PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))是利用DNA在體外攝氏95°高溫時(shí)變性會(huì)變成單鏈,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時(shí)引物與單鏈按堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則結(jié)合,再調(diào)溫度至DNA聚合酶適反應(yīng)溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補(bǔ)鏈。PCR儀實(shí)際就是一個(gè)溫控設(shè)備,能在95℃,55℃,72℃之間很好地進(jìn)行溫度控制。PCR擴(kuò)增儀又稱為PCR基因擴(kuò)增儀、PCR核酸擴(kuò)增儀、聚合酶鏈反應(yīng)核酸擴(kuò)增儀,是利用PCR(Polymerasechainreaction,聚合酶鏈反應(yīng))技術(shù)對(duì)特定DNA擴(kuò)增的一種儀器設(shè)備,被運(yùn)用于醫(yī)學(xué)、生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中,例如用于判斷檢體中是否會(huì)表現(xiàn)某遺傳疾病的圖譜、傳染病的診斷、基因復(fù)制以及親子鑒定等。 DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。實(shí)時(shí)熒光PCR儀詢問報(bào)價(jià)
目前,采用熒光定量PCR檢測(cè)技術(shù)可以對(duì)淋球菌、沙眼衣原體、解脲支原體、人類瘤病毒、單純皰疹病毒、人類免疫缺陷病毒、肝炎病毒、流感病毒、結(jié)核分枝桿菌、EB病毒和巨細(xì)胞病毒等病原體進(jìn)行定量測(cè)定。與傳統(tǒng)的檢測(cè)方法相比具有靈敏度高、取樣少、快速簡便等優(yōu)點(diǎn)。如:結(jié)核菌基因診斷的意義主要表現(xiàn)在:a.區(qū)分TB與其它分枝桿菌;b.檢測(cè)TB耐藥基因;c.提高TB的陽性檢出率。⑵產(chǎn)前診斷到目前為止,人們對(duì)遺傳性物質(zhì)改變引起的遺傳性疾病還無法,只能通過產(chǎn)前監(jiān)測(cè),減少病嬰出生,以防止各類遺傳性疾病的發(fā)生,如為減少X連鎖遺傳病患兒的出生,從孕婦的外周血中分離胎兒DNA,用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)其Y性別決定區(qū)基因是一種無創(chuàng)傷性的方法,易為孕婦所接受。⑶藥物療效考核對(duì)乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)定量分析顯示:病毒量與某些藥物的療效關(guān)系。HCV高水平表達(dá),干擾素作用不敏感,而HCV低滴度,干擾素作用敏感;在拉米夫定過程中,HBV-DNA的血清含量曾有下降,隨后若再度上升或超出以前水平,則提示病毒發(fā)生變異。如PCR技術(shù)在HBV檢測(cè)中的應(yīng)用及意義:a.了解乙肝病毒在體內(nèi)存在的數(shù)量。b.是否復(fù)制。c.是否傳染,傳染性有多強(qiáng)。d.是否有必要服藥。 實(shí)時(shí)熒光PCR儀詢問報(bào)價(jià)PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物.
基因擴(kuò)增儀因操作方便、運(yùn)行速度快、實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確,受到越來越多的分子生物學(xué)研究者青睞。面對(duì)各種不同性能的基因擴(kuò)增儀,又該如何選擇呢?基因擴(kuò)增儀的選購誤區(qū)誤區(qū)一:儀器通道越多越好隨著基因擴(kuò)增技術(shù)的成熟運(yùn)用,多重?cái)U(kuò)增越來越熱鬧,基因擴(kuò)增儀也不能幸免。從單通道基因擴(kuò)增儀發(fā)展到如今各個(gè)廠家都推出4通道、5通道甚至6通道基因擴(kuò)增儀,眼花繚亂的選擇讓人無所適從,就有人一不小心走進(jìn)了“通道越多越好”的誤區(qū)。在使用有些廠家5通道的基因擴(kuò)增儀時(shí),為了確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的精確性和準(zhǔn)確性都要在實(shí)驗(yàn)中使用ROX或Referencedye,這些熒光染料都必須單獨(dú)使用一個(gè)檢測(cè)通道。這樣以來,真正能檢測(cè)多重PCR熒光信號(hào)的有效通道只有4個(gè),而且使用校正染料可能會(huì)增加后期的使用成本??紤]多重基因擴(kuò)增儀的通道數(shù)的時(shí)候也應(yīng)該從實(shí)驗(yàn)室實(shí)際情況出發(fā),多重基因擴(kuò)增儀并非人人適用、人人可用,因?yàn)樗箤?shí)驗(yàn)復(fù)雜化了。誤區(qū)二:基因擴(kuò)增儀無需梯度功能對(duì)于使用染料法的定量PCR反應(yīng),雖然有各種各樣的PCR引物設(shè)計(jì)軟件或者經(jīng)驗(yàn)公式計(jì)算熔解溫度(Tm值),但運(yùn)用的公式不同、引物序列不同,Tm值的差異會(huì)很大。引物的熔解溫度決定了退火溫度。而且模版中堿基的組合千變?nèi)f化,對(duì)于特殊片斷。
1.一般性原則(1)長度:一般引物互補(bǔ)區(qū)的長度為16-25bp,引物互補(bǔ)區(qū)的4×(G十C)十2×(A十T)不要沒有必要大于70,一般也不要低于50(2)G十c含量:好在45%一55%之間,但有時(shí)受模板限制,無法理想化。但在有幾種選擇時(shí),可以把G十c含量接近50%作為參數(shù)之一(3)堿基分布的隨機(jī)性:應(yīng)避免連續(xù)出現(xiàn)4個(gè)以上的單一堿基。尤其是不應(yīng)在其3’端出現(xiàn)超過3個(gè)的連續(xù)G或C,否則會(huì)使引物在G十C富集序列區(qū)錯(cuò)誤引發(fā)。(4)引物自身:不能含有很長的牢固的自身互補(bǔ)序列,尤其是引物3‘端回折形成的發(fā)夾不要一般超過3堿基,否則會(huì)影響引物與模板的結(jié)合(5)引物之間:兩個(gè)引物之間不應(yīng)有很長的牢固的互補(bǔ)或同源堿基,尤應(yīng)避免3’端的互補(bǔ)重疊。2.具體原則①引物長度;特異性一般通過引物長度和退火溫度控制。如果PCR的退火溫度設(shè)置在近于引物Tm值(引物/模板雙鏈體的解鏈溫度)幾度的范圍內(nèi),18到24個(gè)堿基的寡核苷酸鏈?zhǔn)怯泻芎玫男蛄刑禺愋缘?。引物越長,擴(kuò)增退火時(shí)被引發(fā)的模板越少。為優(yōu)化PCR反應(yīng),使用確保溶解溫度不低于54℃的短的引物,可獲得好的效率和特異性。總的來說,好在特異性允許的范圍內(nèi)尋求安全性。每增加一個(gè)核苷酸,引物特異性提高4倍;這樣,大多數(shù)應(yīng)用的短引物長度為18個(gè)核苷酸。 基于聚合酶制造的PCR儀實(shí)際就是一個(gè)溫控設(shè)備,能在變性溫度,復(fù)性溫度,延伸溫度之間很好地進(jìn)行控制。
PCR實(shí)驗(yàn)室又叫基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn),是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于放大特定的DNA的片段,可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。通過DNA基因追蹤系統(tǒng),能迅速掌握生物體內(nèi)的病毒含量,其精確度高達(dá)納米級(jí)別。PCR實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行的條件1、必須擁有標(biāo)準(zhǔn)的的PCR熒光實(shí)驗(yàn)室實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)于1996年由美國AppliedBiosystems公司推出,由于該技術(shù)不實(shí)現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規(guī)PCR相比,它有特異性更強(qiáng)、有效解決PCR污染問題、自動(dòng)化程度高等特點(diǎn),目前已得到廣泛應(yīng)用。2、檢測(cè)設(shè)備必須符合標(biāo)準(zhǔn)PCR熒光實(shí)驗(yàn)室設(shè)置要求熒光定量PCR儀+實(shí)時(shí)熒光定量試劑+通用電腦+自動(dòng)分析軟件,構(gòu)成PCR-DNA/RNA實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)系統(tǒng)。3、必須通過國家臨床檢驗(yàn)中心的驗(yàn)收和認(rèn)證;4、檢測(cè)人員必須通過國家臨檢中心業(yè)務(wù)培訓(xùn)并取得合格證書。PCR實(shí)驗(yàn)室內(nèi)工作人員必須參加由國家衛(wèi)生部或各省臨床檢驗(yàn)中心舉辦的臨床基因擴(kuò)增培訓(xùn)班,并持證上崗。PCR實(shí)驗(yàn)室通過驗(yàn)收,實(shí)驗(yàn)室至少必須應(yīng)有兩個(gè)以上持有“臨床基因檢測(cè)上崗證”。PCR實(shí)驗(yàn)室必須建立嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室管理制度、建立標(biāo)準(zhǔn)化操作程序(SOP)、建立系列質(zhì)量管理文件等。確保實(shí)驗(yàn)室日常運(yùn)行符合國家衛(wèi)生部的要求,確保檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確、確保實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生安全。只要樣本有一個(gè)病原體存在,PCR就可以檢測(cè)到。實(shí)時(shí)熒光PCR儀詢問報(bào)價(jià)
PCR可檢測(cè)不同細(xì)胞類型、組織和生物體在特定時(shí)間點(diǎn)的基因表達(dá)差異。實(shí)時(shí)熒光PCR儀詢問報(bào)價(jià)
并含有能用于探針捕捉雜交實(shí)驗(yàn)的足夠信息。這一長度范圍的產(chǎn)物可以通過采用兩步擴(kuò)增循環(huán)方法得到,從而減少擴(kuò)增時(shí)間。其他PCR方法有不同的佳產(chǎn)物長度。例如,通過定量的RNA-PCR檢測(cè)基因表達(dá)時(shí),產(chǎn)物應(yīng)該足夠大以便構(gòu)成競(jìng)爭性模板,這樣,產(chǎn)物和競(jìng)爭物都能夠在凝膠上很容易的分辨出來。這些產(chǎn)物一般在250~750bp范圍內(nèi)。⑦補(bǔ)充說明若在cDNA序列內(nèi)找尋PCR引物,需特別注意兩點(diǎn):首先,盡力將引物和產(chǎn)物保持在mRNA的編碼區(qū)域內(nèi),因?yàn)檫@是生成蛋白質(zhì)的獨(dú)特序列,不像3’末端非編碼區(qū)域與許多其他mRNA有同源性;第二,盡力把引物放在不同的外顯子上,以便使RNA特異的PCR產(chǎn)物與從污染DNA中產(chǎn)生的產(chǎn)物在大小上相區(qū)別。若PCR的目的是克隆一個(gè)基因或cDNA的特異序列,產(chǎn)物的大小是根據(jù)具體應(yīng)用預(yù)選的。在這里,計(jì)算機(jī)程序可以提供關(guān)于期望區(qū)域側(cè)翼選擇引物對(duì)的信息。在選擇用來擴(kuò)增來自不同物種DNA的引物時(shí),應(yīng)避開mRNA的5’和3’末端非翻譯區(qū)序列,因?yàn)樗鼈兛赡軟]有任何的同源性。3.簡并引物設(shè)計(jì)①設(shè)計(jì)簡并引物時(shí),一定要檢查靶擴(kuò)增區(qū)域選定氨基酸遺傳密碼的簡并度。很顯然,我們期望選擇簡并度低的氨基酸,達(dá)到提高特異性的目的。②充分注意物種對(duì)于密碼子的偏好性。 實(shí)時(shí)熒光PCR儀詢問報(bào)價(jià)
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