在未知傳染病的病原體檢測方面，傳統(tǒng)的體液培養(yǎng)等檢測方式整體效率、陽性率低下，PCR檢測也局限于已知的病原微生物基因序列，能夠準(zhǔn)確分析病原體并能夠高通量測序的mNGS具有強(qiáng)大的優(yōu)勢。mNGS的這兩大優(yōu)勢也令其在這次的病毒檢測中發(fā)揮出色。宏基因組測序在一年多的時(shí)間里也受到了資本市場的普遍關(guān)注，發(fā)生之后，全球宏基因組測序市場又有多家公司在本季度獲得投資。全自動(dòng)設(shè)備處理標(biāo)本，該設(shè)備可以從血漿中分離微生物無細(xì)胞核酸（mcfDNA），使用特有工藝去除不必要的人類DNA，然后對樣本進(jìn)行測序，并使用機(jī)器學(xué)習(xí)等手段對數(shù)十種實(shí)時(shí)數(shù)百萬個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)來識(shí)別匹配項(xiàng)。這種核酸是病原微生物在血液中留下的「痕跡」，通過對這些痕跡進(jìn)行測序，便可以分析出傳染的病原情況。該技術(shù)可以識(shí)別和量化1250種臨床相關(guān)的病原菌，包括細(xì)菌、寄生蟲等。比較基因組學(xué)層面可通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)。微生物群體多樣性測序原理
DNA宏基因組測序的病原檢出率均高于培養(yǎng)等傳統(tǒng)方法，表現(xiàn)出良好的診斷性能。DNA宏基因組測序已被用于診斷各種臨床傳染性疾病，例如血液傳染，肺和肺外結(jié)核（TB），侵襲性傳染，寄生蟲傳染，傳染性心內(nèi)膜炎，復(fù)雜性肺炎，尿路傳染和實(shí)體移植后的繼發(fā)傳染等，為臨床傳染性疾病的診斷和提供了新的前景。盡管一項(xiàng)多中心的回顧性研究表明，目前使用mcfDNA宏基因組測序作為診斷常見傳染疾病的工具的優(yōu)勢并不明顯，但它可以提供比傳統(tǒng)方法更快、更早的診斷結(jié)果，以及在的升級/降級方面具有重要意義。河南宏病毒組測序傳統(tǒng)的微生物鑒定方法依賴于表型鑒定。
目前，構(gòu)建的病毒宏基因組學(xué)文庫主要有載體克隆文庫和基于高通量測序技術(shù)的加接頭的文庫。隨著深度測序技術(shù)的不斷發(fā)展，第二代高通量測序技術(shù)、第三代單分子測序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項(xiàng)研究領(lǐng)域中，以454測序技術(shù)和Illumina測序技術(shù)為表示的二代測序法得到迅速推廣用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫，相信將來第三代測序平臺(tái)如tSMSTM（truesinglemolecularsequeneing）技術(shù)平臺(tái)、SMRT（singlemoleculereal-time）技術(shù)平臺(tái)、FRET測序技術(shù)及納米孔單分子技術(shù)為表示的第三代測序法也將應(yīng)用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫。Donaldson等[23]采用高通量測序技術(shù)構(gòu)建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學(xué)文庫，獲得了600000條讀長（Reads）的核酸序列。
在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測序的流程非常簡單，簡而言之，客戶只需要說清楚樣品情況，準(zhǔn)備樣品即可，其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下：1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況；2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同，雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章；3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本，填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰，安排樣本寄運(yùn)輸；4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款，探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測序報(bào)告；5)客戶支付項(xiàng)目尾款，探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果；6)售后問題處理，項(xiàng)目結(jié)題。隨著醫(yī)學(xué)微生物學(xué)研究技術(shù)的不斷發(fā)展，病原學(xué)診斷已不再局限于病原體水平。
狀病毒的發(fā)現(xiàn)，病原宏基因組測序功不可沒：對一種新病毒進(jìn)行鑒定和檢測，其中非常關(guān)鍵的步驟就是獲得病毒的全基因組信息。在此次監(jiān)測和防控中，病原宏基因組測序發(fā)揮了至關(guān)重要的作用，利用其技術(shù)優(yōu)勢，研究人員在五天內(nèi)就鑒定并分析出的基因組，而2003年SARS的鑒定耗時(shí)5月余、2013年H7N9的鑒定耗時(shí)1月余。2019-nCoV為線性單鏈RNA（ssRNA）病毒，基因組全長包含29903個(gè)核苷酸，10個(gè)基因。病毒基因組序列為進(jìn)一步分析其傳染機(jī)理，傳播途徑，藥物靶點(diǎn)等提供了有利的支持。病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究。安徽腸道微生物測序分析價(jià)格
有很多微生物通過傳統(tǒng)技術(shù)是無法鑒別的。微生物群體多樣性測序原理
病毒宏基因組測序可直接對樣本中的核酸進(jìn)行高通量測序，鑒定樣本中可能存在的病原菌，輔助臨床決策。覆蓋細(xì)菌、病毒、寄生蟲、衣原體、立克次氏體、螺旋體等13396種微生物；同時(shí)進(jìn)行耐藥基因檢測，涵蓋266種耐藥菌，2984種抗性基因。宏基因組測序在新發(fā)腹瀉病毒鑒定中的應(yīng)用：發(fā)現(xiàn)和鑒定新病毒以及確定新病毒與疾病的關(guān)系是預(yù)防、診斷和新發(fā)病毒性傳染病的首要任務(wù)。高通量測序技術(shù)突破了傳統(tǒng)技術(shù)方法的局限，可以直接以標(biāo)本中所有的遺傳物質(zhì)為研究對象，從而能夠快速地鑒定出標(biāo)本中存在的病毒，形成了一門研究特定環(huán)境中病毒群落的新興學(xué)科：病毒宏基因組學(xué)(宏病毒組)。微生物群體多樣性測序原理
上海探普生物科技有限公司是以提供病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定內(nèi)的多項(xiàng)綜合服務(wù)，為消費(fèi)者多方位提供病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定，上海探普生物是我國醫(yī)藥健康技術(shù)的研究和標(biāo)準(zhǔn)制定的重要參與者和貢獻(xiàn)者。公司主要提供從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)，化工原料及產(chǎn)品（除危險(xiǎn)化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品），實(shí)驗(yàn)室設(shè)備，計(jì)算機(jī)、軟件及輔助設(shè)備，電子產(chǎn)品銷售，計(jì)算機(jī)軟件開發(fā)及維護(hù)，計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。等領(lǐng)域內(nèi)的業(yè)務(wù)，產(chǎn)品滿意，服務(wù)可高，能夠滿足多方位人群或公司的需要。將憑借高精尖的系列產(chǎn)品與解決方案，加速推進(jìn)全國醫(yī)藥健康產(chǎn)品競爭力的發(fā)展。