AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:一種基于分子組織學(xué)的高靈敏高覆蓋質(zhì)譜成像方法用于檢測(cè)功能性代謝物研究對(duì)象:大鼠腎臟,大鼠腦和人食道*組織發(fā)表期刊:AdvancedScience影響因子:16.806運(yùn)用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)2018年11月中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發(fā)表的研究論文,通過(guò)優(yōu)化的空氣動(dòng)力輔助解吸電噴霧質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)技術(shù),繪制了生物樣本中超過(guò)1500種代謝物的空間分布圖譜,將功能代謝物的時(shí)空變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來(lái)。本研究開(kāi)發(fā)了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法,用于原位分析組織上的代謝物并發(fā)現(xiàn)特異性生物標(biāo)志物。通過(guò)非靶向分析,在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數(shù)千種代謝物,為分子組織學(xué)研究提供了有力的分析工具。誰(shuí)還在盤點(diǎn)空間代謝組學(xué)專題?4篇,總IF:82,篇篇經(jīng)典~。海南空間代謝組學(xué)在植物葉片
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測(cè)。2、檢測(cè)組織樣本類型20+。高準(zhǔn)性的定性算法通過(guò)物質(zhì)表達(dá)空間情況、加和離子及同位素峰表達(dá)強(qiáng)度相似性、同位素表達(dá)空間分布相似性進(jìn)行初步代謝物注釋,并可基于專屬物種組織類型數(shù)據(jù)庫(kù)或非靶質(zhì)譜數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上在初步注釋結(jié)果基礎(chǔ)上進(jìn)一步獲得更加準(zhǔn)確定性的結(jié)果。已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫(kù)。河北空間代謝組學(xué)價(jià)格空間代謝組學(xué)哪家好,為各類科學(xué)領(lǐng)域提供線索和方向。
通過(guò)空間代謝組學(xué)測(cè)量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,發(fā)現(xiàn)在不同的**中,MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油(PGs)的豐度(圖 4A),能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后,PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平(圖 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通過(guò)向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成,因此,PG誘導(dǎo)可以建立在MYC促進(jìn)的FA增加的基礎(chǔ)上。然而,在體內(nèi)PGs相對(duì)于其他GPs的相對(duì)優(yōu)先合成,這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。
獲取空間代謝組學(xué)圖像。計(jì)算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質(zhì)譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(cè)(紅色)或非注射側(cè)(綠色)的后驗(yàn)概率。該分析基本證實(shí)了拉曼光譜特征,與對(duì)側(cè)正常側(cè)(非注射側(cè))相比,再髓鞘損傷(注射側(cè))發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報(bào)告。拉曼光譜和空間代謝組學(xué)表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質(zhì)成分不同于原始髓鞘的脂質(zhì)成分。從小鼠模型獲得的結(jié)果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質(zhì)分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對(duì)脂質(zhì)成分差異的***個(gè)直接指標(biāo)??臻g代謝組通過(guò)質(zhì)譜成像技術(shù)。
空間代謝組學(xué):繪制了不同代謝物在組織內(nèi)濃度的圖像,直觀顯示了代謝物在NCE細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞和**細(xì)胞的濃度差異。在正離子和負(fù)離子模式下檢測(cè)到的質(zhì)量分別用紅色加號(hào)和藍(lán)色減號(hào)表示。組織邊緣用黑色邊框勾勒出輪廓,但**區(qū)域還包含一些無(wú)法單獨(dú)注釋的*細(xì)胞與基質(zhì)的區(qū)域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羥基丁酰肉堿,HE=蘇木精和伊紅,LPC=溶血磷脂酰膽堿,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物上千代謝物的定性。河北空間代謝組學(xué)價(jià)格
蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法。海南空間代謝組學(xué)在植物葉片
本篇小鹿分享一篇空間代謝組學(xué)專業(yè)應(yīng)用技術(shù)文章,探究空間代謝組學(xué)如何進(jìn)行前列腺*診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異研究?該研究發(fā)現(xiàn)了前列腺*樣本中的特定組織區(qū)室的不同代謝特征,確定了幾種可能被進(jìn)一步開(kāi)發(fā)為前列腺*的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異代謝物和脂質(zhì)??臻g代謝組學(xué)能夠快速提供代謝物的水平差異和空間信息,是臨床上有潛力的創(chuàng)新診斷工具。免標(biāo)記、無(wú)需基質(zhì)噴涂、周期短、定位準(zhǔn)是AFADESI空間代謝組技術(shù)的主要特點(diǎn)。該技術(shù)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個(gè)維度的信息。海南空間代謝組學(xué)在植物葉片
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