福建蛋白組學 中藥

來源: 發(fā)布時間:2022-06-06

iTRAQ標記蛋白組學研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標記蛋白組學+轉(zhuǎn)錄組學研究方法,探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標題:iTRAQ標記蛋白質(zhì)組學分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象:白菜型冬油菜發(fā)表期刊:ScientificReports影響因子:4.17蛋白組學翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。福建蛋白組學 中藥

隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學建立了新的標準。CCS 值的加入讓組學結(jié)果更精細,也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學分析,在短梯度下實現(xiàn)蛋白深度覆蓋。福建蛋白組學 中藥研究機構(gòu),提供蛋白組學聯(lián)合分析,技術(shù)咨詢服務(wù)。

蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊列相比,本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復和細胞周期通路的上調(diào)以及細胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)(圖1F和1G)。

label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學的理解,加速了靶向***的進程。中國科學家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征,如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結(jié)果。一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學區(qū)別在哪。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)研究方法,發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征,探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機理,描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。蛋白驗證新技術(shù)-PRM,平行反應(yīng)監(jiān)視蛋白組學。內(nèi)蒙古蛋白組學研究是什么

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本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記的蛋白質(zhì)組學和平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應(yīng)激生理學檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。福建蛋白組學 中藥

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