聚合酶鏈?zhǔn)剑篜CR由變性--退火--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2-4分鐘,2-3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬(wàn)倍。到達(dá)平臺(tái)期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝?!CR技術(shù)敏感性高,特異性強(qiáng),操作簡(jiǎn)便、快速,在生命科學(xué)研究、食品衛(wèi)生、醫(yī)療、法醫(yī)及環(huán)境監(jiān)測(cè)等諸多方面都具有重要的應(yīng)用價(jià)值。PCR反應(yīng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用。連云港細(xì)胞PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)
聚合酶鏈反應(yīng):嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過(guò)減少DNA非特異性擴(kuò)增的背景,提高DNA擴(kuò)增的特異性。兩組引物用于兩個(gè)連續(xù)的PCR。在個(gè)反應(yīng)中,一對(duì)引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預(yù)期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴(kuò)增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應(yīng),所述引物的結(jié)合位點(diǎn)完全或部分不同于次反應(yīng)中使用的每個(gè)引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長(zhǎng)DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識(shí)。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)或者通過(guò)重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個(gè)或多個(gè)含有互補(bǔ)序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)序列或突變的DN段;這項(xiàng)技術(shù)可以創(chuàng)造特定的長(zhǎng)DNA構(gòu)建體。它還可以將缺失、插入或點(diǎn)突變引入DNA序列。上海分子生物學(xué)PCR檢測(cè)技術(shù)方案電子聚合酶鏈反應(yīng)用于計(jì)算理論聚合酶鏈反應(yīng)結(jié)果。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的循環(huán)參數(shù):預(yù)變性,模板DNA完全變性與PCR酶的完全對(duì)PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時(shí)間參考試劑說(shuō)明書,一般未修飾的Taq酶時(shí)間為兩分鐘。變性步驟,循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列完全變性,可能的情況下可縮短該步驟時(shí)間。變性時(shí)間過(guò)長(zhǎng)損害酶活性,過(guò)短靶序列變性不徹底,易造成擴(kuò)增失敗。引物退火,退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴(kuò)增的長(zhǎng)度適當(dāng)下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)上做出預(yù)估。退火溫度對(duì)PCR的特異性有較大影響。引物延伸,引物延伸一般在72℃進(jìn)行(Taq酶很適溫度)。但在擴(kuò)增長(zhǎng)度較短且退火溫度較高時(shí),本步驟可省略延伸時(shí)間隨擴(kuò)增片段長(zhǎng)短而定,一般推薦在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設(shè)定為1min/kbp。循環(huán)數(shù),大多數(shù)PCR含25-35循環(huán),過(guò)多易產(chǎn)生非特異擴(kuò)增。延伸,在一個(gè)循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持10-30分鐘.使引物延伸完全,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。
聚合酶鏈反應(yīng)的常見(jiàn)問(wèn)題分析與解決方法:擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶(雜帶):引物用量偏大,引物的特異性不高。應(yīng)調(diào)換引物或降低引物的使用量。循環(huán)的次數(shù)過(guò)多。適當(dāng)增加模板的量,減少循環(huán)次數(shù)。酶的用量偏高或酶的質(zhì)量不好,應(yīng)降低酶量或調(diào)換另一來(lái)源的酶。退火溫度偏低,退火及延伸時(shí)間偏長(zhǎng)。應(yīng)提高退火溫度,減少變性與延伸時(shí)間,也可采用二種溫度的PCR擴(kuò)增。以2度為梯度設(shè)計(jì)梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。 樣品處理不當(dāng)。Mg2+濃度偏高,因適當(dāng)調(diào)整Mg2+使用濃度。若為PCR試劑盒,也可能時(shí)試劑盒本身質(zhì)量有問(wèn)題。復(fù)制提前終止。使用非熱啟動(dòng)的聚合酶時(shí)常有發(fā)生。冰上準(zhǔn)備反應(yīng)體系或采用熱啟動(dòng)聚合酶。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。
PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過(guò)高會(huì)加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過(guò)高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過(guò)高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無(wú)校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過(guò)長(zhǎng)使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長(zhǎng)度在15~25時(shí)退火溫度。PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克量級(jí)的起始待測(cè)模板擴(kuò)增到微克水平。武漢分子生物學(xué)定量PCR網(wǎng)站
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過(guò)程。連云港細(xì)胞PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)
聚合酶鏈反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個(gè)引物對(duì)擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個(gè)PCR混合物中的多個(gè)引物組組成,以產(chǎn)生對(duì)不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子。通過(guò)同時(shí)靶向多個(gè)基因,可以從單次測(cè)試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時(shí)間來(lái)執(zhí)行。每個(gè)引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個(gè)反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說(shuō),當(dāng)通過(guò)凝膠電泳可視化時(shí),它們的堿基對(duì)長(zhǎng)度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。連云港細(xì)胞PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)