病毒全基因組測(cè)序定:探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專(zhuān)門(mén)針對(duì)性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時(shí)探普生物也...
深度測(cè)序和個(gè)性化醫(yī)學(xué)的范式相比,P4醫(yī)學(xué)更強(qiáng)調(diào)早期預(yù)測(cè)和預(yù)防,強(qiáng)調(diào)對(duì)患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)的概念則是在基因測(cè)序普及的基礎(chǔ)上,將整個(gè)個(gè)體的各種信息如生理信息(通過(guò)可穿戴設(shè)備可以即時(shí)監(jiān)控和收集到)和腸道菌群變化、各種組學(xué)信息(深度測(cè)序測(cè)定)整合,進(jìn)行準(zhǔn)...
深度測(cè)序技術(shù)對(duì)經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)的影響:未來(lái)社會(huì)的創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)將由信息技術(shù)向心理社會(huì)健康方面轉(zhuǎn)移。可以預(yù)見(jiàn),全球老年化社會(huì)到來(lái)后的經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)將是健康行業(yè),而以基因測(cè)序預(yù)測(cè)健康和臨床準(zhǔn)確分型的市場(chǎng)將會(huì)越來(lái)越大。深度測(cè)序相關(guān)的經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)有兩個(gè)方面。一是測(cè)序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場(chǎng),二...
全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序。全基因組預(yù)測(cè)的意義揭示了人類(lèi)生、老、病和死的奧秘,使人類(lèi)從根本上認(rèn)知疾病發(fā)生的原因,做到正確的調(diào)整疾病和盡早的預(yù)防疾病。每個(gè)人從開(kāi)始就繼承了父母的DNA遺傳信息,并且攜帶一生,不易改變。全基因組測(cè)序通過(guò)...
未培養(yǎng)病毒基因組的信息標(biāo)準(zhǔn):①關(guān)于未培養(yǎng)病毒基因組標(biāo)準(zhǔn)的信息是在基因組標(biāo)準(zhǔn)框架內(nèi)制定的,包括病毒起源、基因組質(zhì)量、基因組注釋、分類(lèi)信息、生物地理分布和宿主預(yù)測(cè);②UViGs有助于提高我們對(duì)病毒進(jìn)化歷史和病毒-宿主之間相互作用的理解;③病毒基因組組成和內(nèi)容、復(fù)制...
病毒基因組測(cè)序的標(biāo)準(zhǔn)有:測(cè)序的完成程度,決定著基因組的下游應(yīng)用,包括設(shè)計(jì)診斷產(chǎn)品、反向遺傳系統(tǒng)以及開(kāi)發(fā)調(diào)整對(duì)策等。研究團(tuán)隊(duì)希望能夠通過(guò)五條標(biāo)準(zhǔn)來(lái)填補(bǔ)這樣的空白,這些標(biāo)準(zhǔn)涵蓋了完成病毒基因組的整個(gè)階段,使用不依賴(lài)測(cè)序技術(shù)的簡(jiǎn)單條件規(guī)定了五個(gè)類(lèi)別。不同的測(cè)序技術(shù)可...
RNA病毒基因組測(cè)序:動(dòng)物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來(lái)指導(dǎo)下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測(cè)序需要了解序列、設(shè)計(jì)引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無(wú)需特異性引物擴(kuò)增的測(cè)序方式,可...
微生物鑒定方法:1.從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個(gè)細(xì)胞的形態(tài),比如說(shuō),是球菌,還是桿菌,還是弧菌,還是螺旋菌,這都是可以從微生物的單個(gè)細(xì)胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細(xì)胞的形態(tài),比如說(shuō)是否有鞭毛、芽孢之類(lèi)的東西,都是微生物鑒別的特征性特征。2.就是觀察細(xì)菌...
全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序。全基因組預(yù)測(cè)的意義揭示了人類(lèi)生、老、病和死的奧秘,使人類(lèi)從根本上認(rèn)知疾病發(fā)生的原因,做到正確的調(diào)整疾病和盡早的預(yù)防疾病。每個(gè)人從開(kāi)始就繼承了父母的DNA遺傳信息,并且攜帶一生,不易改變。全基因組測(cè)序通過(guò)...
一直以來(lái),病毒基因組測(cè)序都是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。病毒的全基因組測(cè)序以及對(duì)應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進(jìn)化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎(chǔ)。與傳統(tǒng)Sanger測(cè)...
微生物檢測(cè)基礎(chǔ)知識(shí):微生物檢測(cè)涉及多行業(yè)和領(lǐng)域,在實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)中有著重要的地位。將微生物接到適于它生長(zhǎng)繁殖的人工培養(yǎng)基上或活的生物體內(nèi)的過(guò)程叫做接種。劃線接種這是常用的接種方法。即在固體培養(yǎng)基表面作來(lái)回直線形的移動(dòng),就可達(dá)到接種的作用。常用的接種工具有接種環(huán),接...
傳統(tǒng)的血清學(xué)與分子生物學(xué)方法如ELISA與PCR,由于病原微生物的特異性差異,有時(shí)只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測(cè);而電鏡與生物學(xué)接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下,高通量測(cè)序技術(shù)可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病...
微生物鑒定可以用微生物對(duì)噬菌體的敏感性作為指標(biāo)來(lái)鑒定微生物的種屬。因?yàn)楦鞣N噬菌體都有其嚴(yán)格的宿主范圍,不同的細(xì)菌作為噬菌體的宿主對(duì)應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體,其和噬菌體的作用方式也有接合,轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)接,溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細(xì)菌可以采用血清學(xué)反...
病毒全基因組測(cè)序定:探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專(zhuān)門(mén)針對(duì)性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時(shí)探普生物也...
傳統(tǒng)的血清學(xué)與分子生物學(xué)方法如ELISA與PCR,由于病原微生物的特異性差異,有時(shí)只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測(cè);而電鏡與生物學(xué)接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下,高通量測(cè)序技術(shù)可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病...
傳統(tǒng)病原微生物檢測(cè)方法是生化方法。生化方法檢測(cè)病原微生物實(shí)際上是測(cè)定微生物特異性酶。由于各種微生物所具有的酶系統(tǒng)不完全相同,對(duì)許多物質(zhì)的分解能力亦不一致。因此可利用不同底物產(chǎn)生的不同代謝產(chǎn)物來(lái)間接檢測(cè)該微生物內(nèi)酶的有無(wú),從而達(dá)到檢測(cè)特定微生物的目的。如沙門(mén)氏菌...
需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的應(yīng)用場(chǎng)景:在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,...
臨床微生物鑒定必須經(jīng)歷的過(guò)程:1.分離培養(yǎng):臨床細(xì)菌學(xué)不可缺少的基本技術(shù),是獲得純培養(yǎng)物的必要手段,即使自動(dòng)化儀器先進(jìn)的現(xiàn)在也只能對(duì)純菌作出鑒定。2.細(xì)菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。3.形態(tài)學(xué)鑒定:如奴卡菌、紅球菌。4.動(dòng)力在各種細(xì)菌鑒定:針對(duì)...
傳統(tǒng)的血清學(xué)與分子生物學(xué)方法如ELISA與PCR,由于病原微生物的特異性差異,有時(shí)只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測(cè);而電鏡與生物學(xué)接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下,高通量測(cè)序技術(shù)可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病...
病原微生物檢測(cè)方法-高通量測(cè)序技術(shù)。隨著技術(shù)飛速發(fā)展高通量測(cè)序技術(shù),又稱(chēng)為新一代測(cè)序技術(shù),相對(duì)應(yīng)于以Sanger測(cè)序法為一代測(cè)序技術(shù)而得名。具有高準(zhǔn)確性、高通量、高靈敏度和低運(yùn)行成本等突出優(yōu)勢(shì)。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展,科研工作者開(kāi)始越來(lái)越多地應(yīng)用高通量測(cè)...
病毒(Virus)由一種核酸分子(DNA或RNA)與蛋白質(zhì)(Protein)構(gòu)成或由蛋白質(zhì)構(gòu)成(如朊病毒)。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成,可分為單鏈DNA病毒(ssDNA)、雙鏈DNA病毒(dsDNA)、單鏈RNA病毒(ssRNA)、雙鏈RNA病毒(dsRNA)和蛋白質(zhì)...
在我們食品微生物檢測(cè)過(guò)程中,除了我們知道要檢測(cè)的目標(biāo)微生物之外,往往會(huì)出現(xiàn)一些和目標(biāo)微生物表現(xiàn)不一,但你又想知道它是什么菌屬的情況,特別是對(duì)于一些生產(chǎn)企業(yè),有時(shí)候往往會(huì)懷疑是否是因?yàn)檫@個(gè)“非目標(biāo)菌”的存在,從而影響到了產(chǎn)品質(zhì)量。那怎么去鑒定那些“非目標(biāo)”微生物...
病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無(wú)需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對(duì)采集臨床樣本直接檢測(cè);3.獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域有名**共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病...
微生物鑒定方法:1.從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個(gè)細(xì)胞的形態(tài),比如說(shuō),是球菌,還是桿菌,還是弧菌,還是螺旋菌,這都是可以從微生物的單個(gè)細(xì)胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細(xì)胞的形態(tài),比如說(shuō)是否有鞭毛、芽孢之類(lèi)的東西,都是微生物鑒別的特征性特征。2.就是觀察細(xì)菌...
病毒是一種個(gè)體微小,結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,只含一種核酸(DNA或RNA),必須在活細(xì)胞內(nèi)寄生并以復(fù)制方式增殖的生物。病毒是一種非細(xì)胞生命形態(tài),它由一個(gè)核酸長(zhǎng)鏈和蛋白質(zhì)外殼構(gòu)成,病毒沒(méi)有自己的代謝機(jī)構(gòu),沒(méi)有酶系統(tǒng)。病毒是顆粒很小、以納米為測(cè)量單位、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、寄生性嚴(yán)格,以復(fù)...
基因測(cè)序技術(shù)在此次中起到了至關(guān)重要的作用,我國(guó)科研單位在一個(gè)月之內(nèi)迅速發(fā)現(xiàn)了正確的致病病毒并完成測(cè)序,得到了WHO的贊許。我國(guó)科學(xué)研究者對(duì)病毒序列、變異、核酸檢測(cè)手段的分享也為全世界應(yīng)對(duì)COVID-19帶來(lái)了極有力的支持。在病毒檢測(cè)過(guò)程中,一種測(cè)序技術(shù)獲得了市...
目前,構(gòu)建的病毒宏基因組學(xué)文庫(kù)主要有載體克隆文庫(kù)和基于高通量測(cè)序技術(shù)的加接頭的文庫(kù)。隨著深度測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,第二代高通量測(cè)序技術(shù)、第三代單分子測(cè)序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項(xiàng)研究領(lǐng)域中,以454測(cè)序技術(shù)和Illumina測(cè)序技術(shù)為表示的二代測(cè)序法得到迅速推廣用...
在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序,樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的宏基因組分析效果?其他公司對(duì)用于測(cè)序的樣本的要求較高。而在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序,基于探普的專(zhuān)有流程,樣本要求非常低,不要求總量到達(dá)微克,探普有專(zhuān)門(mén)的收樣標(biāo)準(zhǔn)和送樣流程。為了保證后續(xù)數(shù)據(jù)...
狀病毒的發(fā)現(xiàn),病原宏基因組測(cè)序功不可沒(méi):對(duì)一種新病毒進(jìn)行鑒定和檢測(cè),其中非常關(guān)鍵的步驟就是獲得病毒的全基因組信息。在此次監(jiān)測(cè)和防控中,病原宏基因組測(cè)序發(fā)揮了至關(guān)重要的作用,利用其技術(shù)優(yōu)勢(shì),研究人員在五天內(nèi)就鑒定并分析出的基因組,而2003年SARS的鑒定耗時(shí)5...
在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序的流程非常簡(jiǎn)單,簡(jiǎn)而言之,客戶(hù)只需要說(shuō)清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來(lái)進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷(xiāo)售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備...