蘇州進(jìn)口數(shù)字PCR分析應(yīng)用

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-01-15

在PCR進(jìn)行的過程中,首先是引物和探針分別結(jié)合,然后開始擴(kuò)增。如果一個(gè)微滴當(dāng)中有目標(biāo)基因的片段,Taqman探針就會(huì)被酶切碎,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離。在后面的檢測過程中,熒光基團(tuán)被激發(fā)光路激發(fā)之后就會(huì)發(fā)熒光。如果沒有,Taqman探針就不會(huì)被切碎,在后面的檢測過程中,熒光基團(tuán)吸收到激發(fā)光的能量,就會(huì)被淬滅基團(tuán)給淬滅,那么儀器就檢測不到這個(gè)微滴的信號(hào)。檢測的過程中,并不是說一個(gè)樣本中檢測到了幾個(gè)亮點(diǎn),這個(gè)反應(yīng)當(dāng)中就有幾個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因?yàn)槟繕?biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個(gè)發(fā)光的微滴中,可能有一個(gè)或者三個(gè)四個(gè),甚至更多個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對一的對應(yīng)關(guān)系。我國數(shù)字PCR市場的整體規(guī)模、公司影響力、行業(yè)話語權(quán)等也將迎來進(jìn)一步提升,從而助推行業(yè)高質(zhì)量創(chuàng)新發(fā)展。蘇州進(jìn)口數(shù)字PCR分析應(yīng)用

數(shù)字PCR系統(tǒng)的分散方式?jīng)Q定了分散數(shù)量,其結(jié)果基于統(tǒng)計(jì)的方法進(jìn)行定量,增加反應(yīng)單元數(shù)量(統(tǒng)計(jì)樣本量),可以增加其檢測的容量和動(dòng)態(tài)檢測線性范圍達(dá)到和qPCR相近的動(dòng)態(tài)范圍,同時(shí)減小一個(gè)反應(yīng)單元中包含多個(gè)分子所造成的誤差,達(dá)到提高靈敏度和準(zhǔn)確度。影響dPCR定量結(jié)果的因素包括:儀器采用的分散方式與數(shù)量、溶液稀釋方法、分散體積的準(zhǔn)確性以及結(jié)果表達(dá)方式。分散方式與數(shù)量由數(shù)字PCR系統(tǒng)決定,分散體積和結(jié)果表達(dá)方式需要實(shí)驗(yàn)人員在實(shí)驗(yàn)過程中優(yōu)化得到。德國微滴式數(shù)字PCR儀器數(shù)字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一種核酸分子定量技術(shù)。

Drop-off實(shí)驗(yàn)包括兩個(gè)針對相同擴(kuò)增子的TaqMan探針:與野生型序列互補(bǔ)而與突變位點(diǎn)不發(fā)生互補(bǔ)的Drop-off探針和與突變型和野生型基因都互補(bǔ)的Reference探針(如圖1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探針和Reference探針都將與目標(biāo)雜交,產(chǎn)生雙重陽性信號(hào)(如圖1B,藍(lán)色群)。相反,如果存在突變的等位基因,即使一個(gè)核苷酸的突變也會(huì)阻止Drop-off探針與之雜交,因此只有Reference探針對目標(biāo)基因進(jìn)行退火,從而得到一個(gè)陽性信號(hào)。

數(shù)字PCR是一種核酸分子定量技術(shù)。當(dāng)前核酸分子的定量有三種方法,光度法基于核酸分子的吸光度來定量;實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RealTimePCR)基于Ct值,Ct值就是指可以檢測到熒光值對應(yīng)的循環(huán)數(shù);數(shù)字PCR是的定量技術(shù),基于單分子PCR方法來進(jìn)行計(jì)數(shù)的核酸定量,是一種定量的方法。主要采用當(dāng)前分析化學(xué)熱門研究領(lǐng)域的微流控或微滴化方法,將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個(gè)反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個(gè)。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個(gè)核酸分子模板的反應(yīng)器就會(huì)給出熒光信號(hào),沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號(hào)。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測。

對于檢測需要高靈敏度以及技術(shù)確認(rèn)的情況下,數(shù)字PCR技術(shù)也可以發(fā)揮重要作用。技術(shù)數(shù)據(jù)表明,數(shù)字PCR技術(shù)對的比較低檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。經(jīng)測試,數(shù)字PCR在檢測和診斷的某些方面優(yōu)于金標(biāo)準(zhǔn)qPCR,尤其是在低病毒載量樣本中,相比起qPCR,數(shù)字PCR特異性、靈敏度、重現(xiàn)性和檢測限受影響更小。因此,未來預(yù)計(jì)數(shù)字PCR技術(shù)也將在類疾病中得到更加廣的應(yīng)用。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測。通過數(shù)字PCR技術(shù)可建立多重?zé)晒怏w系,用于同時(shí)檢測比如非小細(xì)胞肺中常見的MET和HER2耐藥擴(kuò)增。有研究報(bào)道,使用數(shù)字PCR技術(shù)對436例非小細(xì)胞肺樣品進(jìn)行檢測,并挑選樣本驗(yàn)證了數(shù)字PCR與RNA fish的檢測一致性。結(jié)果表明,該數(shù)字PCR技術(shù)在保證了基因擴(kuò)增檢測準(zhǔn)確性的同時(shí),還節(jié)約了檢測時(shí)間。Drop-off數(shù)字PCR檢測方法的**主要優(yōu)勢是能夠能夠在一個(gè)反應(yīng)中檢測到基因組序列范圍短的同源基因突變。德國臻準(zhǔn)數(shù)字PCR解決方案

無創(chuàng)產(chǎn)前篩查有望成為數(shù)字PCR在臨床快速落地的應(yīng)用。蘇州進(jìn)口數(shù)字PCR分析應(yīng)用

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