鹿明生物AFADESI-MSI空間代謝組技術作為一種新型的分子影像技術,能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。具有免標記、無需基質、周期短、定位準的特點。在獲得AFADESI-MSI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,經過前期的研發(fā)以及1年時間的技術服務積累,鹿明生物已經完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動物/植物組織樣本的空間代謝組學檢測及分析,積累了豐富的樣本前處理經驗??臻g代謝組學又有什么用呢?。陜西空間代謝組學圖片
空間代謝組學:中文標題:MYC*基因與固醇調節(jié)元件結合蛋白協同調節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學運用生物技術:空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細胞增殖、凋亡、分化等多種細胞生物學過程中發(fā)揮作用,其易位、擴增或表達異常常與多種**的發(fā)***展有關。近年來關于MYC在脂質代謝中的研究很多,據了解MYC與脂肪酸合成相關酶密切相關;致*基因MYC刺激細胞生長需要脂質來組裝新的細胞膜,但是否*由MYC調節(jié)還是與其他因素協同調節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導的**中脂質生成的機制。云南深度空間代謝組學是靶向代謝組嗎空間代謝組分析測序服務。
以上結果表明,AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產物,并具有高特異性,能呈現其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網絡圖要了解大腦的結構區(qū)域發(fā)生的復雜代謝過程,不僅應準確表征代謝物,還要研究其相關性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網絡重建。從15個微區(qū)提取的MSI數據進行峰挑選和峰對齊(圖1F),包括松果體、中腦導水管、腦橋、梨狀皮質、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。
獲取空間代謝組學圖像。計算了負離子和正離子模式下的平均空間代謝質譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(紅色)或非注射側(綠色)的后驗概率。該分析基本證實了拉曼光譜特征,與對側正常側(非注射側)相比,再髓鞘損傷(注射側)發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過串聯質譜法確認了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報告。拉曼光譜和空間代謝組學表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質成分不同于原始髓鞘的脂質成分。從小鼠模型獲得的結果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對脂質成分差異的***個直接指標??臻g代謝組學是廣大客戶的選擇,認準鹿明生物。
空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結合,不僅調節(jié)FA合成基因的表達,還調節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調節(jié)參與脂質合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現,增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成??臻g代謝組得到了廣大醫(yī)學領域科研工作者的信任。福建植物冷凍切片與空間代謝組學
空間代謝組技術原理 。陜西空間代謝組學圖片
空間代謝組學:該技術解決了生物組織中低含量代謝物難檢測、覆蓋種類少和成像質量差等技術難題,可實現生物組織中約1500個代謝物的成像分析,包括膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類和脂質類等,并精確表征與識別功能代謝物在組織亞區(qū)域的分布特征。在獲得AFADESI-MSI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,經過前期的研發(fā)以及1年時間的技術服務積累,鹿明生物已經完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動物/植物組織樣本的空間代謝組學檢測及分析,積累了豐富的樣本前處理經驗。陜西空間代謝組學圖片
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