在未知傳染病的病原體檢測(cè)方面，傳統(tǒng)的體液培養(yǎng)等檢測(cè)方式整體效率、陽(yáng)性率低下，PCR檢測(cè)也局限于已知的病原微生物基因序列，能夠準(zhǔn)確分析病原體并能夠高通量測(cè)序的mNGS具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì)。mNGS的這兩大優(yōu)勢(shì)也令其在這次的病毒檢測(cè)中發(fā)揮出色。宏基因組測(cè)序在一年多的時(shí)間...

目前，構(gòu)建的病毒宏基因組學(xué)文庫(kù)主要有載體克隆文庫(kù)和基于高通量測(cè)序技術(shù)的加接頭的文庫(kù)。隨著深度測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，第二代高通量測(cè)序技術(shù)、第三代單分子測(cè)序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項(xiàng)研究領(lǐng)域中，以454測(cè)序技術(shù)和Illumina測(cè)序技術(shù)為表示的二代測(cè)序法得到迅速推廣用...

一直以來(lái)宏基因組技術(shù)都是在細(xì)菌領(lǐng)域使用，病毒的樣本收集困難、文庫(kù)構(gòu)建繁瑣、數(shù)據(jù)庫(kù)不完善，因此宏基因組技術(shù)未能獲得普遍應(yīng)用。生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序，樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的宏基因組分析效果？其他公司對(duì)用于測(cè)序的樣本的要求較高。而在探普生物進(jìn)行病毒宏...

病毒是地球上數(shù)量多的生物實(shí)體，其中細(xì)菌病毒(即噬菌體)約有1031個(gè)類群，從海洋到陸地再到人體幾乎都是它們的棲息地。研究者將病毒視為調(diào)節(jié)人類生態(tài)系統(tǒng)的重要成員，人體內(nèi)主要包括真核病毒和噬菌體，包括雙鏈DNA(double-strandedDNA,dsDNA)，...

探普生物對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測(cè)序?qū)嶒?yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后，樣本轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對(duì)病毒的核酸純化樣本指南，以提高純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二，文庫(kù)構(gòu)建環(huán)...

病毒是引發(fā)人畜共患病的主要病原體之一，伴隨環(huán)境、生態(tài)和人類行為等各方面因素的變化，新發(fā)人畜共患病也呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢(shì)，它們極大地威脅著人類和動(dòng)物的健康和生命，并給畜牧業(yè)和農(nóng)業(yè)的健康發(fā)展以及自然界生態(tài)鏈的平衡帶來(lái)危害及災(zāi)難。然而，許多新發(fā)人畜共患病的病原初往往是...

宏病毒組其實(shí)就是病毒的宏基因組（meta-genomics），該技術(shù)是隨著高通量測(cè)序技術(shù)的興起而發(fā)展起來(lái)的。該技術(shù)主要是使用大量微生物群體樣本的測(cè)序數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析手段，以多種數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)，進(jìn)行群體的種類和功能分析。因此，它主要的應(yīng)用場(chǎng)景在于微生物群體研究...

在政策促進(jìn)下，未來(lái)3—5年內(nèi)，我國(guó)將在醫(yī)藥、保養(yǎng)短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺(tái)，培育一批品牌優(yōu)勢(shì)明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團(tuán)。根據(jù)病毒測(cè)序，病毒全基因組測(cè)序，病毒宏基因組測(cè)序，未知病原鑒定相關(guān)領(lǐng)域極新技...

病原微生物檢測(cè)方法-高通量測(cè)序技術(shù)。隨著技術(shù)飛速發(fā)展高通量測(cè)序技術(shù)，又稱為新一代測(cè)序技術(shù)，相對(duì)應(yīng)于以Sanger測(cè)序法為一代測(cè)序技術(shù)而得名。具有高準(zhǔn)確性、高通量、高靈敏度和低運(yùn)行成本等突出優(yōu)勢(shì)。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展，科研工作者開(kāi)始越來(lái)越多地應(yīng)用高通量測(cè)...

近年來(lái)藥品不安全事故不斷發(fā)生，并呈上升趨勢(shì)。在藥品質(zhì)量事故的高發(fā)期，強(qiáng)化藥品微生物鑒定工作顯得尤為重要，尤其是無(wú)菌藥品。在無(wú)菌藥品的生產(chǎn)中，對(duì)原料、輔料、包裝材料、生產(chǎn)場(chǎng)所、生產(chǎn)過(guò)程的微生物控制是保證藥品質(zhì)量的基礎(chǔ)，所以利用微生物鑒定技術(shù)快速、準(zhǔn)確地獲得鑒定結(jié)...

傳統(tǒng)的血清學(xué)與分子生物學(xué)方法如ELISA與PCR，由于病原微生物的特異性差異，有時(shí)只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測(cè)；而電鏡與生物學(xué)接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下，高通量測(cè)序技術(shù)可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病...

傳統(tǒng)的微生物檢測(cè)方法都有哪些？1、直接顯微鏡觀察，正常情況，在一定的培養(yǎng)條件下（相同的培養(yǎng)基、溫度以及培養(yǎng)時(shí)間），同種微生物表現(xiàn)出穩(wěn)定的菌落特征?？梢酝ㄟ^(guò)顯微鏡觀察菌落特征對(duì)微生物種類進(jìn)行判斷。2、選擇培養(yǎng)基培養(yǎng)微生物或人為提供有利于目的菌株生長(zhǎng)的條件，選擇培...

微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn)，普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個(gè)角落中。某些微生物對(duì)產(chǎn)品的污染，不僅影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量，更嚴(yán)重的是它危及消費(fèi)者的健康和安全。微生物檢測(cè)的檢測(cè)項(xiàng)目：菌落總數(shù)、霉菌和酵...

微生物檢測(cè)方法中常用的有平板菌落計(jì)數(shù)法，是根據(jù)每個(gè)活的細(xì)菌能長(zhǎng)出一個(gè)菌落的原理設(shè)計(jì)的。取一定容量的菌懸液，作一系列的倍比稀釋，然后將定量的稀釋液進(jìn)行平板培養(yǎng)，根據(jù)培養(yǎng)出的菌落數(shù)，可算出活菌數(shù)。此法靈敏度高，是一種檢測(cè)污染活菌數(shù)的方法，也是目前國(guó)際上許多國(guó)家所采...

在實(shí)驗(yàn)室中，為了分離某些厭氧菌，可以利用裝有原培養(yǎng)基的試管作為培養(yǎng)容器，把這支試管放在沸水0浴中加熱數(shù)分鐘，以便逐出培養(yǎng)基中的溶解氧。然后快速冷卻，并進(jìn)行接種。接種后，加入無(wú)菌的石蠟于培養(yǎng)基表面，使培養(yǎng)基與空氣隔絕。另一種方法是，在接種后，利用n2或co2取代...

病毒宏基因組測(cè)序可直接對(duì)樣本中的核酸進(jìn)行高通量測(cè)序，鑒定樣本中可能存在的病原菌，輔助臨床決策。覆蓋細(xì)菌、病毒、寄生蟲(chóng)、衣原體、立克次氏體、螺旋體等13396種微生物；同時(shí)進(jìn)行耐藥基因檢測(cè)，涵蓋266種耐藥菌，2984種抗性基因。宏基因組測(cè)序在新發(fā)腹瀉病毒鑒定中...

除了利用病毒的致病性定量檢測(cè)病毒外，還可應(yīng)用物理方法，如在電子顯微鏡下計(jì)數(shù)病毒顆粒，或用紫外分光光度計(jì)測(cè)定提純病毒的蛋白和核酸量，這些方法所測(cè)得的數(shù)據(jù)包括了的病毒粒。植物病毒的培養(yǎng)和檢測(cè)大都是在整株植物上進(jìn)行的醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理。從搗碎的病葉汁中制備病毒，常...

微生物鑒定可以采用不同微生物對(duì)周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來(lái)區(qū)別。比如說(shuō)微生物能否以二氧化碳作為微生物自身生長(zhǎng)的碳源以及對(duì)糖類等物質(zhì)的需求程度來(lái)區(qū)分。亦或者說(shuō)對(duì)不同類型生長(zhǎng)因子的需求也是重點(diǎn)。其實(shí)我們還可以通過(guò)控制微生物的生長(zhǎng)環(huán)境來(lái)判斷微生物的種屬類型...

面對(duì)未知病毒，抵抗力是我們健康的屏障。睡眠缺乏，不僅引起頭昏腦脹、注意力下降及心情煩亂等行為表現(xiàn)，還可以降低抵抗力，增加對(duì)多種疾病的易感性。經(jīng)常克扣睡眠時(shí)間會(huì)讓身體產(chǎn)生的免疫細(xì)胞數(shù)量銳減。芝加哥大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)，相對(duì)于每天睡7~8小時(shí)的人，每天只睡4小時(shí)的人...

微生物鑒定還可以用微生物對(duì)噬菌體的敏感性作為指標(biāo)來(lái)鑒定微生物的種屬。因?yàn)楦鞣N噬菌體都有其嚴(yán)格的宿主范圍，不同的細(xì)菌作為噬菌體的宿主對(duì)應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體，其和噬菌體的作用方式也有接合，轉(zhuǎn)化，轉(zhuǎn)接，溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細(xì)菌可以采用血清學(xué)...

微生物怎么進(jìn)行檢測(cè)？通過(guò)顯微鏡直接觀察。一般來(lái)說(shuō)，在一定的培養(yǎng)條件下（相同的培養(yǎng)基、溫度以及培養(yǎng)時(shí)間），同種微生物表現(xiàn)出穩(wěn)定的菌落特征。這些特征包括菌落的形狀、大小、隆起程度和顏色等方面。因此可以通過(guò)顯微鏡觀察菌落特征對(duì)微生物種類進(jìn)行判斷。使用選擇培養(yǎng)基培養(yǎng)微...

微生物檢測(cè)方法中常用的有平板菌落計(jì)數(shù)法，是根據(jù)每個(gè)活的細(xì)菌能長(zhǎng)出一個(gè)菌落的原理設(shè)計(jì)的。取一定容量的菌懸液，作一系列的倍比稀釋，然后將定量的稀釋液進(jìn)行平板培養(yǎng)，根據(jù)培養(yǎng)出的菌落數(shù)，可算出活菌數(shù)。此法靈敏度高，是一種檢測(cè)污染活菌數(shù)的方法，也是目前國(guó)際上許多國(guó)家所采...

微生物鑒定方法：1.從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個(gè)細(xì)胞的形態(tài)，比如說(shuō)，是球菌，還是桿菌，還是弧菌，還是螺旋菌，這都是可以從微生物的單個(gè)細(xì)胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細(xì)胞的形態(tài)，比如說(shuō)是否有鞭毛、芽孢之類的東西，都是微生物鑒別的特征性特征。2.就是觀察細(xì)菌...

病毒全基因組測(cè)序定在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中，我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先，從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因，搭載一定頻率的全基因組...

未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程才能完成鑒定。高通量測(cè)序技術(shù)之解決疑難鑒定問(wèn)題并提高檢測(cè)的靈敏度，在病原微生物檢測(cè)與鑒定方面，對(duì)一些非典型癥狀的樣品，依靠先驗(yàn)知識(shí)與傳統(tǒng)檢測(cè)方法無(wú)法有效對(duì)病原微生物進(jìn)行檢測(cè)時(shí)，高通量測(cè)...

微生物鑒定可以用微生物對(duì)噬菌體的敏感性作為指標(biāo)來(lái)鑒定微生物的種屬。因?yàn)楦鞣N噬菌體都有其嚴(yán)格的宿主范圍，不同的細(xì)菌作為噬菌體的宿主對(duì)應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體，其和噬菌體的作用方式也有接合，轉(zhuǎn)化，轉(zhuǎn)接，溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細(xì)菌可以采用血清學(xué)反...

微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn)，普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個(gè)角落中。某些微生物對(duì)產(chǎn)品的污染，不僅影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量，更嚴(yán)重的是它危及消費(fèi)者的健康和安全。微生物檢測(cè)的檢測(cè)項(xiàng)目：菌落總數(shù)、霉菌和酵...

面對(duì)未知病毒，抵抗力是我們健康的屏障。睡眠缺乏，不僅引起頭昏腦脹、注意力下降及心情煩亂等行為表現(xiàn)，還可以降低抵抗力，增加對(duì)多種疾病的易感性。經(jīng)?？丝鬯邥r(shí)間會(huì)讓身體產(chǎn)生的免疫細(xì)胞數(shù)量銳減。芝加哥大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)，相對(duì)于每天睡7~8小時(shí)的人，每天只睡4小時(shí)的人...

病原體-宏基因組測(cè)序:1.開(kāi)發(fā)了一種經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的臨床mNGS檢測(cè)方法，用于在許可的微生物實(shí)驗(yàn)室中診斷腦脊髓液（CSF）引起的腦膜炎和腦炎的傳染原因。2.開(kāi)發(fā)了定制的生物信息學(xué)管道SURPI+，以快速分析mNGS數(shù)據(jù)，生成檢測(cè)到的病原體的自動(dòng)摘要，并提供用于評(píng)估和...

宏基因組有廣義和狹義兩種概念。廣義的概念是指所有可能與人的生活密切相關(guān)的微生物的基因組，包括長(zhǎng)期共生在體內(nèi)的微生物，也包括可以進(jìn)入體內(nèi)，對(duì)人類的生活造成不同形式的影響的微生物。而狹義的宏基因組是指長(zhǎng)期共生在體內(nèi)的微生物。宏基因組測(cè)序分析技術(shù)：?jiǎn)问枪采谌梭w內(nèi)的...