重慶空間代謝組學(xué)鹿明

空間代謝組學(xué)：質(zhì)譜成像方法提供了一種直接獲取代謝網(wǎng)絡(luò)信息的途徑，以系統(tǒng)地深入了解大腦的代謝活動?；贙EGG數(shù)據(jù)庫的Metaboanalyst軟件進行代謝網(wǎng)絡(luò)分析。共找到20條KEGG代謝通路，包含126個具有微區(qū)信息的代謝物，圖2顯示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代謝、花生四烯酸代謝、精氨酸和脯氨酸代謝、肌酸途徑、GABA能突觸、葡萄糖代謝、谷胱甘肽代謝、甘油磷脂代謝、甘氨酸-絲氨酸和蘇氨酸的代謝、組氨酸代謝、賴氨酸代謝、苯丙氨酸代謝、多胺代謝途徑、嘌呤代謝、嘧啶代謝和TCA循環(huán)、色氨酸代謝、酪氨酸代謝、纈氨酸-亮氨酸和異亮氨酸代謝和類固醇***合成途徑。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實現(xiàn)生物上千代謝物的定性。重慶空間代謝組學(xué)鹿明

空間代謝組學(xué)：中文標題：糞便宏基因組和血清代謝組的整合分析揭示腸道微生物組相關(guān)代謝物在結(jié)直腸*和腺瘤檢測的作用研究對象：人糞便、血清、組織發(fā)表期刊：Gut影響因子：23.059發(fā)表時間：2021年8月發(fā)表單位：國家**中心中國醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院運用生物技術(shù)：AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、LC-MS非靶代謝組、宏基因組、靶向代謝組學(xué)空間代謝組學(xué)由賀玖明教授團隊提供技術(shù)支持。結(jié)直腸*（CRC）的早期診斷是提高患者生存率的有效方式。目前臨床常用的非侵入性和入侵式檢測方法因其準確率低或?qū)颊咴斐蓚?，大?guī)模使用仍受限制。因此，發(fā)展無創(chuàng)且準確的檢測方法變得尤為重要。重慶空間代謝組學(xué)鹿明一文讀懂空間代謝組學(xué):DESI-IMS與MALDI-IMS的區(qū)別。

作者進行了空間代謝組學(xué)(～50μm的空間分辨率)，并根據(jù)m/z848.63和m/z844.52對主要的髓鞘標志物進行了成像，推測它們分別屬于Cer(D18：1/24：1)和PC(38：6)(圖2G)。白質(zhì)和灰質(zhì)的代表性質(zhì)譜如圖2H所示。結(jié)果表明，使用拉曼光譜結(jié)構(gòu)信息和空間代謝組學(xué)對髓鞘中的脂質(zhì)進行特定的成分分析是可能的。對單個有髓組織成分光譜的分析證實，構(gòu)成有髓組織光譜的主要分子是脂質(zhì)，包括腦苷脂、膽固醇、鞘磷脂、磷脂酰膽堿，以及程度較小的蛋白質(zhì)(圖2F)。

空間代謝組學(xué)能夠在復(fù)雜的EA微環(huán)境中區(qū)分組織類型，本文作者使用兩個隊列對食管腺*的甘油磷脂特征進行了表征。**初運用空間代謝組學(xué)對連續(xù)患者的成對手術(shù)切除活檢(EA和MHEE)進行甘油磷脂差異分析；（樣本策略）選擇這種取樣方法的目的是為了進行手術(shù)切緣分析，并通過取樣更大的樣本來克服**的區(qū)域代謝組學(xué)差異。接下來，采用內(nèi)窺鏡活檢對第二組人群進行采樣。這樣就可以從健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上獲得標本。這樣還使作者能夠驗證***個隊列的發(fā)現(xiàn)，調(diào)查該技術(shù)在小樣本上的表現(xiàn)，并演示在內(nèi)鏡套件中促進診斷的第二次臨床應(yīng)用?？臻g代謝組學(xué)二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學(xué)樣品信息的認知。

空間代謝組學(xué)研究：一區(qū) | IF:14.553多發(fā)性硬化癥的相關(guān)空間代謝組學(xué)研究。本文為倫敦帝國理工學(xué)院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發(fā)表的題為“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果，通過拉曼+空間代謝組學(xué)+IHC研究方法，發(fā)現(xiàn)了新形成的髓鞘與正常髓鞘具有不同的脂質(zhì)成分，探究了多發(fā)性硬化中再髓鞘化形成的機理，描繪了用于關(guān)聯(lián)生物分子結(jié)構(gòu)和髓鞘成分的分子成像圖譜，為評估再髓鞘化***提供新策略?？臻g代謝組技術(shù)流程 。重慶空間代謝組學(xué)鹿明

空間分辨代謝組學(xué)代謝組相關(guān)材料。重慶空間代謝組學(xué)鹿明

隊列1：收集手術(shù)切除的食管腺*（EA）組織和與之匹配的健康食管上皮組織（MHEE）。隊列2：收集健康食管上皮組織（來自健康志愿者，HEE）和未經(jīng)***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活檢樣本，用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進程中甘油磷脂的變化，以及隊列1的外部驗證。樣本制備：樣本制成冰凍組織切片，并結(jié)合H&E染色。研究方法：空間代謝組學(xué)；qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達；細胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因；免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶的表達。重慶空間代謝組學(xué)鹿明

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