轉(zhuǎn)錄組高通量測序應(yīng)用

如果你的樣品是質(zhì)?；蛘呤蔷?，那為什么不試試我們的KBSeq呢？準(zhǔn)確、迅速，可以說是KBSeq的代名詞了，關(guān)鍵是還可以省錢，估計(jì)這是很多小伙伴們一定會(huì)說，你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了，怎么可能會(huì)省錢呢？Sanger測序的價(jià)格：常規(guī)的一代測序基本上要每800 bp就測一個(gè)反應(yīng)，那我們來算一下14000/800=17.5，那基本上就要測18個(gè)反應(yīng)了，按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間，這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的，那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元，這樣算下來18*26=468元，還要加上引物合成的費(fèi)用，實(shí)驗(yàn)周期的話大概率是要超過15天的。KBSeq全質(zhì)粒測序的價(jià)格：序列長度屬于6-15 kb之間，159元，實(shí)驗(yàn)的周期大概在5-7天左右。Life Ion torrentPGM 運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù)。轉(zhuǎn)錄組高通量測序應(yīng)用

生工高通量測序樣品要求，組織/細(xì)胞樣品：請使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料，當(dāng)場分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;于微生物樣品，請客戶如實(shí)聲明所屬物種，對于可能致病的微生物，生工保留拒收的權(quán)利;對于需要進(jìn)行RNA抽提的樣品，可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送，具體情況請先取得溝通。16s高通量測序近年來，隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及，單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。

真核/原核無參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹；測序使用Illumina Xten平臺(tái)，測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接，并進(jìn)一步對拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。

通過顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過血球計(jì)數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢？將血球計(jì)數(shù)板擦拭干凈，取干凈的蓋玻片蓋在計(jì)數(shù)板上；將細(xì)胞懸液混勻（或10μl臺(tái)盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液），吸出10μl懸液至計(jì)數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計(jì)數(shù)板之間；在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)域進(jìn)行計(jì)數(shù)；按細(xì)胞計(jì)數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算，計(jì)算公式：細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù)，V1/V2/V3/V4為各個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)的細(xì)胞數(shù)目，細(xì)胞活率=活細(xì)胞數(shù)目/總細(xì)胞數(shù)目*100%。PacBio Sequel/RSII 該測序平臺(tái)主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序服務(wù)。

生工CHIP-Seq，項(xiàng)目介紹：CHIP-SEQ 技術(shù)，即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具，還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過高通量測序，可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布，得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理：首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段，并對其進(jìn)行純化與文庫構(gòu)建；然后對富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測序，將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。上海市高通量測序服務(wù)

寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間，管口使用Parafilm封口。轉(zhuǎn)錄組高通量測序應(yīng)用

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中，制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢？單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求：?細(xì)胞濃度：700-1200cells/μl；?細(xì)胞活率>80%（當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理）；細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%（無細(xì)胞粘連，無明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán)，并保證細(xì)胞的完整性）；?細(xì)胞狀態(tài)：細(xì)胞直徑在7-40um之間（細(xì)胞直徑過大則建議進(jìn)行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。轉(zhuǎn)錄組高通量測序應(yīng)用

生工生物工程（上海）股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中，一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取，不斷制造創(chuàng)新的市場高度，多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑，成績讓我們喜悅，但不會(huì)讓我們止步，殘酷的市場磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志，和諧溫馨的工作環(huán)境，富有營養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新，勇于進(jìn)取的無限潛力，生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來，回首過去，我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績而沾沾自喜，相反的是面對競爭越來越激烈的市場氛圍，我們更要明確自己的不足，做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備，要不畏困難，激流勇進(jìn)，以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家，共同走向輝煌回來！