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本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強(qiáng)的機(jī)理和低溫脅迫對(duì)冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān),鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,對(duì)提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。上海非標(biāo)記定量蛋白組學(xué)
蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達(dá)的趨勢(shì),同時(shí)***上調(diào)了GLUT2。與對(duì)照組相比,AC***增加了PEPCK的表達(dá),兩種化學(xué)物質(zhì)對(duì)G6Pase均無***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測(cè)定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。遼寧磷酸化蛋白組學(xué)北京蛋白組學(xué)問題解答知乎都做不到哦。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究:2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通過iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對(duì)香菇菌絲進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程,并對(duì)其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機(jī)制有了新的認(rèn)識(shí)。涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品:iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個(gè)磷酸化蛋白的62,879個(gè)磷酸化位點(diǎn)?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個(gè)***改變的**驅(qū)動(dòng)基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊(duì)列相比,本文隊(duì)列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊(duì)列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細(xì)胞周期通路的上調(diào)以及細(xì)胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進(jìn)一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)(圖1F和1G)。單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。
采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中,198個(gè)(32%)和198個(gè)(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(gè)(68%)和558個(gè)(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。蛋白質(zhì)組學(xué)的特點(diǎn)蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。上海非標(biāo)記定量蛋白組學(xué)
蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。上海非標(biāo)記定量蛋白組學(xué)
蛋白質(zhì)磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)特定氨基酸上的過程,是生物體內(nèi)**為常見、**為重要的翻譯后修飾之一。生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是一個(gè)瞬時(shí)且可逆的過程,通過磷酸化修飾可以改變蛋白質(zhì)空間構(gòu)象,從而影響蛋白質(zhì)的定位、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來,一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域,是國(guó)內(nèi)早期開展以蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實(shí)驗(yàn)與分析的團(tuán)隊(duì)。影響因子:13.511發(fā)表時(shí)間:2022-01-06發(fā)表單位:***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所運(yùn)用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供)、LC-MS靶向代謝組學(xué)上海非標(biāo)記定量蛋白組學(xué)
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司主要經(jīng)營(yíng)范圍是醫(yī)藥健康,擁有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和良好的市場(chǎng)口碑。歐易生物致力于為客戶提供良好的科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識(shí),遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。歐易生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。