歐易酵母文庫助力蘋果花青素合成調(diào)控機(jī)制研究。近日,山東農(nóng)業(yè)大學(xué)郝玉金、由春香教授為共同通訊作者,在ThePlantJournal(IF:6.141)期刊發(fā)表了題為“JasmonateinducesanthocyaninandproanthocyanidinbiosynthesisinapplebymediatingtheJAZ1-TRB1-MYB9complex”的研究論文,報(bào)道了茉莉酸通過介導(dǎo)JAZ1-TRB1-MYB9復(fù)合物誘導(dǎo)蘋果中花青素和原花青素的生物合成。山東農(nóng)業(yè)大學(xué)安建平博士為***作者,文章中酵母文庫實(shí)驗(yàn)由歐易生物協(xié)助完成。酵母單雜交技術(shù)是在酵母雙雜基礎(chǔ)上發(fā)展而來的一種研究核酸。上海品質(zhì)酵母文庫報(bào)價(jià)
酵母雙雜交技術(shù),自創(chuàng)建以來被廣泛應(yīng)用于蛋白互作研究領(lǐng)域,在生命科學(xué)的基礎(chǔ)探秘研究中起著重要作用。然而該技術(shù)設(shè)計(jì)初衷,*是斯坦利先生為了完成申請(qǐng)學(xué)校經(jīng)費(fèi)的目的。該技術(shù)設(shè)計(jì)巧妙,它的許多優(yōu)點(diǎn)在設(shè)計(jì)之初并未顯現(xiàn),反而在這么多年的高頻使用和進(jìn)一步開發(fā)利用過程中越發(fā)明顯。(引用自MarcVidal&StanleyFields的“Theyeasttwo-hybridassay:stillfindingconnectionsafter25years”):(1)盡管酵母雜交技術(shù)揭示了蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)的詳細(xì)信息,但操作簡(jiǎn)單。只需2個(gè)質(zhì)粒+1個(gè)菌株即可完成,且有不同體系方便選擇。(2)該技術(shù)利用比較好的DNA結(jié)合位點(diǎn),有效的***結(jié)構(gòu)域和友好的報(bào)告基因系統(tǒng),可以放大弱互作的信號(hào)。(3)該技術(shù)可用于各種物種的蛋白互作檢測(cè),具有物種普適性,尤其是人類蛋白。(4)衍生技術(shù)具有更***的應(yīng)用,可擴(kuò)展到檢測(cè)蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)與RNA、蛋白質(zhì)與小分子以及其他組合之間的相互作用,甚至可實(shí)現(xiàn)將生理相互作用與表型數(shù)據(jù)直接關(guān)聯(lián)。當(dāng)然,做過酵母雜交實(shí)驗(yàn)的小伙伴應(yīng)該都了解,互作結(jié)果的判斷,往往要等酵母生長(zhǎng)好幾天才能看出來(當(dāng)然,小歐認(rèn)為這在偉大的科研事業(yè)過程中算不上啥),互作強(qiáng)弱也是主觀判斷性較強(qiáng),存在假陽性。遼寧酵母文庫多少錢酵母三雜交酵母文庫數(shù)據(jù)庫。
酵母雙雜交還可以這么用?Y2H-seq 揭示不老松年齡。***小歐又給大家?guī)砹艘黄湍鸽p雜交結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用文章。北京林業(yè)大學(xué)鈕世輝老師團(tuán)隊(duì),在傳統(tǒng)的酵母雙雜交技術(shù)流程基礎(chǔ)上,巧妙的結(jié)合了NGS技術(shù),優(yōu)化建立了Y2H-seq技術(shù),**縮短了常規(guī)的篩庫后測(cè)序驗(yàn)證周期,節(jié)約了實(shí)驗(yàn)成本。文章中應(yīng)用Y2H-seq技術(shù),對(duì)不老松年齡密碼進(jìn)行了有趣的研究,其中所用酵母雙雜交文庫由歐易生物協(xié)助完成。眾所周知,酵母雙雜交技術(shù)是研究蛋白相互作用的利器。目前已知的蛋白質(zhì)相互作用至少有一半是通過酵母雙雜交技術(shù)發(fā)現(xiàn)的。但是做過酵母雜交實(shí)驗(yàn)的小伙伴也都知道蛋白篩選較容易,但是篩選后,想知道獲得的陽性克隆都對(duì)應(yīng)的是啥基因,所花費(fèi)的人力物力相當(dāng)不小。有困難解決困難,勇敢牛牛不怕困難。
水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選服務(wù):近幾年,中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心王二濤課題組在植物根瘤共生和菌根共生領(lǐng)域取得三項(xiàng)可以寫入教科書級(jí)的研究成果。尤其是近兩年,已經(jīng)連續(xù)發(fā)表了Cell、Nature、MP和PNAS等高水平文章。此外,王二濤研究員也是第二屆"科學(xué)探索獎(jiǎng)"的獲得者,肯定他在植物-微生物共生營(yíng)養(yǎng)交換和菌根共生信號(hào)受體發(fā)現(xiàn)方面的貢獻(xiàn)。2021年10月12日,分子植物***中心王二濤研究團(tuán)隊(duì)在Cell上發(fā)表題為“磷信號(hào)中樞網(wǎng)絡(luò)調(diào)控菌根共生)”的封面論文。***繪制了水稻-叢枝菌根共生的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)植物直接磷營(yíng)養(yǎng)吸收途徑(根途徑)和共生磷營(yíng)養(yǎng)吸收途徑(共生途徑)均是受到植物的磷信號(hào)網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)一調(diào)控,回答了菌根共生領(lǐng)域"自我調(diào)節(jié)"這一困擾領(lǐng)域的重要科學(xué)問題。歐易生物CEO肖云平先生也參與了此項(xiàng)研究。文中水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選服務(wù)由歐易生物提供。酵母文庫雙雜交技術(shù)及應(yīng)用。
通過傳統(tǒng)的酵母雙雜交系統(tǒng),以PtDAL1為誘餌,篩選樣本來源于不同年齡段的油松cDNA文庫。將獲得的陽性克隆,10個(gè)一組,挑選到1個(gè)96孔板的PCR板孔中,獲得10*96個(gè)陽性克隆的96孔板。以其中陽性克隆mix為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并將所有的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化。使用純化后的PCR產(chǎn)物,進(jìn)行打斷后構(gòu)建二代測(cè)序文庫,通過NGS測(cè)序,獲得6G的陽性克隆數(shù)據(jù)。通過分析二代測(cè)序數(shù)據(jù),獲得陽性克隆基因信息(去冗余后獲得135個(gè)互作子,包含21個(gè)TFs,2個(gè)TRs及酶類、熱激蛋白、RNA結(jié)合等蛋白,部分見表1)。挑選重要的候選基因進(jìn)行一對(duì)一驗(yàn)證(圖2)。與擬南芥中同源基因AGL6的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行比對(duì)分析。對(duì)DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表達(dá)譜、啟動(dòng)子中的順勢(shì)作用元件功能進(jìn)行分析,并對(duì)DIPs進(jìn)行GO注釋(圖3)。綜合生信分析結(jié)果,構(gòu)建針葉樹老化途徑的調(diào)控模型(圖4)。酵母三雜交系統(tǒng)原理酵母雙雜交文庫構(gòu)建。遼寧酵母文庫多少錢
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酵母雙雜交文庫:為研究松樹生長(zhǎng)時(shí)相轉(zhuǎn)變和生殖發(fā)育的奧秘,本研究收集了油松 7 個(gè)年齡段的葉片進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)鑒定到一個(gè)與年齡***相關(guān)的基因模塊(圖 A)。按照表達(dá)模式,可以分為 2 個(gè)子模塊:隨年齡增長(zhǎng)而表達(dá)上升的基因子模塊、隨年齡增長(zhǎng)而表達(dá)降低的基因子模塊(圖 B-D)。這些基因在 5-7 年?duì)I養(yǎng)生長(zhǎng)至生殖生長(zhǎng)過渡期發(fā)生了一個(gè)明顯的表達(dá)模式轉(zhuǎn)變,表明在生殖發(fā)育啟動(dòng)階段存在一個(gè)相對(duì)劇烈的時(shí)相轉(zhuǎn)變過程。上海品質(zhì)酵母文庫報(bào)價(jià)
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