浙江標(biāo)準(zhǔn)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作

    ，構(gòu)建單鏈DNA測序文庫。，固體支撐體的每一個單獨(dú)小空間中只包含一條DNA鏈，之后通過PCR特異性的將模板DNA進(jìn)行富集，從而達(dá)到測序所需的模板量。，反應(yīng)試劑清洗和成像捕捉，不斷反復(fù)進(jìn)行此三步循環(huán)，每一個循環(huán)按順序測定序列中的一個堿基。第二代測序技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)第二代測序技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)：一次能夠同時得到大量的序列數(shù)據(jù)，相比于一代測序技術(shù)，通量提高了成千上萬倍；單條序列成本非常低廉。第二代測序技術(shù)的缺點(diǎn)：序列讀長較短，Illumina平臺**長為250-300bp，454平臺也只有500bp左右；由于建庫中利用了PCR富集序列，因此有一些含量較少的序列可能無法被大量擴(kuò)增，造成一些信息的丟失，且PCR過程中有一定概率會引入錯配堿基；想要得到準(zhǔn)確和長度較長的拼接結(jié)果，需要測序的覆蓋率較高，導(dǎo)致結(jié)果錯誤較多和成本增加。第二代測序技術(shù)的應(yīng)用二代測序是現(xiàn)階段科研市場的主力平臺，主要應(yīng)用包括：基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、群體測序、擴(kuò)增子測序、宏基因組測序、重測序等。由于成本較低，二代測序在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用也十分***，主要包括：**基因組、遺傳病基因組、**與代謝疾病等。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)為全球合作伙伴提供包括生物標(biāo)記物挖掘、藥物靶點(diǎn)驗(yàn)證、伴隨診斷開發(fā)等一體化解決方案。浙江標(biāo)準(zhǔn)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作

    1、文庫把DNA樣本片段化或篩分成指定長度的目標(biāo)序列，再加上寡核苷酸接頭（和條形碼DN**段的大小是NGS文庫構(gòu)建的主要因素。片段化可以通過不同的方法，比如PCR擴(kuò)增法。（NGS實(shí)驗(yàn)流程相對復(fù)雜，在過程中會應(yīng)用到PCR擴(kuò)增技術(shù)）），用于后續(xù)測序上機(jī)。2、讀長被片段化后的DNA鏈長度，二代測序通常是100-200bp（bp是雙鏈DNA堿基對單位）。3、通量一次測序上機(jī)可以運(yùn)行的樣本（基因）數(shù)量。4、測序深度一個基因片段被掃描的次數(shù)，測序深度深可提高低頻突變檢出率和檢測準(zhǔn)確率。5、全基因組測序一種生物的全部基因序列的測序，人的基因組序列約3G，基因組是一個細(xì)胞或者生物體所攜帶的全部遺傳信息。作者：心平氣和鏈接：源：知乎著作權(quán)歸作者所有。商業(yè)轉(zhuǎn)載請聯(lián)系作者獲得授權(quán)，非商業(yè)轉(zhuǎn)載請注明出處。 安徽專業(yè)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺創(chuàng)新服務(wù)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)提供完整的多平臺多組學(xué)服務(wù)，打造流程化yao企業(yè)合作。

    ABI/SOLiDSOLiD技術(shù)是由連接酶測序法發(fā)展而來，LerroyHood在上世紀(jì)80年代中期利用連接酶法設(shè)計(jì)了***臺自動熒光測序儀。SOLiD以四色熒光標(biāo)記寡核苷酸的連續(xù)連接合成為基礎(chǔ)，取代了傳統(tǒng)的聚合酶連接反應(yīng)，可對單拷貝DN**段進(jìn)行大規(guī)模擴(kuò)增和高通量并行測序。Illumina/SolexaIllumina公司的第二代測序儀**早由Solexa公司研發(fā)，其同樣為邊合成邊測序，該技術(shù)在測序的過程中，加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標(biāo)記的dNTP，因?yàn)閐NTP的3'羥基末端帶有可化學(xué)切割的部分，它只容許每個循環(huán)摻入單個堿基，此時，用激光掃描反應(yīng)板表面，根據(jù)dNTP所帶的熒光讀取每條模板序列每一輪反應(yīng)所聚合上去的核苷酸種類，經(jīng)過“合成-清洗-拍照”的循環(huán)過程，**終得到目的片段的堿基排列順序。技術(shù)原理Roche/454Roche/454技術(shù)原理，并在片段兩端加上不同的接頭，或?qū)⒋郎yDNA變性后用雜交引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，連接載體，構(gòu)建單鏈DNA文庫。，將包含PCR所有反應(yīng)成分的水溶液注入高速旋轉(zhuǎn)的礦物油表面，形成被礦物油包裹的無數(shù)個小水滴，每一個小水滴即為一個**的PCR反應(yīng)空間，理想狀態(tài)下，每一個小水滴只包含一個DNA模板和一個磁珠，磁珠表面含有與接頭互補(bǔ)的DNA序列，經(jīng)過PCR擴(kuò)增后。

    同時操作更為簡單，整個上機(jī)測序可在（文庫構(gòu)建時間除外）。其劣勢在于芯片的通量并不高，非常適合小基因組和外顯子驗(yàn)證的測序。小結(jié)：二代測序相比一代測序大幅降低了成本，保持了較高準(zhǔn)確性，并且大幅降低了測序時間，將一個人類基因組從3年降為1周以內(nèi)，但在序列讀長方面比起***代測序技術(shù)則要短很多，這也給三代測序提供了發(fā)展空間。三、獨(dú)辟蹊徑補(bǔ)空缺三代測序：單分子測序背景：測序技術(shù)經(jīng)過***代、第二代的發(fā)展，讀長從一代測序的近1000bp，降到了二代測序的幾百bp，通量和速度大幅提升，那么第三代測序的發(fā)展思路在于保持二代測序的速度和通量優(yōu)勢同時，彌補(bǔ)其讀長較短的劣勢。三代測序與前兩代相比，**大的特點(diǎn)就是單分子測序，測序過程無需進(jìn)行PCR擴(kuò)增。1、Oxfordnanopore納米孔+電流檢測技術(shù)原理：該技術(shù)設(shè)計(jì)了一種特殊的納米孔，孔內(nèi)共價結(jié)合有分子接頭，**終得到電信號而不是光信號或pH信號的測序技術(shù)。當(dāng)DNA堿基通過納米孔時，電荷將發(fā)生變化，因而短暫地影響流過納米孔的電流強(qiáng)度（每種堿基所影響的電流變化幅度是不同的），靈敏的電子設(shè)備檢測到這些變化從而鑒定所通過的堿基。優(yōu)勢劣勢：①讀長很長，大約在幾十kb，甚至100kb；②錯誤率目前相比較高。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)針對藥物研發(fā)過程中靶點(diǎn)、適應(yīng)癥及PD研究中生物標(biāo)志物等研究的進(jìn)行方案開發(fā)設(shè)計(jì)。

    不同的二代測序平臺的區(qū)別主要體現(xiàn)在測序反應(yīng)的技術(shù)上，這些差別可以分為4類：焦磷酸測序，合成法測序，連接法測序和離子半導(dǎo)體測序。焦磷酸測序在焦磷酸測序中，測序反應(yīng)通過每個核苷酸結(jié)合過程中釋放的焦磷酸來調(diào)控。釋放的焦磷酸參與了一系列化學(xué)反應(yīng)從而導(dǎo)致鏈光的產(chǎn)***出的光由記錄基因蔟相應(yīng)序列的相機(jī)來檢測。測序反應(yīng)開始后，先一次孵育一個堿基，測量光發(fā)射情況（如果有的話），在降解未參與反應(yīng)的堿基，***加入另一個堿基。這項(xiàng)技術(shù)能夠產(chǎn)生較大的讀取長度，已經(jīng)可以與Sanger測序法得到的讀取長度相比較。然而，高昂的試劑花費(fèi)，和有6個或以上的均聚物會產(chǎn)生的高錯誤率阻礙了這個技術(shù)的應(yīng)用。合成法測序合成測序法是使用可逆熒光和終止核苷酸的分步整合的方法進(jìn)行DNA測序，并已被llluminaNGS平臺使用。首先在測序芯片中同時加入四種核苷酸，核苷酸結(jié)合之后，剩余的DNA堿基就會被洗滌去除。每個基因蔟中熒光信號被讀取和記錄之后，這個過程一直重復(fù)直到測序反應(yīng)完成。這個系統(tǒng)能通過一次只結(jié)合一個核苷酸來克服焦磷酸測序的缺點(diǎn)。然而，當(dāng)測序反應(yīng)進(jìn)行時，儀器的錯誤率也在增加。這是因?yàn)槿コ煌耆臒晒庑盘枙?dǎo)致更高的背景噪聲。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)建立了符合質(zhì)量體系規(guī)定的覆蓋全平臺的伴隨診斷產(chǎn)品研發(fā)實(shí)驗(yàn)室、質(zhì)檢實(shí)驗(yàn)室，擁有GSP證書。浙江專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺來電咨詢

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)希望能和創(chuàng)新型藥企共同探索創(chuàng)新生物標(biāo)志物的臨床應(yīng)用潛力。浙江標(biāo)準(zhǔn)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作

在政策促進(jìn)下，未來3—5年內(nèi)，我國將在醫(yī)藥健康短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才 培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺，培育一批品牌優(yōu)勢明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團(tuán)。我國高度重視石蠟組織DNA提取試劑盒，全血DNA提取試劑盒，免疫組化抗原修復(fù)緩沖液，c-MET抗體試劑的供應(yīng)保證工作，推動研發(fā)和供應(yīng)保證也是深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改進(jìn)的重要任務(wù)。醫(yī)藥相關(guān)部門多次發(fā)布政策文件，鼓勵石蠟組織DNA提取試劑盒，全血DNA提取試劑盒，免疫組化抗原修復(fù)緩沖液，c-MET抗體試劑的研發(fā)和生產(chǎn)，提高醫(yī)藥的供應(yīng)保證能力。隨著西方健康服務(wù)理念的進(jìn)入及國內(nèi)需求市場的飛速增長，國內(nèi)以體檢為重點(diǎn)的其他有限責(zé)任公司得到了飛速發(fā)展，尤其是近年來，健康服務(wù)機(jī)構(gòu)飛速發(fā)展。盡管中國老年健康服務(wù)目前仍處于初始發(fā)展階段，但近年來我國出臺了一些扶持政策，市場空間逐漸打開。加之轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、伴隨診斷、藥企服務(wù)工作。藥物臨床前檢測、藥物臨床檢測、伴隨診斷開發(fā)、用藥指導(dǎo)檢測；實(shí)體瘤試劑、血液瘤試劑、試劑、設(shè)備耗材、產(chǎn)品定制、用藥指導(dǎo)檢測等。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)注重質(zhì)量體系的建立，公司與國內(nèi)外藥企、診斷公司及檢測平臺公司等發(fā)起成立了醫(yī)療與伴隨診斷專業(yè)委員會（中國生物工程學(xué)會下屬），旨在推動醫(yī)療及伴隨診斷事業(yè)健康發(fā)展。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)已然成為中國醫(yī)療中診斷整體解決方案的供應(yīng)者?！皟善敝啤眽嚎s流通渠道層級，減少中間環(huán)節(jié)層層加價；反商業(yè)賄賂、稅務(wù)改進(jìn)等一系列政策的落地，迫使產(chǎn)業(yè)從不規(guī)范、低水平的商業(yè)化向規(guī)范的、高水平成熟的商業(yè)化進(jìn)化。浙江標(biāo)準(zhǔn)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作