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01FGFR簡(jiǎn)介及信號(hào)通路成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體(FGFR)是高度保守、***分布的跨膜酪氨酸激酶受體,包括FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4四種受體亞型。成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子(FGF)與FGFR結(jié)合時(shí),受體二聚化,從而引起受體激酶結(jié)構(gòu)域的細(xì)胞內(nèi)磷酸化、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)和基因轉(zhuǎn)錄的級(jí)聯(lián)反應(yīng)[1]。由FGFR***的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路包括RAS–RAF–MAPK,PI3K–AKT,STAT和PLC途徑,它們參與調(diào)控多種生物學(xué)過(guò)程,如***發(fā)育、血管新生、細(xì)胞增殖、遷移、抗凋亡等(圖1)。圖1FGFR信號(hào)通路[2-4]當(dāng)FGFR發(fā)生突變或者過(guò)表達(dá)時(shí),會(huì)引起四個(gè)關(guān)鍵的下游信號(hào)通路的過(guò)度***,并進(jìn)一步誘發(fā)正常細(xì)胞*變:RAS-RAF-MAPK和PI3K-AKT過(guò)度***可分別刺激細(xì)胞增殖與分化及抑制細(xì)胞凋亡;SATA與促進(jìn)**侵襲和轉(zhuǎn)移,****逃逸能力密切相關(guān);PLCγ信號(hào)通路則是**細(xì)胞轉(zhuǎn)移調(diào)控的重要途徑。 邁杰基于基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、細(xì)胞組學(xué)及病理組學(xué)等綜合性轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)平臺(tái),豐富的伴隨診斷開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn)。福建提供邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)來(lái)電咨詢
于是,每個(gè)反應(yīng)會(huì)產(chǎn)生許多不同長(zhǎng)度的DN**段,并在模版的任一核苷酸位置上由其中一種雙脫氧核糖核苷酸終止鏈的延伸。反應(yīng)混合物可以通過(guò)手動(dòng)灌膠或自動(dòng)灌膠到用毛細(xì)管進(jìn)入測(cè)序機(jī)器,再根據(jù)DNA分子大小不同用電泳分離DNA。當(dāng)DNA流過(guò)凝膠后,DNA序列可以通過(guò)雙脫氧核糖核苷酸上發(fā)出的熒光來(lái)進(jìn)行分析。當(dāng)今的Sanger測(cè)序儀使用的是毛細(xì)管自動(dòng)上樣的凝膠電泳,一般可以同時(shí)分析8-96個(gè)系列反應(yīng)。二代測(cè)序系統(tǒng)在十年前就是因其可同時(shí)進(jìn)行大量平行測(cè)序反應(yīng)而廣為人知。這些系統(tǒng)可以同時(shí)分析百萬(wàn)甚至上億個(gè)序列反應(yīng)。雖然不同的機(jī)器生產(chǎn)時(shí)會(huì)在技術(shù)細(xì)節(jié)上有許多不同,但他們都有以下幾個(gè)共同點(diǎn):1,文庫(kù)建立:所有二代測(cè)序的平臺(tái)都需要一個(gè)基因文庫(kù),這個(gè)基因文庫(kù)包含通過(guò)引申或者連接自定義的接頭序列。2,測(cè)序儀器:每個(gè)文庫(kù)片段在共階吸附的DNA連接因子的作用下,以文庫(kù)適配序列為模版,在固體表面上進(jìn)行擴(kuò)增。這步擴(kuò)增會(huì)產(chǎn)生許多DNA蔟,每個(gè)來(lái)源于一個(gè)文庫(kù)片段,每個(gè)基因蔟都會(huì)像**的測(cè)序反應(yīng)一樣起作用。3,數(shù)據(jù)輸出:每個(gè)儀器都會(huì)在測(cè)序結(jié)束后給出原始數(shù)據(jù)。這個(gè)原始數(shù)據(jù)時(shí)每個(gè)基因蔟中形成的DNA序列的**。作者:麗舍咨詢鏈接:源:知乎著作權(quán)歸作者所有。 吉林抗體全邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)共同合作【邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)】一直以來(lái)致力于轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)服務(wù)和伴隨診斷產(chǎn)品開(kāi)發(fā)及商業(yè)化。
,構(gòu)建單鏈DNA測(cè)序文庫(kù)。,固體支撐體的每一個(gè)單獨(dú)小空間中只包含一條DNA鏈,之后通過(guò)PCR特異性的將模板DNA進(jìn)行富集,從而達(dá)到測(cè)序所需的模板量。,反應(yīng)試劑清洗和成像捕捉,不斷反復(fù)進(jìn)行此三步循環(huán),每一個(gè)循環(huán)按順序測(cè)定序列中的一個(gè)堿基。第二代測(cè)序技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)第二代測(cè)序技術(shù)的優(yōu)點(diǎn):一次能夠同時(shí)得到大量的序列數(shù)據(jù),相比于一代測(cè)序技術(shù),通量提高了成千上萬(wàn)倍;單條序列成本非常低廉。第二代測(cè)序技術(shù)的缺點(diǎn):序列讀長(zhǎng)較短,Illumina平臺(tái)**長(zhǎng)為250-300bp,454平臺(tái)也只有500bp左右;由于建庫(kù)中利用了PCR富集序列,因此有一些含量較少的序列可能無(wú)法被大量擴(kuò)增,造成一些信息的丟失,且PCR過(guò)程中有一定概率會(huì)引入錯(cuò)配堿基;想要得到準(zhǔn)確和長(zhǎng)度較長(zhǎng)的拼接結(jié)果,需要測(cè)序的覆蓋率較高,導(dǎo)致結(jié)果錯(cuò)誤較多和成本增加。第二代測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用二代測(cè)序是現(xiàn)階段科研市場(chǎng)的主力平臺(tái),主要應(yīng)用包括:基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、群體測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、宏基因組測(cè)序、重測(cè)序等。由于成本較低,二代測(cè)序在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用也十分***,主要包括:**基因組、遺傳病基因組、**與代謝疾病等。
GC-MS(氣相色譜/質(zhì)譜聯(lián)用儀)GC-MS簡(jiǎn)介GC-MS是氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的簡(jiǎn)稱,是將氣相色譜儀與質(zhì)譜儀通過(guò)適當(dāng)接口相結(jié)合,借助計(jì)算機(jī)技術(shù),進(jìn)行聯(lián)用的分析技術(shù)。GC為氣相色譜,流動(dòng)相為惰性氣體,多為氦氣,由進(jìn)樣口、色譜柱和檢測(cè)器三部分構(gòu)成;MS為質(zhì)譜,由離子源、濾質(zhì)器、檢測(cè)器三部分構(gòu)成,廣泛應(yīng)用于純物質(zhì)鑒定。GC-MS因其具有GC的高分辨率和MS的高靈敏度,被廣泛應(yīng)用于復(fù)雜組分的分離與鑒定,是生物樣品中藥物代謝中定性與定量的主要工具。應(yīng)用領(lǐng)域代謝組學(xué)分析藥物分析結(jié)構(gòu)鑒定生物組織蛋白分析物質(zhì)組分鑒定檢測(cè)示例技術(shù)流程送樣須知血清、血漿≥尿液≥動(dòng)物組織≥250mg樣本寄送地址:天津經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)第十三大街37號(hào)逸夫樓225,降老師(收)(具體樣本保存與運(yùn)輸條件請(qǐng)與我們聯(lián)系)我們的優(yōu)勢(shì)1、提供各種實(shí)驗(yàn)材料和儀器,滿足項(xiàng)目課題實(shí)驗(yàn)需要。2、專業(yè)的操作人員。3、高規(guī)格實(shí)驗(yàn)室。4、數(shù)據(jù)結(jié)果交付周期快。5、完善的服務(wù)體系,全程跟進(jìn),確保滿意。咨詢與訂購(gòu)感謝您選擇我們的服務(wù),如果您有任何問(wèn)題,請(qǐng)聯(lián)系我們,我們將竭誠(chéng)為您解答和服務(wù)??头娫挘壕W(wǎng)站:郵箱:market@QQ:一、測(cè)序策略:提取樣品的基因組DNA,檢測(cè)基因組DNA的完整性和濃度。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)建立了符合質(zhì)量體系規(guī)定的覆蓋全平臺(tái)的伴隨診斷產(chǎn)品研發(fā)實(shí)驗(yàn)室、質(zhì)檢實(shí)驗(yàn)室,擁有GSP證書(shū)。
室溫孵育1分鐘。e.孔板再次放上磁力架,等待2分鐘,溶液澄清后,轉(zhuǎn)移上清到新的孔板中。三、第二輪多重PCRa.第二輪特異性引物是普通的PCR擴(kuò)增引物,在其5’端加上測(cè)序接頭5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3’共80個(gè)左右的堿基,其中根據(jù)目標(biāo)區(qū)域設(shè)計(jì)得到的序列長(zhǎng)度是20個(gè)堿基左右,Tm值設(shè)定在60℃,多個(gè)引物混成一個(gè)IP引物池做為第二輪PCR的上游引物。P7的序列:5’-CAAGCAGAAGACGGCATACGAG-3’。配置PCR總體系,按照理論值的125%配制,震蕩混勻,短時(shí)離心。b.孔板放入PCR儀中,選擇MAPlex-2nd程序運(yùn)行2個(gè)小時(shí)。四、PCR產(chǎn)物純化步驟同二,做兩次純化,徹底去除引物二聚體。***次使用28uL的磁珠純化,用20uL的NFW洗脫;第二次用20uL的磁珠純化,用25uL的NFW洗脫。五、電泳鑒定每個(gè)樣品取5uL,進(jìn)行%的瓊脂糖電泳,觀察是否有條帶,以及條帶長(zhǎng)度是否在300-400bp之間。實(shí)施例5.文庫(kù)定量與混合a.將標(biāo)準(zhǔn)品、熒光定量試劑、引物從-20℃取出放置于冰上融化。b.樣品稀釋10000倍,分兩次梯度稀釋。***次取文庫(kù)原液2uL,加入198uL的NFW,振蕩混勻或者用***吹打混勻,短時(shí)離心。再?gòu)闹腥〕?0uL,加入990uLNFW,振蕩混勻或者用***吹打混勻,短時(shí)離心。MSH6抗體試劑 蘇蘇械備20180569號(hào).遼寧抗體全邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)推薦咨詢
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,需將磁珠固定在特制的PTP平板上。這種平板上含有許多直徑約為44μm的小孔,每個(gè)小孔*能容納一個(gè)磁珠,通過(guò)這種方法來(lái)固定每個(gè)磁珠的位置。啟動(dòng)測(cè)序反應(yīng)后,每次向PTP平板中加入一種dNTP,如果能與待測(cè)序列配對(duì),則會(huì)在堿基連接在模板上之后釋放焦磷酸,焦磷酸通過(guò)ATP硫酸化學(xué)酶***熒光素酶產(chǎn)生熒光,通過(guò)PTP板另一側(cè)的CCD照相機(jī)記錄熒光,從而確定目的模板的核酸序列。ABI/SOLiDABI/SOLiD技術(shù)原理SOLiD測(cè)序技術(shù)與454技術(shù)的原理比較類(lèi)似,同樣是采用油包水的方式進(jìn)行EmulsionPCR。不同之處在于SOLiD形成的小水滴要比454系統(tǒng)小得多,只有1μm大小,并且在PCR擴(kuò)增的同時(shí)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物的3'端進(jìn)行修飾,為下一步的測(cè)序做準(zhǔn)備。在PCR完成之后,SOLiD技術(shù)進(jìn)行測(cè)序時(shí),其反應(yīng)底物不是dNTP也不是ddNTP,而含有8個(gè)堿基的單鏈熒光探針混合物,在測(cè)序時(shí),這些探針按照堿基互補(bǔ)規(guī)則與單鏈DNA模板鏈配對(duì),不同的探針的5'末端分別標(biāo)記不同顏色的熒光染料,每?jī)蓚€(gè)堿基確定一個(gè)熒光信號(hào),相當(dāng)于一次能決定兩個(gè)堿基,因此,這種測(cè)序方法也被稱為兩堿基測(cè)序法。 福建提供邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)來(lái)電咨詢