Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?；旌蠘颖竞螅贗on Proton/Ion Torrent平臺(tái)上，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本，，終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定，相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù)，基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物提供高同源區(qū)段SNP分型服務(wù)。
高同源序列帶來的直接挑戰(zhàn)：同源序列的干擾，無法利用簡(jiǎn)單PCR技術(shù)或者探針雜交捕獲技術(shù)，將目標(biāo)區(qū)段富集。SNP分型哪里做
將待檢測(cè)片段（包含待測(cè)SNP位點(diǎn)）進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中，準(zhǔn)確的一種，堪稱SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖，純和位點(diǎn)為單峰，而雜合位點(diǎn)則為套峰，因此通過查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開來。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè)，還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。直接測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)果準(zhǔn)確，能發(fā)現(xiàn)未知位點(diǎn)，但是其缺點(diǎn)是通量低，成本高。因此直接測(cè)序法適用于少位點(diǎn)，少樣本的分型規(guī)模，當(dāng)然土豪實(shí)驗(yàn)室除外！所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實(shí)驗(yàn)中得到推廣。江蘇高同源區(qū)段分型公司遺傳分析時(shí)經(jīng)常遇到高同源序列分析的挑戰(zhàn)，比如存在假基因，同源基因，在多倍體物種中更為普遍。
序列的相似性和序列的同源性有一定的關(guān)系，一般來說序列間的相似性越高的話，它們是同源序列的可能性就越高，所以經(jīng)?？梢酝ㄟ^序列的相似性來推測(cè)序列是否同源。正因?yàn)榇嬖谶@樣的關(guān)系，很多時(shí)候?qū)π蛄械南嗨菩院屯葱跃蜎]有做很明顯的區(qū)分，造成經(jīng)常等價(jià)混用兩個(gè)名詞。所以有出現(xiàn)A序列和B序列的同源性為80%一說。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位，上海市****，至今已有十六年歷史，專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。
旁系同源基因（paralogousgene）又譯為“橫向同源基因”、“并系同源基因”或“平行進(jìn)化同源基因”，是指由于基因復(fù)制而產(chǎn)生的同源基因，例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因?；驈?fù)制后，進(jìn)化選擇壓力變小，其中一條基因丟失或發(fā)生沉默，都能促使旁系同源基因分化，產(chǎn)生新特性或新功能的原因。然而，雖然某些旁系同源基因轉(zhuǎn)錄區(qū)序列相似度不高，但它們的操縱子卻仍然具有較高的保守度。值得注意的是，旁系同源基因并不局限于同一物種內(nèi)，不同物種中由于始祖基因的復(fù)制而分化的基因也稱旁系同源基因，如鼠α一珠蛋白和雞β一珠蛋白基因。隨著時(shí)間的推移，它們?cè)谛蛄薪M成和功能上可能會(huì)變得不同。多重PCR是降低長(zhǎng)片段PCR擴(kuò)增成本的有效方式。
競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法——KASP（KompetitiveAlleleSpecificPCR），是英國(guó)LGC（**化學(xué)家實(shí)驗(yàn)室）公司所開發(fā)的技術(shù)，被比較常見用于少位點(diǎn)，多樣本的SNP分型中，與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來對(duì)SNP分型以及檢測(cè)InDels(InsertionsandDeletions，插入和缺失)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位，是上海市****，至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)（高同源區(qū)段SNP分型）和質(zhì)控試劑盒。高同源區(qū)段是二倍體和多倍體都存在的，由于多倍體染色體加倍，所以高同源區(qū)段在多倍體中更是普遍現(xiàn)象。山東高同源序列分型分析
在經(jīng)濟(jì)作物育種領(lǐng)域，檢測(cè)SNP可實(shí)現(xiàn)對(duì)所需性狀的早期選擇。SNP分型哪里做
多序列比對(duì)的意義：用于描述一組序列之間的相似性關(guān)系，以便了解一個(gè)基因家族的基本特征，尋找motif，保守區(qū)域等。用于描述一個(gè)同源基因之間的親緣關(guān)系的遠(yuǎn)景，應(yīng)用到分子進(jìn)化分析中。多序列比對(duì)的方法：同源性分析中常常要通過多序列比對(duì)來找出序列之間的相互關(guān)系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比對(duì)大多都是采用全局比對(duì)的算法。這樣對(duì)于采用計(jì)算機(jī)程序的自動(dòng)多序列比對(duì)是一個(gè)非常復(fù)雜且耗時(shí)的過程，特別是序列數(shù)目多，且序列唱的情況下。SNP分型哪里做
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康，是一家服務(wù)型公司。公司自成立以來，以質(zhì)量為發(fā)展，讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié)，公司旗下細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測(cè)，生物技術(shù)服務(wù)深受客戶的喜愛。公司注重以質(zhì)量為中心，以服務(wù)為理念，秉持誠(chéng)信為本的理念，打造醫(yī)藥健康良好品牌。翼和生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來的聲譽(yù)和口碑，讓企業(yè)發(fā)展再上新高。