四川專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)服務(wù)至上

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-11

    基于以上研究,邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)可針對(duì)患者分層及各類研究指標(biāo)提供FGFR抑制劑***中生物標(biāo)志物研究的整體解決方案,包含:HumanComprehensivePanelMed1CDx;定制的panFGFxpanel;QIAGENtherascreen®FGFRRGQRT-PCRKit;RNAscope檢測(cè)FGFR1/2/3/4mRNA表達(dá);FISH(FGF19擴(kuò)增);IHC(FGF19表達(dá))等(圖4)。圖4FGFR抑制劑相關(guān)的生物標(biāo)志物整體解決方案??方案1:Med1CDxNGSpanel(601基因)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的Med1CDx綜合panel包含原*基因、遺傳性驅(qū)動(dòng)基因、細(xì)胞周期基因和免疫/炎癥相關(guān)基因等601個(gè)基因,可用于對(duì)TMB、MMR、MSI、免疫檢查點(diǎn)分子、**新生抗原和HLA分型等***的分析。對(duì)于FGFR抑制劑研究,該panel除了能夠檢測(cè)FGFR基因的SNV/INDEL、基因重排和擴(kuò)增等異常,也可以評(píng)估已知和探索新的耐藥變異(圖5)。圖5Med1CDx基因分布??方案2:定制panelpanFGFx(40基因)值得關(guān)注的是,邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)針對(duì)FGFR抑制劑的研究研發(fā)了“小而精”的panFGFxpanel:FGFR1-4探針覆蓋基因全部外顯子,包括UTR區(qū),覆蓋**全,同時(shí)檢測(cè)已知與未知SNV/InDel;針對(duì)融合檢測(cè),加入了已知融合伙伴的相關(guān)探針,提高已知融合檢出率;如有新融合發(fā)現(xiàn)需求,可提供涵蓋全部?jī)?nèi)含子區(qū)版本;針對(duì)拷貝數(shù)擴(kuò)增檢測(cè)。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)病理檢測(cè)平臺(tái)配備有Roche/Leica/Dako等多種全自動(dòng)檢測(cè)儀器,有病理醫(yī)生進(jìn)行精確的判讀。四川專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)服務(wù)至上

    然后對(duì)上述原始數(shù)據(jù)進(jìn)行去卷積處理,得到該蛋白樣品中主要成分的精確分子質(zhì)量(如下圖所示)。2小于10KDa分子量的某肽段藥物精確分子量測(cè)定百泰派克生物科技通過(guò)online反相色譜分離后,直接用QExactive質(zhì)譜儀對(duì)原始信號(hào)進(jìn)行采集,然后利用經(jīng)典的計(jì)算分子量的方法對(duì)原始數(shù)據(jù)直接進(jìn)行計(jì)算,得到樣品精確分子量。進(jìn)入質(zhì)譜之前的反相色譜分離過(guò)程中連接了紫外檢測(cè)器(如下圖所示),在實(shí)現(xiàn)對(duì)樣品分離的同時(shí),還會(huì)對(duì)樣品的純度進(jìn)行評(píng)估;色譜分離的過(guò)程同樣也降低了在肽段精確分子量檢測(cè)過(guò)程中對(duì)樣品純度的要求。在進(jìn)行肽段精確分子量計(jì)算的過(guò)程中,我們只需要找到肽段洗脫時(shí)間點(diǎn)的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)(如下圖所示)按照經(jīng)典的計(jì)算分子質(zhì)量的方法,同時(shí)對(duì)帶有兩個(gè)以上電荷的分子進(jìn)行分子量計(jì)算,得到該肽段樣品的精確分子質(zhì)量。同時(shí)我們還會(huì)給高豐度的帶電離子質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)供您參考(如下圖所示)。MALDI與ESI的優(yōu)缺點(diǎn)比較:進(jìn)入質(zhì)譜之前的反相色譜分離過(guò)程中連接了紫外檢測(cè)器在技術(shù)報(bào)告中,百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:1.實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)2.相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)。福建專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)鄭重承諾邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)目前已完成約30+靶點(diǎn)的方法學(xué)驗(yàn)證,50+靶點(diǎn)的方法學(xué)建立。

    GC-MS(氣相色譜/質(zhì)譜聯(lián)用儀)GC-MS簡(jiǎn)介GC-MS是氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的簡(jiǎn)稱,是將氣相色譜儀與質(zhì)譜儀通過(guò)適當(dāng)接口相結(jié)合,借助計(jì)算機(jī)技術(shù),進(jìn)行聯(lián)用的分析技術(shù)。GC為氣相色譜,流動(dòng)相為惰性氣體,多為氦氣,由進(jìn)樣口、色譜柱和檢測(cè)器三部分構(gòu)成;MS為質(zhì)譜,由離子源、濾質(zhì)器、檢測(cè)器三部分構(gòu)成,廣泛應(yīng)用于純物質(zhì)鑒定。GC-MS因其具有GC的高分辨率和MS的高靈敏度,被廣泛應(yīng)用于復(fù)雜組分的分離與鑒定,是生物樣品中藥物代謝中定性與定量的主要工具。應(yīng)用領(lǐng)域代謝組學(xué)分析藥物分析結(jié)構(gòu)鑒定生物組織蛋白分析物質(zhì)組分鑒定檢測(cè)示例技術(shù)流程送樣須知血清、血漿≥尿液≥動(dòng)物組織≥250mg樣本寄送地址:天津經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)第十三大街37號(hào)逸夫樓225,降老師(收)(具體樣本保存與運(yùn)輸條件請(qǐng)與我們聯(lián)系)我們的優(yōu)勢(shì)1、提供各種實(shí)驗(yàn)材料和儀器,滿足項(xiàng)目課題實(shí)驗(yàn)需要。2、專業(yè)的操作人員。3、高規(guī)格實(shí)驗(yàn)室。4、數(shù)據(jù)結(jié)果交付周期快。5、完善的服務(wù)體系,全程跟進(jìn),確保滿意。咨詢與訂購(gòu)感謝您選擇我們的服務(wù),如果您有任何問(wèn)題,請(qǐng)聯(lián)系我們,我們將竭誠(chéng)為您解答和服務(wù)??头娫挘壕W(wǎng)站:郵箱:market@QQ:一、測(cè)序策略:提取樣品的基因組DNA,檢測(cè)基因組DNA的完整性和濃度。

    染色體STR不屬于測(cè)序技術(shù)的,它是一類分子檢測(cè)技術(shù),例如Y染色體-STR,一般通過(guò)PCR、電泳凝膠結(jié)合來(lái)分析這段串聯(lián)重復(fù)序列的存在或者多態(tài)性,常用來(lái)檢測(cè)性別或親子鑒定,而不能測(cè)出具體的DNA序列信息。測(cè)序技術(shù)是一代測(cè)序(sanger測(cè)序)、二代測(cè)序(高通量測(cè)序)、三代測(cè)序(單分子測(cè)序)為基礎(chǔ)的。二代測(cè)序的缺點(diǎn)主要是由其PCR邊復(fù)制邊讀取的原理決定的,測(cè)序時(shí)間長(zhǎng),讀長(zhǎng)短,末端質(zhì)量差。三代測(cè)序中PacBio實(shí)際上就是針對(duì)這些缺點(diǎn)的升級(jí),通過(guò)巧妙的微孔設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)單分子讀取,而且可以屏蔽游離dNTP的信號(hào),不用每讀取一次就要清洗—添加一次dNTP,所以讀長(zhǎng)比較長(zhǎng),測(cè)序速度快。就是樣本—提DNA—打成小片段,然后就開(kāi)始PCR啊末端修復(fù)啊加A啊片段選擇啊一系列,***得到片段大小為300-500bp的DNA,ok文庫(kù)搞定。雖然這行真的干的煩死了,不過(guò)離開(kāi)了真的很想念。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)有多年的藥企服務(wù)經(jīng)驗(yàn),緊跟藥物研發(fā)趨勢(shì),熟悉新藥研發(fā)動(dòng)向。

    :針對(duì)特定目的核酸片段的測(cè)序,首先要對(duì)目的測(cè)序區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增;而針對(duì)碎片化DNA的測(cè)序,則要將碎片化的DN**段通過(guò)克隆的方式連接到質(zhì)粒載體中;對(duì)于部分PCR產(chǎn)物的測(cè)序也可以對(duì)其進(jìn)行克隆,以保證測(cè)序樣品的純度和濃度。:向得到的待測(cè)樣品中分別加入4種dNTP和4種ddNTP,從而得到不同位置匹配終止的序列。ddNTP循環(huán)測(cè)序4.凝膠電泳獲得序列:對(duì)得到的序列進(jìn)行凝膠電泳,根據(jù)堿基的順序和位置確定序列信息。電泳確定序列***代測(cè)序技術(shù)的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)優(yōu)勢(shì):***代測(cè)序技術(shù)的準(zhǔn)確性遠(yuǎn)高于二、三代測(cè)序,因此被稱為測(cè)序行業(yè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”;***代測(cè)序每個(gè)反應(yīng)可以得到700-1000bp的序列,序列長(zhǎng)度高于二代測(cè)序;***代測(cè)序價(jià)格低廉,設(shè)備運(yùn)行時(shí)間短,適用于低通量的快速研究項(xiàng)目。劣勢(shì):***代測(cè)序技術(shù)一個(gè)反應(yīng)只能得到一條序列,因此測(cè)序通量很低;***代測(cè)序技術(shù)雖然單個(gè)反應(yīng)價(jià)格低廉,但是獲得大量序列的成本很高。***代測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用PCR產(chǎn)物測(cè)序:對(duì)目的基因的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,得到目的基因序列;重測(cè)序:突變、SNPs、插入或缺失克隆產(chǎn)物的驗(yàn)證;分型分析:微生物和***分類學(xué)鑒定、HLA分型、病毒分型等;臨床應(yīng)用:**突變基因的檢測(cè)和**個(gè)體化***。 MLH1抗體試劑 蘇蘇械備20180519號(hào).遼寧專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)服務(wù)至上

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)擁有全技術(shù)平臺(tái)及豐富的伴隨診斷開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn),為藥企合作伙伴提供一體化開(kāi)發(fā)服務(wù)。四川專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)服務(wù)至上

    一、初現(xiàn)廬山真面目一代測(cè)序:又稱Sanger測(cè)序(多分子,單克?。v史:***代DNA測(cè)序技術(shù)(又稱Sanger測(cè)序)在1975年,由Sanger等人開(kāi)創(chuàng),并在1977年完成***個(gè)基因組序列(噬菌體X174),全長(zhǎng)5375個(gè)堿基。研究人員經(jīng)過(guò)30年的實(shí)踐并對(duì)技術(shù)及測(cè)序策略的不斷改進(jìn)(如使用了不同策略的作圖法、鳥(niǎo)***法),2001年完成的較早人類基因組圖譜就是以改進(jìn)了的Sanger法為其測(cè)序基礎(chǔ)。原理:在4個(gè)DNA合成反應(yīng)體系(含dNTP)中分別加入一定比例帶有標(biāo)記的ddNTP(分為:ddATP,ddCTP,ddGTP和ddTTP),通過(guò)凝膠電泳和放射自顯影后可以根據(jù)電泳帶的位置確定待測(cè)分子的DNA序列。由于ddNTP的2’和3’都不含羥基,其在DNA的合成過(guò)程中不能形成磷酸二酯鍵,因此可以用來(lái)中斷DNA合成反應(yīng)。二、江山輩有人才出二代測(cè)序:NGS技術(shù)(多分子,多克?。┍尘埃篠anger測(cè)序雖讀長(zhǎng)較長(zhǎng)、準(zhǔn)確性高,但其測(cè)序成本高通量低等缺點(diǎn),使得denovo測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等應(yīng)用難以普及。經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)不斷的技術(shù)開(kāi)發(fā)和改進(jìn),以Roche公司的454技術(shù)、illumina公司的Solexa,Hiseq技術(shù),ABI公司的Solid技術(shù)為標(biāo)記的第二代測(cè)序技術(shù)誕生,后起之秀ThermoFisher的IonTorrent技術(shù)近年來(lái)也殺入歷史舞臺(tái)。四川專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)服務(wù)至上

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究(蘇州)有限公司于2013年成立,其前身為凱杰(蘇州)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究有限公司?;诨蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)、細(xì)胞組學(xué)及病理組學(xué)等綜合性轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)平臺(tái),豐富的伴隨診斷開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn),高質(zhì)量的管理體系以及高素質(zhì)的研發(fā)管理團(tuán)隊(duì),邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)為全球合作伙伴提供***生物標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)、靶點(diǎn)驗(yàn)證、新藥臨床試驗(yàn)病人的分型研究和入組篩選、伴隨診斷開(kāi)發(fā)與商業(yè)化、患者用藥指導(dǎo)檢測(cè)等一體化解決方案,并已迅速發(fā)展成為中國(guó)伴隨診斷領(lǐng)頭創(chuàng)新企業(yè),致力于解決創(chuàng)新藥物的研發(fā)痛點(diǎn)及患者的用藥痛點(diǎn),助力精細(xì)醫(yī)療!