上海市16s高通量測(cè)序服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-29

為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)?細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中,因細(xì)胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細(xì)胞分裂和分化過(guò)程中出現(xiàn)的誤差造成來(lái)自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過(guò)去的20多年中,人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無(wú)法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組,而單細(xì)胞測(cè)序測(cè)量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]。現(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測(cè)序。如果是水體樣品,建議采用濾膜過(guò)濾后,將濾膜寄送來(lái)生工。上海市16s高通量測(cè)序服務(wù)

全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序,其研究主要包括3個(gè)方面:第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序,是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序,并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正,進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜;第二種為常見(jiàn)的全基因組重測(cè)序,是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究,建立一個(gè)測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序,發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記,進(jìn)行后續(xù)的研究;第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上,對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫(kù)進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序,此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才,可進(jìn)行專業(yè)的項(xiàng)目分析,為客戶提供個(gè)性化服務(wù)。上海市多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序高通量DNA樣品建議用藍(lán)冰運(yùn)輸。

土壤樣本請(qǐng)置于2 mL離心管里(多準(zhǔn)備幾管備用),為保護(hù)樣本管,樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子;如常溫采的樣品,可以采用藍(lán)冰運(yùn)輸;如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C,需要用足量干冰運(yùn)輸; DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;藍(lán)冰運(yùn)輸;RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;用足量干冰運(yùn)輸。

單細(xì)胞測(cè)序是什么?單細(xì)胞測(cè)序是基于高通量測(cè)序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測(cè)群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組,提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細(xì)胞水平上對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能獲得單個(gè)細(xì)胞內(nèi)近萬(wàn)個(gè)基因的表達(dá)信息,為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說(shuō)到細(xì)胞異質(zhì)性(Cellheterogeneity),就要說(shuō)到我們?yōu)槭裁匆脝渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)了。如果你的樣品是質(zhì)粒或者是菌液,那為什么不試試我們的KBSeq呢?

RNA類高通量測(cè)序樣品要求:對(duì)于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品,請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場(chǎng)分成小塊(動(dòng)物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時(shí),而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。請(qǐng)注意選擇無(wú)RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。上海地區(qū)SNP高通量測(cè)序產(chǎn)品

RNA樣品建議用足量干冰運(yùn)輸。上海市16s高通量測(cè)序服務(wù)

微生物基因組重測(cè)序(有參):目前越來(lái)越多的微生物基因組被解析出來(lái)了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測(cè)序(無(wú)參):對(duì)于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來(lái)說(shuō),要確定一個(gè)菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進(jìn)行基因組測(cè)序。利用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)這些基因組進(jìn)行高深度測(cè)序,然后進(jìn)行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細(xì)圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進(jìn)化關(guān)系。上海市16s高通量測(cè)序服務(wù)

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo),有組織有體系的公司,堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明,攜手共畫(huà)藍(lán)圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ),也希望未來(lái)公司能成為*****,努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息,斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌,共創(chuàng)佳績(jī),一直以來(lái),公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針,員工精誠(chéng)努力,協(xié)同奮取,以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng),我們一直在路上!

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