PCR常使用目標序列的拷貝數(shù)或某一給定樣品中轉(zhuǎn)基因的百分比來體現(xiàn)方法靈敏度。由于qPCR和dPCR實驗過程所用試劑的兼容性較好,在使用dPCR進行轉(zhuǎn)基因檢測時,通常直接參照qPCR的方法。使用不同技術(shù)對相同樣品檢測時,兩種方法的靈敏度是否具有可比性成為關(guān)注的問題。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765個微單元)芯片數(shù)字PCR分析儀測定標準物質(zhì)ERM-AD413檢測轉(zhuǎn)基因玉米MON810。該小組應(yīng)用dPCR技術(shù)評估在qPCR定義下的靈敏度數(shù)值,在拷貝數(shù)200-700之間,dPCR與qPCR的測量結(jié)果具有一致性。但與qPCR的靈敏度相比,dPCR在低于拷貝數(shù)200時有被低估的風(fēng)險,在高于拷貝數(shù)1000時有被高估的風(fēng)險。dPCR在同一陣列上同時測量轉(zhuǎn)基因和內(nèi)源性靶點時,需要稀釋內(nèi)源性靶點和轉(zhuǎn)基因靶點在合理拷貝數(shù)范圍內(nèi)以保證dPCR測量結(jié)果的準確性。數(shù)字PCR的兩大應(yīng)用場景在于基因檢測、無創(chuàng)出生缺陷篩查。廣州數(shù)字PCR市場前景
數(shù)字PCR技術(shù)流分類目前,dPCR的基本方法都已經(jīng)建立,根據(jù)反應(yīng)單元的不同形式,主要可分為微板式、微腔式和和微滴式三大類系統(tǒng)。微液滴制備的方法,目前主流的有四種:1)芯片微孔物理分割法,俗稱物理分隔法,公司有Fluidgm,Qiagen,Roche,ThermoFisher,;2)液滴分割法,俗稱油包水,代替公司有Bio-Rad;3)雜交式芯片液滴法,公司有Stilla;4)注射振動制滴法。PS:芯片式物理分割技術(shù)所有已經(jīng)過期,目前有不少公司在這個技術(shù)的基礎(chǔ)上進行開發(fā),例如羅氏。蘇州一體化數(shù)字PCR分析應(yīng)用dPCR的結(jié)果統(tǒng)計方式有2種,一種是采用標記多種顏色,另一種采用概率統(tǒng)計的數(shù)據(jù)處理方法。
由于現(xiàn)有的商業(yè)化數(shù)字PCR設(shè)備在物理上只設(shè)置了2個檢測通道,所以存在一個明顯的短板:不能同時進行多個位點的檢測。在樣品多位點的檢測中,就需要更多的起始樣品,但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實現(xiàn)多重檢測。為了考察利用數(shù)字PCR實現(xiàn)多重檢測的可能性,英國TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細胞肺相關(guān)的KRAS基因為檢測對象,在Bio-Rad的數(shù)字PCR系統(tǒng)上通過3個三重ddPCR檢測體系來實現(xiàn)9個KRAS突變位點的檢測。
在PCR進行的過程中,首先是引物和探針分別結(jié)合,然后開始擴增。如果一個微滴當中有目標基因的片段,Taqman探針就會被酶切碎,熒光基團和淬滅基團分離。在后面的檢測過程中,熒光基團被激發(fā)光路激發(fā)之后就會發(fā)熒光。如果沒有,Taqman探針就不會被切碎,在后面的檢測過程中,熒光基團吸收到激發(fā)光的能量,就會被淬滅基團給淬滅,那么儀器就檢測不到這個微滴的信號。檢測的過程中,并不是說一個樣本中檢測到了幾個亮點,這個反應(yīng)當中就有幾個目標基因的拷貝。因為目標基因的片段,在微滴當中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進不進的概率相等,并且相互獨立)。所以,一個發(fā)光的微滴中,可能有一個或者三個四個,甚至更多個目標基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對一的對應(yīng)關(guān)系。全自動數(shù)字PCR平臺,讓數(shù)字PCR真正邁入新時代,助推數(shù)字PCR普及應(yīng)用。
根據(jù)泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們設(shè)微液滴總數(shù)為N,投入的靶序列拷貝數(shù)為M,那么“每個微液滴中的靶序列拷貝數(shù)”的概率分布是近似滿足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點,在檢測的過程中,并不是說一個樣本中檢測到了幾個亮點,這個反應(yīng)當中就有幾個目標基因的拷貝。因為目標基因的片段,在微滴當中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進不進的概率相等,并且相互獨立)。所以,一個發(fā)光的微滴中,可能有一個或者三個四個,甚至更多個目標基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對一的對應(yīng)關(guān)系。在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊證的申報。珠三角賽默飛數(shù)字PCR解決方案
拷貝數(shù)變異、突變檢測、基因相對表達研究、二代測序結(jié)果驗證、miRNA表達分析、單細胞基因表達分析等。廣州數(shù)字PCR市場前景
PCR已成為分子診斷領(lǐng)域重要的技術(shù)手段之一,占據(jù)分子診斷市場的半壁江山。數(shù)字PCR是一代PCR技術(shù),也是當前靈敏度和定量精度比較高的分子檢測技術(shù)。但數(shù)字PCR使用成本仍然相對較高,檢測靶點數(shù)少(一般≤6靶點/反應(yīng)),阻礙了其在臨床中的大規(guī)模應(yīng)用,提高數(shù)字PCR的多重檢測能力迫在眉睫?;跓晒馔ǖ罃?shù)的增加和基于探針濃度梯度增加,均可以在一定程度上提高數(shù)字PCR檢測重數(shù),然而只能達到"線性"增加的目的?;谔结槤舛忍荻鹊亩嘀貦z測技術(shù)雖然光'f明顯增加多重能力,但由于無法避免交叉反應(yīng)現(xiàn)象,不能確保獲得位點特異性的分簇,因此穩(wěn)定性不足、靈敏度較差,難以滿足臨床級別的數(shù)據(jù)要求。而基于創(chuàng)新的且數(shù)字PCR獨特適用的熒光編碼技術(shù)可以實現(xiàn)“指數(shù)”級的多重檢測,顛覆性的提高數(shù)字PCR檢測重數(shù),覆蓋臨床應(yīng)用多場景需求。廣州數(shù)字PCR市場前景
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司是一家從事數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀研發(fā)、生產(chǎn)、銷售及售后的服務(wù)型企業(yè)。公司坐落在廣州市黃埔區(qū)銳豐三街4號617房,成立于2015-04-17。公司通過創(chuàng)新型可持續(xù)發(fā)展為重心理念,以客戶滿意為重要標準。公司主要經(jīng)營數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀等產(chǎn)品,產(chǎn)品質(zhì)量可靠,均通過精細化學(xué)品行業(yè)檢測,嚴格按照行業(yè)標準執(zhí)行。目前產(chǎn)品已經(jīng)應(yīng)用與全國30多個省、市、自治區(qū)。廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司研發(fā)團隊不斷緊跟數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀行業(yè)發(fā)展趨勢,研發(fā)與改進新的產(chǎn)品,從而保證公司在新技術(shù)研發(fā)方面不斷提升,確保公司產(chǎn)品符合行業(yè)標準和要求。廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司注重以人為本、團隊合作的企業(yè)文化,通過保證數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀產(chǎn)品質(zhì)量合格,以誠信經(jīng)營、用戶至上、價格合理來服務(wù)客戶。建立一切以客戶需求為前提的工作目標,真誠歡迎新老客戶前來洽談業(yè)務(wù)。