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h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)個體識別;(h4)親權(quán)鑒定;(h5)種族推斷。本發(fā)明還保護上述任一所述引物組合或上述任一所述復(fù)合擴增體系的應(yīng)用,可為(h1)-(h5)中的至少一種:(h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)個體識別;(h4)親權(quán)鑒定;(h5)種族推斷。上述任一所述68個基因座具體可由amelogenin、dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10和y-gata-h4組成。其中,amelogenin為性別決定基因座。dyf399s1包含三個分型片段。dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b和dys527a/b均包含兩個分型片段。本發(fā)明提供的試劑盒可以檢測68個基因座。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)擁有專業(yè)的病理醫(yī)生提供相應(yīng)的閱片或遠程病理閱片服務(wù)。河南全平臺邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺鄭重承諾
反應(yīng)體系為20μl,由10μl2×mastermix(德國qiagen公司)、1μl標準品2800m水溶液、引物混合物和無核酶水組成。該反應(yīng)體系中,各個引物的濃度見表1中第5列。反應(yīng)程序:95℃5min;95℃30s,60℃2min,72℃2min,28個循環(huán);72℃5min;4℃保存。3、純化和定量(1)取pcr擴增產(chǎn)物,按照pcrpurificationkit的說明書步驟進行純化,得到pcr純化產(chǎn)物。(2)將pcr純化產(chǎn)物按照qubittmdsdnahsassaykit說明書,采用,得到pcr純化產(chǎn)物的濃度。4、文庫制備取pcr純化產(chǎn)物,按照truseqdnapcr-freehtlibraryprepkit的說明書操作步驟依次進行末端修復(fù)、末端修復(fù)產(chǎn)物純化、連接a-tail、連接adapter和連接產(chǎn)物的純化,然后按照kapalibraryquantificationkit的說明書步驟進行文庫定量及文庫標準化,完成文庫制備。5、上樣測試取步驟4制備的文庫,使用miseqreagentkitv3-600cycles測序試劑于miseqfgx二代測序儀上進行測序。6、數(shù)據(jù)分析測序結(jié)束后儀器自動生成fastq文件,使用。運行,在notepad中錄入68個基因座基因配置文件?;蜃蚺渲梦募缦拢孩倩蜃Q,②y,③正向引物后12個堿基,④反向引物前12個堿基的反向互補序列,⑤該基因座**序列的兩個重復(fù)單元,⑥一個重復(fù)單元的堿基數(shù)。湖南多靶點邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺創(chuàng)新服務(wù)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)嚴格按照IS013485標準規(guī)定建立質(zhì)量體系。
病理切片以及HE染色實驗技術(shù)簡介病理切片作為一種實驗技術(shù)已廣泛應(yīng)用于科研、教學(xué)、病理檢驗等工作中,有較高的使用價值。實驗的整個流程大致分為以下幾個步驟:組織固定、包埋、切片、脫水、透明、封片、染色。病理切片的質(zhì)量對病理診斷有一定影響。HE染色(蘇木素—伊紅染色)的情況與制作切片的每一個過程都有著緊密的聯(lián)系,包括時間的控制,切片的厚度等,每一個小環(huán)節(jié)都會嚴重影響病灶的呈現(xiàn)。操作流程案例展示石蠟切片機客戶提供1、病理組織切片或組織,注意組織標本保存于固定液中,固定液選用10%福爾馬林或4%多聚甲醛,組織塊大小宜2cm**2、不同組織分開不同容器盛放3、完整的送檢單結(jié)果交付1、完整的試驗流程,操作步驟2、樣本為病理切片,提供染色完成的切片及詳細的解讀報告3、樣本為組織,提供石蠟塊、病理染色切片以及詳細的解讀報告我們的優(yōu)勢技術(shù)優(yōu)良的實驗團隊成熟的操作技術(shù)一站式綜合服務(wù)咨詢與訂購感謝您選擇我們的服務(wù),如果您有任何問題,請聯(lián)系我們,我們將竭誠為您解答和服務(wù)。
2015年一項針對4853例各類實體瘤NGS研究表明,F(xiàn)GFR的功能異常發(fā)生于7.1%的**樣本中,其中基因擴增、基因突變以及染色體重排分別占比為66%、26%及8%,F(xiàn)GFR1、FGFR2、FGFR3及FGFR4在發(fā)病患者中占比為3.5%、1.5%、2.0%及0.5%。發(fā)生率較高的**有尿路上皮*、膽管*、乳腺*、子宮內(nèi)膜*、鱗狀上皮*等,同時,在肺*、肝*等**中也發(fā)現(xiàn)了FGFR的異常***(圖3)。圖3各類實體瘤中FGFR突變頻率[1]04FGFR抑制劑研究現(xiàn)狀FGFR抑制劑有望成為泛*種靶向***的新選擇,所以FGFR靶點在**領(lǐng)域受關(guān)注度極高,目前國內(nèi)多家藥企布局FGFR靶向療法的研究開發(fā)(表2)。表2中國的FGFR抑制劑研發(fā)現(xiàn)狀05FGFR抑制劑生物標志物研究FGFR抑制劑獲批和在研藥物,以及相應(yīng)的臨床試驗生物標志物研究總結(jié)如表3。表3FGFR抑制劑及臨床試驗生物標志物[7-9]檢測FGFR基因變異包括融合、重排、擴增和點突變以及其配體的過表達等,涉及DNA、RNA和蛋白質(zhì)表達等多個生物學(xué)層面,檢測方法主要有NGS,qPCR,F(xiàn)ISH,IHC以及RNAscope等(表4)。【邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)】一直以來致力于轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)服務(wù)和伴隨診斷產(chǎn)品開發(fā)及商業(yè)化。
⑦側(cè)翼序列堿基數(shù),各部分之間用tab鍵隔開。按照這種格式依次對68個基因座進行錄入。68個基因座基因配置文件錄入完成后,運行***。該文件給出了①基因座名稱,②基因分型,③擴增子堿基數(shù),④擴增子序列信息,⑤測序深度五個部分。根據(jù)國際法醫(yī)遺傳學(xué)會(internationalsocietyforforensicgenetics,isfg)發(fā)表的關(guān)于y-str基因座的str序列指南()和niststr數(shù)據(jù)庫(strbase.)y染色體str情況說明對67個y-str基因座的序列構(gòu)建**重復(fù)結(jié)構(gòu)。實驗結(jié)果見表3。結(jié)果表明,標準品2800m得到了完整的str分型,完全能夠滿足法醫(yī)str檢驗的要求。表3-1注:n與其后數(shù)字表示一段堿基序列,其后數(shù)字表示序列的堿基數(shù)目。表3-2注:n與其后數(shù)字表示一段堿基序列,其后數(shù)字表示序列的堿基數(shù)目。二、采用實施例1制備的試劑盒的應(yīng)用——口腔拭子樣本的基因座分型樣本一、樣本二和樣本三為3名漢族男性無關(guān)個體的口腔拭子的基因組dna,濃度均為1ng/μl。3名漢族男性均知情同意。將步驟一中的標準品2800m水溶液替換為樣本一、樣本二或樣本三,其它步驟均不變。檢測結(jié)果見表3。結(jié)果表明,樣本一、樣本二和樣本三均獲得了完整的str分型結(jié)果。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)可以提供覆蓋肺ai、腸ai、肝ai、胃ai、乳腺ai、前列腺ai等多種實體瘤的上百項檢測項目。黑龍江多組學(xué)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺來電咨詢
邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)利用新一代智能技術(shù)補充傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)的檢測模式,賦能醫(yī)療健康建設(shè),更好地為臨床和患者服務(wù)。河南全平臺邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺鄭重承諾
降低引物的擴增效率,也需要重新設(shè)計并合成引物。3、初次復(fù)合擴增時,各個引物在反應(yīng)體系中的濃度均為μm;之后對引物濃度進行調(diào)整,獲得進行pcr擴增時各個引物的**佳濃度。經(jīng)過上述步驟,獲得引物組合。引物組合由120條引物組成,用于檢測68個基因座。各個基因座的名稱、擴增基因座對應(yīng)的引物名稱和引物的核苷酸序列依次見表1中第1列、第2列和第3列。進行pcr擴增時各個引物的**佳濃度見表1中第5列。表1各個基因座對應(yīng)的引物在hg38人類參考基因組(hg38人類基因組的信息見網(wǎng)址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr擴增產(chǎn)物的長度和核苷酸序列詳見表2。各個str基因座的pcr擴增產(chǎn)物的長度范圍分布見圖1。表2三、基于二代測序技術(shù)檢測68個基因座的試劑盒的制備基于二代測序技術(shù)檢測68個基因座的試劑盒包括引物混合物;引物混合物由步驟二制備的120條引物混合而成。實施例2、實施例1制備的試劑盒檢測標準品2800m的str分型及其應(yīng)用一、實施例1制備的試劑盒檢測標準品2800m的str分型1、dna樣本準備取標準品2800m,用超純水稀釋,獲得濃度為1ng/μl的標準品2800m水溶液。2、pcr擴增以標準品2800m水溶液為模板,采用實施例1步驟三制備的引物混合物進行pcr擴增,得到pcr擴增產(chǎn)物。河南全平臺邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺鄭重承諾