遼寧定量蛋白組學(xué)

來源: 發(fā)布時間:2022-06-13

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對三個脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個蛋白質(zhì)。對測試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個試驗(yàn)組之間共有815個差異表達(dá)蛋白。其中,198個(32%)和198個(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(68%)和558個(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。遼寧定量蛋白組學(xué)

蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持);2021年8月,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果,通過蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體可以通過增加ICAM1的表達(dá)來促人腦MECs血管生成,并減輕MPP+對細(xì)胞的損傷,***間充質(zhì)干細(xì)胞衍生外泌體***帕金森的可能性。江西蛋白組學(xué)服務(wù) 廣州單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。

運(yùn)用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供):2022年1月,***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員,廣西醫(yī)科大學(xué)附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作(一作:萬祿明、鄧永強(qiáng)、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天)在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通過磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、LC-MS靶向代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了一個全新的糖異生調(diào)控***——GP73,***會誘導(dǎo)GP73的產(chǎn)生和分泌,從而導(dǎo)致過度的糖異生。

TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺的蛋白組學(xué)近年來備受青睞,穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組,18個樣本以內(nèi),可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級,避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng),能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時對更多蛋白質(zhì)鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。

本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強(qiáng)的機(jī)理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān),鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究內(nèi)容 研究意義背景。內(nèi)蒙古生信分析蛋白組學(xué)

一站式服務(wù),研究不同生物體在不同時刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。遼寧定量蛋白組學(xué)

為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊(duì)列和大腦區(qū)域,使用 TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個隊(duì)列的所有組織,為每個隊(duì)列生成蛋白質(zhì)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),并評估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個隊(duì)列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊(duì)列和大腦區(qū)域(圖2b)。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā),建立蛋白共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標(biāo)志物,并為治療帶來希望。遼寧定量蛋白組學(xué)

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