陜西深度空間代謝組學(xué)是靶向代謝組嗎

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-14

空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成??臻g代謝組學(xué)基本研究流程。陜西深度空間代謝組學(xué)是靶向代謝組嗎

AFADESI空間代謝組技術(shù):免標(biāo)記、無(wú)需基質(zhì)噴涂、周期短、定位準(zhǔn)是AFADESI空間代謝組技術(shù)的主要特點(diǎn)。該技術(shù)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個(gè)維度的信息。在獲得AFADESI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,經(jīng)過(guò)2021年一整年的研發(fā)及項(xiàng)目運(yùn)營(yíng)落地,鹿明生物積贊了如下優(yōu)勢(shì)。一、**支持AFADESI-MSI原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)****-賀玖明教授(中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所PI)全力支持,參與的基于AFADESI平臺(tái)發(fā)表的方法學(xué)及應(yīng)用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上發(fā)表10+篇。黑龍江空間代謝組學(xué)翻譯一文讀懂空間代謝組學(xué):DESI-IMS與MALDI-IMS的區(qū)別。

空間代謝組學(xué):質(zhì)譜成像方法提供了一種直接獲取代謝網(wǎng)絡(luò)信息的途徑,以系統(tǒng)地深入了解大腦的代謝活動(dòng)。基于KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的Metaboanalyst軟件進(jìn)行代謝網(wǎng)絡(luò)分析。共找到20條KEGG代謝通路,包含126個(gè)具有微區(qū)信息的代謝物,圖2顯示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代謝、花生四烯酸代謝、精氨酸和脯氨酸代謝、肌酸途徑、GABA能突觸、葡萄糖代謝、谷胱甘肽代謝、甘油磷脂代謝、甘氨酸-絲氨酸和蘇氨酸的代謝、組氨酸代謝、賴氨酸代謝、苯丙氨酸代謝、多胺代謝途徑、嘌呤代謝、嘧啶代謝和TCA循環(huán)、色氨酸代謝、酪氨酸代謝、纈氨酸-亮氨酸和異亮氨酸代謝和類固醇***合成途徑。

空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:糞便宏基因組和血清代謝組的整合分析揭示腸道微生物組相關(guān)代謝物在結(jié)直腸*和腺瘤檢測(cè)的作用研究對(duì)象:人糞便、血清、組織發(fā)表期刊:Gut影響因子:23.059發(fā)表時(shí)間:2021年8月發(fā)表單位:國(guó)家**中心中國(guó)醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、LC-MS非靶代謝組、宏基因組、靶向代謝組學(xué)空間代謝組學(xué)由賀玖明教授團(tuán)隊(duì)提供技術(shù)支持。結(jié)直腸*(CRC)的早期診斷是提高患者生存率的有效方式。目前臨床常用的非侵入性和入侵式檢測(cè)方法因其準(zhǔn)確率低或?qū)颊咴斐蓚Γ笠?guī)模使用仍受限制。因此,發(fā)展無(wú)創(chuàng)且準(zhǔn)確的檢測(cè)方法變得尤為重要。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性。

空間代謝組學(xué)研究:一區(qū) | IF:14.553多發(fā)性硬化癥的相關(guān)空間代謝組學(xué)研究。本文為倫敦帝國(guó)理工學(xué)院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發(fā)表的題為“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果,通過(guò)拉曼+空間代謝組學(xué)+IHC研究方法,發(fā)現(xiàn)了新形成的髓鞘與正常髓鞘具有不同的脂質(zhì)成分,探究了多發(fā)性硬化中再髓鞘化形成的機(jī)理,描繪了用于關(guān)聯(lián)生物分子結(jié)構(gòu)和髓鞘成分的分子成像圖譜,為評(píng)估再髓鞘化***提供新策略??臻g代謝組學(xué)-靶向代謝組學(xué)服務(wù)-擅長(zhǎng)多組學(xué)聯(lián)合分析。甘肅空間代謝組學(xué) 代謝流

代謝組學(xué)分析、空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格、代謝組學(xué)分析。陜西深度空間代謝組學(xué)是靶向代謝組嗎

作者使用NMR對(duì)C原子進(jìn)行示蹤實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)MYC驅(qū)動(dòng)葡萄糖和谷氨酰胺的C參與脂肪生成(圖3)。采用空間代謝組學(xué)檢測(cè)小鼠模型以及人BCL細(xì)胞中的FA,發(fā)現(xiàn)MYC**中不飽和脂肪酸(FA(18:1))的豐度增加。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)13C-油酸酯在MYC誘導(dǎo)的BCL細(xì)胞未發(fā)生代謝,而13C-葡萄糖增加了不飽和FA中的標(biāo)記碳。當(dāng)MYC失活時(shí),細(xì)胞中3H標(biāo)記的棕櫚酸酯氧化速率明顯變高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL細(xì)胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同時(shí)上調(diào)FA的合成。陜西深度空間代謝組學(xué)是靶向代謝組嗎

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