上海生工生物 高通量測序

16s/18s/ITS微生物分類測序，項目介紹：環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群，其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機理是微生物生態(tài)學(xué)的研究熱點，對于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累，通用引物擴增結(jié)合高通量測序技術(shù)，可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項運用我們稱之為微生物分類測序。如Illumina公司的MiSeq高通量測序平臺不僅可實現(xiàn)對多樣品的多個可變區(qū)同時測序，而且在測序速度和測序通量上都有進一步提升，目前此平臺已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究方面受到了廣大學(xué)者的認可。寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口。上海生工生物 高通量測序

臺盼藍染色原理：臺盼藍染色原理：臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜，故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高，可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。

通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果：明場（細胞未染色）：主要可以觀察懸液背景質(zhì)量（背景干凈，無雜質(zhì)碎片，無細胞團塊）；臺盼藍場（細胞與臺盼藍染色后）：主要可以觀察活性（主要為活細胞，未染色藍色的為活細胞）；通過臺盼藍場計算活率：90%>80%；細胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看，血球計數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標均符合上機標準，屬于高質(zhì)量單細胞懸液。 上海轉(zhuǎn)錄組高通量測序產(chǎn)品10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。

生工優(yōu)勢：1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗豐富，可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標準化的分析內(nèi)容（以生工分析報告模板為準），全部無費用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。

真核/原核有參mRNA-Seq，項目介紹：轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather，狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達的主要手段，是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式，通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控，是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后，mapping至參考基因組序列，對mapping到基因上的reads進行計數(shù)，計算基因的表達量后，進行基因表達差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個樣本，可進行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外，依據(jù)參考基因組，可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析；可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外，還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中，再將50 ml管放在封口袋中。

單細胞懸液質(zhì)檢方法，在進行單細胞懸液質(zhì)檢時，需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助：熒光細胞計數(shù)儀（主要使用臺盼藍和雙熒光AO/PI染色法）進行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細胞質(zhì)檢時染料染色的原理：臺盼藍染色原理：臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜，故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高，可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。熒光細胞計數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細胞濃度（總細胞，活細胞，死細胞）、細胞存活率（臺盼藍和雙熒光AO/PI染色）、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結(jié)果的展示。如果問現(xiàn)在什么技術(shù)是測序?qū)玫膶檭?，那么單細胞測序則是我們不得不提及的技術(shù)了。上海市多重PCR高通量測序產(chǎn)品

如果你的樣品是質(zhì)?；蛘呤蔷?，那為什么不試試我們的KBSeq呢？上海生工生物 高通量測序

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中，制備高質(zhì)量的單細胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢？單細胞懸液質(zhì)控要求：?細胞濃度：700-1200cells/μl；?細胞活率>80%（當細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理）；細胞團及碎片雜質(zhì)<5%（無細胞粘連，無明顯的細胞碎片和細胞團，并保證細胞的完整性）；?細胞狀態(tài)：細胞直徑在7-40um之間（細胞直徑過大則建議進行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細胞的核酸分子。上海生工生物 高通量測序

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