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Chip-Seq 是指通過染色質免疫共沉淀技術（ChIP）特異性地富集目的蛋白結合的DN**段，并對其進行純化和文庫構建；然后對富集得到的DN**段進行高通量測序，通過將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息，是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段，為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。

應用領域

1、確定組蛋白修飾的位置及其與基因表達的關系。

2、完成對轉錄因子及其它蛋白在基因組上結合位點的精細定位。

3、研究特定的核小體或組蛋白的分布。 通過甲基化數(shù)據(jù)，篩選疾病耐藥的差異甲基化。江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢

技術優(yōu)勢

1、ChIP-Seq 能實現(xiàn)真正的全基因組分析。目前所能獲得的芯片上固定的探針只能**全基因組部分序列，所獲得的雜交信息具有偏向性。

2、對于結合位點分析，ChIP-Seq 通過尋找“峰”，結合分辨率可精確到10~30 bp，而芯片上探針由于長度所限，無法精確定位，即使目前比較高水平的商業(yè)芯片都無法提供可與ChIP-Seq 媲美的分辨率。

3、是所需樣本數(shù)量。ChIP-chip 需要多達4~5 μg?的起始樣本，在雜交之前需要進行LM-PCR，但可能導致背景增高，競爭性擴增等導致假陽性。而ChIP-Seq *需要納克級起始材料，如SOLiD 起始材料可低至20ng。 江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢細胞、全血、組織樣本干冰運輸。

    甲基化DNA免疫沉淀測序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，MeDIP-Seq）是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量，快速、高效地尋找甲基化區(qū)域?？蓮V泛應用于甲基化與疾病關系研究。技術優(yōu)勢全基因組范圍鑒定甲基化修飾區(qū)域針對性檢測基因組內(nèi)具有甲基化修飾的區(qū)域與WGBS技術相比，成本更低科學方案設計從項目背景了解、協(xié)助方案設計、實驗材料選取、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學問題；需要專業(yè)、有價值的建議；科學、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150。

    N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一，在細菌、藻類及植物基因組中***存在，在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。6mA免疫沉淀測序(6mA-IPSeq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量，快速、高效地尋找6mA甲基化區(qū)域。技術優(yōu)勢全基因組范圍鑒定6mA甲基化修飾區(qū)域技術方法適合所有物種(一般推薦藻類及植物)科學方案設計從項目背景了解、協(xié)助方案設計、實驗材料選取、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學問題；需要專業(yè)、有價值的建議；科學、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150。 CpG島常位于基因轉錄調(diào)控區(qū)附近。

    cfDNA，cellfreeDNA，就是血液中游離的自身DNA，這些DNA多是從身體的細胞或者白血球破裂釋放出來的，基本上都是無害的，不用多久會被自身清理掉。不過值得一提的是，當孕婦懷孕的時候，胎兒的DNA也會同時釋放到母親的血液里頭去，這是當前火熱的無創(chuàng)唐氏篩查的基礎。通過抽取母親的外周血測序分析其中的游離DNA就可以判斷胎兒是否存在整個染色體或者大片段DNA的變異。有研究已經(jīng)證實，**患者外周血中的cfDNA總量，要高于健康人。通過這一點，雖然不能武斷的說cfDNA能成為**標志物，但是cfDNA的含量增多，能起到一個較好的提示作用，作為一個初篩的手段。基于cfDNA的液態(tài)活檢中，盡管ctDNA在**診斷中的應用是當下cfDNA*****，研究**深入的分支。但是，cfDNA作為液態(tài)活檢，不只是局限于**學。例如，有研究報道對于接受***移植手術的病人，可以通過監(jiān)測術后外周血中具有捐獻者基因特征，片段化的cfDNA含量變化，來評估移植***的排斥情況。 芯片數(shù)據(jù)如何與二代、三代數(shù)據(jù)整合。江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢

ATAC-seq實驗過程短，從實驗到分析可達2周。江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢

    2019國自然基金解析—甲基化研究專題。從生命科學部和醫(yī)學科學部總體來看：2019年度，生命科學部獲自然科學基金委批準資助6478項（不含杰出青年基金項目），批準資助金額共計，單項平均資助金額。2019年度，醫(yī)學科學部共批資助10138項（不含杰出青年基金項目），批準資助金額共計，單項平均資助金額。從甲基化研究方向來看，與甲基化研究相關的項目總數(shù)達283項，項目總金額超過12669萬元。其中生命科學部項目總數(shù)62項，項目金額3235萬元，醫(yī)學科學部項目總數(shù)221項，項目金額9434萬元。從2011-2019年甲基化研究方向的項目金額和項目數(shù)目分析，整體呈上升趨勢；從醫(yī)學科學部來看，甲基化研究項目獲批數(shù)量221項，項目金額達到9434萬，較之2018年度項目獲批金額（7166萬元）上升趨勢尤為明顯，可以看出，甲基化研究日益成為國自然的研究熱點。 江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢