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本篇為2021年8月,國(guó)家**中心中國(guó)醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院崔巍研究員與專(zhuān)業(yè)多組學(xué)技術(shù)團(tuán)隊(duì)合作在醫(yī)學(xué)一區(qū)消化道領(lǐng)域國(guó)際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果,通過(guò)非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)(研究方法,整合了宏基因組的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了可用于腺瘤及結(jié)直腸*診斷的代謝標(biāo)志物,建立的相關(guān)預(yù)測(cè)模型顯示出較高診斷準(zhǔn)確性,為結(jié)直腸*早期診斷奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。在本研究中,作者對(duì)血清代謝組學(xué)和糞便宏基因組測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行整合分析,確定了一組與腸道微生物群密切相關(guān)的CRC和腺瘤患者的血清代謝物,并基于代謝物研發(fā)了腸道微生物組相關(guān)血清代謝物 (GMSM) 策略,可準(zhǔn)確區(qū)分CRC和腺瘤患者(統(tǒng)稱(chēng)為結(jié)直腸異常)與正常健康個(gè)體?!堵姑魃锟臻g代謝組學(xué)千萬(wàn)醫(yī)學(xué)支持計(jì)劃。浙江空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用
通過(guò)空間代謝組學(xué)測(cè)量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,發(fā)現(xiàn)在不同的**中,MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油(PGs)的豐度(圖 4A),能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后,PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平(圖 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通過(guò)向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成,因此,PG誘導(dǎo)可以建立在MYC促進(jìn)的FA增加的基礎(chǔ)上。然而,在體內(nèi)PGs相對(duì)于其他GPs的相對(duì)優(yōu)先合成,這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。四川質(zhì)譜成像與空間代謝組學(xué)什么是空間代謝組學(xué)?。
作者使用NMR對(duì)C原子進(jìn)行示蹤實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)MYC驅(qū)動(dòng)葡萄糖和谷氨酰胺的C參與脂肪生成(圖3)。采用空間代謝組學(xué)檢測(cè)小鼠模型以及人BCL細(xì)胞中的FA,發(fā)現(xiàn)MYC**中不飽和脂肪酸(FA(18:1))的豐度增加。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)13C-油酸酯在MYC誘導(dǎo)的BCL細(xì)胞未發(fā)生代謝,而13C-葡萄糖增加了不飽和FA中的標(biāo)記碳。當(dāng)MYC失活時(shí),細(xì)胞中3H標(biāo)記的棕櫚酸酯氧化速率明顯變高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL細(xì)胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同時(shí)上調(diào)FA的合成。
質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對(duì)于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無(wú)需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢(shì)。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識(shí)別其生物學(xué)功能??臻g代謝組學(xué)的力量探究前列腺*。
在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡(luò)發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵因素,基于空間分辨的代謝組學(xué)信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線(xiàn)索,但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡(luò)分析必須進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白質(zhì)和基因表達(dá)水平。本文作者開(kāi)發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡(luò)作圖方法,通過(guò)無(wú)需衍生化、特定標(biāo)記或復(fù)雜樣品預(yù)處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學(xué)策略,在具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測(cè)出多種極性?xún)?nèi)源性代謝物,并繪制相關(guān)代謝網(wǎng)絡(luò),提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物)含量分布可視化。空間代謝組是基于質(zhì)譜成像技術(shù)發(fā)展而來(lái)的,免標(biāo)記、無(wú)需基質(zhì)、周期短。陜西尿液空間代謝組學(xué)
質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性。浙江空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用
空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:糞便宏基因組和血清代謝組的整合分析揭示腸道微生物組相關(guān)代謝物在結(jié)直腸*和腺瘤檢測(cè)的作用研究對(duì)象:人糞便、血清、組織發(fā)表期刊:Gut影響因子:23.059發(fā)表時(shí)間:2021年8月發(fā)表單位:國(guó)家**中心中國(guó)醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、LC-MS非靶代謝組、宏基因組、靶向代謝組學(xué)空間代謝組學(xué)由賀玖明教授團(tuán)隊(duì)提供技術(shù)支持。結(jié)直腸*(CRC)的早期診斷是提高患者生存率的有效方式。目前臨床常用的非侵入性和入侵式檢測(cè)方法因其準(zhǔn)確率低或?qū)颊咴斐蓚?,大?guī)模使用仍受限制。因此,發(fā)展無(wú)創(chuàng)且準(zhǔn)確的檢測(cè)方法變得尤為重要。浙江空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家集研發(fā)、生產(chǎn)、咨詢(xún)、規(guī)劃、銷(xiāo)售、服務(wù)于一體的服務(wù)型企業(yè)。公司成立于2009-03-10,多年來(lái)在科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢(xún)行業(yè)形成了成熟、可靠的研發(fā)、生產(chǎn)體系。在孜孜不倦的奮斗下,公司產(chǎn)品業(yè)務(wù)越來(lái)越廣。目前主要經(jīng)營(yíng)有科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢(xún)等產(chǎn)品,并多次以醫(yī)藥健康行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)、客戶(hù)需求定制多款多元化的產(chǎn)品。歐易生物為用戶(hù)提供真誠(chéng)、貼心的售前、售后服務(wù),產(chǎn)品價(jià)格實(shí)惠。公司秉承為社會(huì)做貢獻(xiàn)、為用戶(hù)做服務(wù)的經(jīng)營(yíng)理念,致力向社會(huì)和用戶(hù)提供滿(mǎn)意的產(chǎn)品和服務(wù)。上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司以市場(chǎng)為導(dǎo)向,以創(chuàng)新為動(dòng)力。不斷提升管理水平及科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢(xún)產(chǎn)品質(zhì)量。本公司以良好的商品品質(zhì)、誠(chéng)信的經(jīng)營(yíng)理念期待您的到來(lái)!