代謝組學經(jīng)典研究：本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學的經(jīng)典研究，***篇文章運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學探究番茄果實成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運用16S rRNA測序+代謝組學技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機制。第三篇文章運用GC-MS頂空代謝組學探究新等位基因系和野生型的成熟種子中發(fā)現(xiàn)了幾種不同的揮發(fā)性化合物。第四篇文章運用GC-MS非靶向代謝組學技術(shù)對對全氟辛酸（PFOA）暴露土壤栽培的黃瓜組織代謝途徑變化進行了研究。非靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析 靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析。上海代謝組學 分析
LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例，中文標題：使用無偏差代謝組學方法鑒定短期暴露于顆粒物和微生物氣溶膠中的青年人尿液生物標志物研究對象：年輕健康志愿者發(fā)表期刊：EnvironmentalPollution影響因子：8.071發(fā)表時間：2022年4月17日合作單位：中國醫(yī)學科學院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所衛(wèi)計委***生物工程重點實驗室、中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術(shù)：LC-MS代謝組學、GC-MS代謝組學(由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究方法探索 92 名年輕健康個體的尿液代謝組學特征，并確定與短期共暴露相關(guān)的潛在生物標志物。上海代謝組學 分析代謝組學數(shù)據(jù)分析教程 代謝組學一般測幾個樣。
微生物組和代謝組學結(jié)果表明，高比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉比例能夠調(diào)節(jié)消化和粘膜相關(guān)的盲腸微生物群落和代謝特征。三種比例中，喂養(yǎng)含有50%高直鏈淀粉的飲食具有更好的結(jié)果，因為其共生細菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacterium）的富集，戊酸鹽的增加以及促炎細胞因子的減少。代謝組學結(jié)果顯示盲腸組織的代謝特征發(fā)生了改變，包括脂質(zhì)肉堿和α-生育酚等代謝物的上調(diào)和下調(diào)。這些發(fā)現(xiàn)為直鏈淀粉/支鏈淀粉的比例是如何通過調(diào)節(jié)微生物發(fā)酵，導致共生微生物群和代謝物的增殖，從而改善斷奶山羊的盲腸環(huán)境提供了新的見解。本篇文章，檢測了喂食不同直鏈淀粉/支鏈淀粉比例的山羊的盲腸中SCFAs和炎癥因子的變化，并使用16s RNA測序檢測了不同組山羊的盲腸粘膜和消化物中微生物的變化，找到了變化的優(yōu)勢菌群以及菌群和SCFAs的相關(guān)性。再使用LC-MS/MS非靶代謝組學研究了不同組山羊盲腸組織的代謝物變化。通過多組學結(jié)合的方式，揭示了不同比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉對山羊盲腸環(huán)境的影響。
GC-MS非靶向代謝組學等研究方法：2021年10月，廣東石油化工大學環(huán)境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果，通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法，發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝，丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達的代謝物被下調(diào)，表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關(guān)鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環(huán)境產(chǎn)生的風險提供了新的見解。代謝組學-對生物體內(nèi)所有代謝物進行定量分析。
LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例，中文標題：***通絡(luò)***通過***和抗氧化作用預(yù)防及延緩糖尿病視網(wǎng)膜病變發(fā)展的機制研究研究對象：大鼠發(fā)表期刊：Biomedicine&Pharmacotherapy影響因子：6.529發(fā)表時間：2022年2月合作單位：中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術(shù)：LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學（由鹿明生物提供技術(shù)支持)。文章通過對中藥***—***通絡(luò)方改善糖尿病病理方面的深入研究，表明在預(yù)防及***方面和微觀層面均起到了***效果。同時，也探究出***通絡(luò)方的內(nèi)在作用機制。也為糖尿病視網(wǎng)膜病變的早期***，提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學有助于對中藥成分進行***的分析，為藥物機制提供參考。歐易生物助力靶向/非靶向代謝組學研究。浙江代謝組學 輪廓分析
非靶向代謝組學 土壤非靶代謝學 非靶脂質(zhì)組學研究。上海代謝組學 分析
代謝組學等多組學研究，2021年12月30日復(fù)旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學、微生物組學研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。上海代謝組學 分析
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