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蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來(lái)自9,832個(gè)磷酸化蛋白的62,879個(gè)磷酸化位點(diǎn)?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個(gè)***改變的**驅(qū)動(dòng)基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊(duì)列相比,本文隊(duì)列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊(duì)列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過(guò)比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細(xì)胞周期通路的上調(diào)以及細(xì)胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進(jìn)一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)(圖1F和1G)。蛋白組學(xué)專(zhuān)業(yè)客服在線為您答疑 。吉林蛋白組學(xué)差異蛋白
作者使用通過(guò)單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來(lái)觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個(gè)Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運(yùn)輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過(guò)程,細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動(dòng)蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的細(xì)胞成分。富含247個(gè)PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過(guò)程和藥物代謝過(guò)程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,有41種已被報(bào)導(dǎo)存在于腎臟中,在這41種蛋白質(zhì)中,18種(43.9%)與單細(xì)胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒(méi)有增加。浙江蛋白組學(xué)kegg分析走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見(jiàn)問(wèn)題答疑解惑。
本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽(TMT)標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(PRM)技術(shù),對(duì)蓮子脫水過(guò)程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對(duì)蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過(guò)程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過(guò)程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測(cè)表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見(jiàn)解。
單細(xì)胞蛋白組學(xué)研究方法:2020年9月,加州大學(xué)的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通過(guò)單細(xì)胞蛋白組學(xué)研究方法,分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細(xì)胞,研究為解開(kāi)急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細(xì)胞功能擾動(dòng)提供依據(jù)。中文標(biāo)題:正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究對(duì)象:人體腎臟組織發(fā)表期刊:FrontiersinMedicine影響因子:5.091發(fā)表時(shí)間:2020年9月運(yùn)用重點(diǎn)組學(xué)技術(shù):?jiǎn)渭?xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究?jī)?nèi)容 研究意義背景。
3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動(dòng)物中的研究。水產(chǎn)動(dòng)物的研究不僅是保障我國(guó)海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時(shí)可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題:CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對(duì)金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對(duì)象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測(cè),鑒定,定性,定量。廣東slac定量蛋白組學(xué)
蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。吉林蛋白組學(xué)差異蛋白
為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過(guò)程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。吉林蛋白組學(xué)差異蛋白
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