(fā)的團隊還有很多,相信不久的將來,單細胞市場不再是以歐美的技術(shù)為主導(dǎo),真正實現(xiàn)技術(shù)國產(chǎn)化,大幅降低成本,惠及更多科科學(xué)研究,加速科研向臨床的轉(zhuǎn)化,讓單細胞技術(shù)為生命健康服務(wù)。四川介紹單細胞測序活動10.目前認知下的制備單細胞懸液需要將組織置于37℃保溫,以便蛋白酶發(fā)揮作用。

單細胞測序的作用:一、在傳統(tǒng)的研究方法中,我們往往根據(jù)標記基因和細胞形態(tài)來區(qū)分不同細胞類型,而這種方法無可厚非的存在很多爭議。而單細胞測序技術(shù)可以更精細無偏倚的來對細胞進行分群。尤其是對免疫學(xué),**學(xué),遺傳學(xué)的研究將會帶來巨大影響。二、分析稀有的細胞,特別是特定時空環(huán)境下的細胞。比如從環(huán)境中取樣的微生物等。三、臨床上,對體外受精胚胎進行植入前的篩查。 單細胞在許多領(lǐng)域都占有一席之地,對于**早期的診斷、追蹤以及個體化***具有重要意義。

歐易單細胞測序繼續(xù)發(fā)力!近日,歐易生物合作客戶浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院林俊教授、馬俊彥老師、張麗琪博士團隊在Cell bioscience(IF 7.133)期刊發(fā)表題為Single-cell transcriptomic analysis of endometriosis provides insights into fibroblast fates and immune cell heterogeneity的研究結(jié)果,揭示了子宮內(nèi)膜異位癥病因和病理特征。歐易生物提供了該項目單細胞轉(zhuǎn)錄組實驗及測序相關(guān)工作。歡迎有意向開展單細胞測序研究的老師們向我們咨詢溝通單細胞相關(guān)問題。目前已在動物組織單細胞測序中有所應(yīng)用,那么能不能把轉(zhuǎn)錄抑制劑也應(yīng)用于植物原生質(zhì)體解離及測序中呢?

在這個飛速發(fā)展的測序時代,DNA和RNA測序已經(jīng)逐漸成為“實驗室中的家常菜”。若要評選出目前很受歡迎的一道菜,那恐怕非單細胞RNA測序莫屬。以往,研究人員通常利用RNA測序(RNA-seq)來檢測樣本中的所有RNA轉(zhuǎn)錄本,以發(fā)現(xiàn)新型RNA,或開展基因表達分析。不過,測序的對象往往是組織樣本或細胞群,這使得細胞之間的差異有可能被平均值所掩蓋。自2013年被《Nature Methods》評為年度技術(shù)以來,這項技術(shù)正被迅速地采用,發(fā)表文獻的數(shù)量也在逐年遞增。隨著空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的出現(xiàn),獲得了組織空間維度的表達圖譜,完成了組織空間異質(zhì)性的分析。廣西介紹單細胞測序

單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞 RNA 含量很少,擴增和捕獲效率的微小變化。廣西介紹單細胞測序

2021年12月,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院楊倩教授及生命科學(xué)學(xué)院林建副教授,于Cell&Bioscience(IF:7.133) 在線發(fā)表了IBDV ***雞法氏囊的單細胞測序的***研究成果。研究工作內(nèi)容的主要承擔(dān)者為Abid Ullah Shah博士。歐易生物提供高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(10x Genoimics單細胞轉(zhuǎn)錄組測序)技術(shù)支持。該研究從雞傳染性法氏囊病毒的鼻腔***入手,一方面***闡述了IBDV 通過雞鼻腔傳播至法氏囊的傳播途徑及病毒***主要靶細胞;另一方面,研究初步闡明家禽細胞應(yīng)用RNAi抵抗IBDV的分子機制,為高效防控家禽RNA病毒奠定理論基礎(chǔ)。廣西介紹單細胞測序

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