GC-MS非靶向代謝組研究,隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進(jìn)入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國(guó)科學(xué)家的***關(guān)注,本篇為2020年2月,南京大學(xué)趙麗娟課題組在Environmental Science & Technology雜志發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運(yùn)用16S rRNA基因測(cè)序、GC-MS非靶向代謝組技術(shù)對(duì)土壤微生物組和代謝組學(xué)分析技術(shù)的獨(dú)特結(jié)合,提供了對(duì)AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對(duì)土壤微生物的影響。代謝組學(xué)交流—代謝組貼吧—代謝組學(xué)咨詢。江蘇細(xì)胞代謝組學(xué)呂海濤
LC-MS靶向代謝組學(xué)研究本篇文章通過(guò)LC-MS靶向代謝組學(xué)和16S rRNA基因序列分析,探究谷物在加工傳統(tǒng)飲料ogi過(guò)程中******的減少和細(xì)菌群落的動(dòng)態(tài)變化。同時(shí),從糧食安全方面考慮,谷物的污染水平低、較安全,又優(yōu)于玉米,可以代替受******污染的玉米品種。歐易/鹿明生物推出的16s+代謝組學(xué)的多層組學(xué)研究思路繼本篇文章前已先后助力了浙江工業(yè)大學(xué)、中國(guó)農(nóng)科院、青島農(nóng)業(yè)大學(xué)等在微生物一區(qū)頂刊Microbiome、醫(yī)學(xué)一區(qū)頂刊GUT發(fā)表文章。項(xiàng)目文章PBP | 浙江工業(yè)大學(xué)傅正偉運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)和16S探究水稻根際微生物群落影響項(xiàng)目文章 | 恭喜中國(guó)農(nóng)科院及青島農(nóng)業(yè)大學(xué)團(tuán)隊(duì)繼GUT后又喜發(fā)微生物頂刊Microbiome。北京1h nmr代謝組學(xué)技術(shù)基于 LC-MS/GC-MS代謝組學(xué) 從樣本采集到數(shù)據(jù)分析。
非靶向代謝組學(xué)研究:通過(guò)在三個(gè)成熟階段收獲兩個(gè)東方甜瓜品種的果實(shí)作者使用非靶代謝組學(xué)聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機(jī)酸在轉(zhuǎn)錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項(xiàng)研究運(yùn)用多組學(xué)技術(shù)聯(lián)合揭示了兩個(gè)品種成熟過(guò)程中關(guān)鍵的代謝和轉(zhuǎn)錄特征。在本研究中,通過(guò)代謝和轉(zhuǎn)錄組分析的綜合分析,研究了控制兩個(gè)東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機(jī)酸代謝的基因網(wǎng)絡(luò)。篩選了與糖和有機(jī)酸代謝相關(guān)的關(guān)鍵代謝物和候選基因,并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結(jié)果提高了對(duì)決定甜瓜發(fā)育和成熟過(guò)程中糖和有機(jī)酸積累和代謝的分子機(jī)制的理解。
非靶向代謝組學(xué)研究:對(duì)于代謝物分析,作者對(duì)非靶代謝組學(xué)測(cè)定,共檢測(cè)到4,346種代謝物。根據(jù)所有檢測(cè)到的代謝物的投影中變量重要性(VIP)>1和p<0.05的篩選標(biāo)準(zhǔn),在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物(DAM)(表1)。在A果實(shí)(AF)與B果實(shí)(BF)的相同成熟階段,發(fā)現(xiàn)S3的DAM比S1和S2更豐富,這意味著DAM的主要變化發(fā)生在S3。隨后,利用京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析進(jìn)一步了解與兩個(gè)東方甜瓜品種相關(guān)的生物學(xué)機(jī)制。其中,參與蔗糖和有機(jī)酸代謝的代謝物在果實(shí)中的積累差異更大,包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。讀懂代謝組學(xué) 代謝組學(xué)的研究范疇。
非靶向代謝組學(xué)研究:2022年5月,歐易/鹿明生物合作客戶甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院程鴻團(tuán)隊(duì)和中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)林濤團(tuán)隊(duì)在Frontiers in Plant Science期刊發(fā)表的題為 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果,采用非靶代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組研究方法,發(fā)現(xiàn)了蔗糖、D-葡萄糖、棉子糖的高積累以及相對(duì)較低的檸檬酸和蘋果酸可能有助于東方甜瓜“甜寶”的甜味。歐易生物代謝組學(xué)專業(yè)分析檢測(cè)技術(shù)**。北京植物代謝組學(xué)
代謝組學(xué)專業(yè)第三方檢測(cè),出具報(bào)告快,數(shù)據(jù)準(zhǔn)。江蘇細(xì)胞代謝組學(xué)呂海濤
代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點(diǎn),并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機(jī)制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學(xué)分析中,發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中的樣品共鑒定出2466個(gè)代謝物峰,負(fù)離子模式631個(gè)、正離子模式下的1835個(gè);通過(guò)篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復(fù)組很容易區(qū)分(圖1B)。240個(gè)代謝物中有193個(gè)與COVID-19***相關(guān)(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對(duì)比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個(gè),嚴(yán)重組有59個(gè),恢復(fù)組有64個(gè);***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個(gè),重癥組有29個(gè),恢復(fù)組有34個(gè)。使用靶向代謝組學(xué)分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中59名受試者的血清代謝物(4個(gè)樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個(gè)代謝物分為16個(gè)簇;然后根據(jù)恢復(fù)組的代謝物是否恢復(fù)到正常水平將這些簇分為三組。江蘇細(xì)胞代謝組學(xué)呂海濤
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