有些港口因拼箱貨源不足、成本偏高等原因，專做拼箱的貨代公司對貨量較少的貨物采取低收費標準，如低起算為2個運費噸，即不足2個運費噸，一律按2個運費噸計價收費。因此對貨量較小，港口較偏的貨物在成交時要多考慮到一些這樣的因素，以免日后被動。對于一些航線及港口較偏僻，并且客戶提出要交貨到內陸點的拼箱貨物，成交簽約前先咨詢，確認有船公司及貨代公司可以承接辦理這些偏僻港口、內陸點交貨及相關費用后再簽約。
船公司只接受整箱貨物的訂艙，而不直接接受拼箱貨的訂艙，只有通過貨運代理將拼箱貨拼整后才能向船公司訂艙。一般的貨運代理由于貨源的局限性，只能集中向幾家船公司訂艙，很少能滿足指定船公司的需求，因此在成交拼箱貨時，盡量不要指定船公司，以免在辦理托運時無法滿足指定船公司的要求而無法出運貨物。
拼箱可以分為直拼或轉拼，直拼是指拼箱集裝箱內的貨物在同一個港口裝卸，在貨物到達目的港前不拆箱，即貨物為同一卸貨港。此類拼箱服務運期短，方便快捷，一般有實力的拼箱公司會提供只此類服務。轉拼是指集裝箱內不是同一目的港的貨物，需要在中途拆箱卸貨或轉船。此類貨物因目的港不一，待船時間長等因素，故運期較長，甚至運費偏高。 拼箱貨一般不能接受指定某具體船公司，船公司只接受整箱貨物的訂艙，而不直接接受拼箱貨的訂艙，只有通過貨運代理將拼箱貨拼整后才能向船公司訂艙， "集中辦托，集中分撥"。