四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-10-09

CoIP-Mass和CoIP-WB優(yōu)劣勢(shì):優(yōu)勢(shì):高通量獲得目的蛋白的專屬蛋白互作庫。劣勢(shì):CoIP的蛋白庫魚龍混雜,包含目的蛋白的直接/間接互作蛋白,非特異結(jié)合,殘留蛋白。常規(guī)理想IP-Mass項(xiàng)目可鑒定到1000-2000個(gè)蛋白,其中絕大部分是非特異性結(jié)合及清洗殘留的背景蛋白,導(dǎo)致CoIP-Mass假陽性高,CoIP-WB驗(yàn)證成功率低,導(dǎo)致研發(fā)進(jìn)展反復(fù)跌宕,時(shí)間和經(jīng)費(fèi)成本占用較大,嚴(yán)重影響士氣。其次,項(xiàng)目受限于蛋白表達(dá)量和IP抗體有效性,達(dá)到理想狀態(tài)的CoIP-Mass較難,同時(shí)分析門檻較高。因此,該項(xiàng)目成功實(shí)施,比較依賴成熟和有分析經(jīng)驗(yàn)的團(tuán)隊(duì)。建議整包交給專業(yè)的服務(wù)商開展檢測(cè)。IP-Mass實(shí)驗(yàn)流程:樣品制備、免疫沉淀、洗脫、蛋白酶消化、質(zhì)譜分析、數(shù)據(jù)分析,鑒定互作蛋白!四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè)

四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè),CoIP

免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn),細(xì)胞的收集及裂解方法如下:

收集2E7個(gè)細(xì)胞樣品,加入PBS洗滌細(xì)胞,離心后棄上清收集細(xì)胞沉淀。

準(zhǔn)備500μl預(yù)冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混勻后加進(jìn)細(xì)胞沉淀中吹打均勻,冰上孵育30min,期間渦旋混勻幾次。

4℃,12000rpm離心10min,取上清,進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定及后續(xù)實(shí)驗(yàn)。廣州基云生物,在IP互作組檢測(cè)和關(guān)鍵機(jī)制分子篩選驗(yàn)證領(lǐng)域,具有豐富的經(jīng)驗(yàn),助力您的互作機(jī)制研究,歡迎垂詢合作。 四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè)CoIP實(shí)驗(yàn)內(nèi)源檢測(cè)與外源檢測(cè)的優(yōu)缺點(diǎn)。

四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè),CoIP

免疫共沉淀也存在一些局限性。例如,它可能無法檢測(cè)到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。此外,兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合,而可能有第三者在中間起橋梁作用。此外,實(shí)驗(yàn)前需要預(yù)測(cè)目的蛋白以選擇相應(yīng)的抗體,因此,如果預(yù)測(cè)不正確,實(shí)驗(yàn)可能無法得到結(jié)果,這使得這種方法具有一定的冒險(xiǎn)性??偟膩碚f,免疫共沉淀是一種強(qiáng)大的技術(shù),它能夠?yàn)槲覀兲峁╆P(guān)于蛋白質(zhì)相互作用的寶貴信息。然而,為了得到準(zhǔn)確和可靠的結(jié)果,我們需要謹(jǐn)慎地解釋和分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),并考慮到這種方法的局限性。

CoIP實(shí)驗(yàn)Western檢測(cè)目的蛋白方法如下:

配膠。

上樣,跑電泳,恒壓100min。

轉(zhuǎn)膜,濕轉(zhuǎn)250mA恒流轉(zhuǎn)1-2h。

封閉,將PVDF膜放入5%的脫脂牛奶中,封閉1h。

孵育一抗(PBS稀釋),4℃孵育過夜。

TBST洗膜3次,每次5min。

孵育二抗(TBST稀釋),室溫孵育1h。

TBST洗膜3次,每次5min。

按1:1的比例將ECL發(fā)光液均勻滴到膜上

曝光,顯影,定影。

廣州基云生物,在IP互作組檢測(cè)和關(guān)鍵機(jī)制分子篩選驗(yàn)證領(lǐng)域,具有豐富的經(jīng)驗(yàn)和專業(yè)的技術(shù),助力您的互作機(jī)制研究。 免疫共沉淀法證實(shí)蛋白互作,基于抗體專一性,揭示生理性相互作用。

四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè),CoIP

在CoIP(免疫共沉淀)實(shí)驗(yàn)中,技術(shù)重復(fù)和生物重復(fù)設(shè)計(jì)建議如下:進(jìn)行多次技術(shù)重復(fù)(在同一實(shí)驗(yàn)條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(fù)(使用來自不同生物或不同實(shí)驗(yàn)條件的樣品),以評(píng)估結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。在設(shè)置對(duì)照組時(shí),還需要注意以下幾點(diǎn):對(duì)照組的設(shè)置應(yīng)遵循科學(xué)原理,并充分考慮實(shí)驗(yàn)的具體需求和目標(biāo)。確保對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組在實(shí)驗(yàn)條件和操作步驟上保持一致,以便進(jìn)行準(zhǔn)確的比較。在分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果時(shí),應(yīng)綜合考慮對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的數(shù)據(jù),以得出更準(zhǔn)確的結(jié)論??傊?,在CoIP實(shí)驗(yàn)中,通過精心設(shè)計(jì)和執(zhí)行對(duì)照組實(shí)驗(yàn),可以提高實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性,從而更準(zhǔn)確地評(píng)估目標(biāo)蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用。Co-IP技術(shù)廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域,助力科研人員探索生命奧秘!互作機(jī)制CoIP-mass spectrometry

Co-IP研究蛋白間互作,ChIP研究蛋白與DNA互作,實(shí)驗(yàn)原理各具特色!四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè)

Co-IP實(shí)驗(yàn)的內(nèi)源檢測(cè)注意事項(xiàng)如下:首先,確保使用的抗體具有高特異性和親和力,這是內(nèi)源檢測(cè)成功的關(guān)鍵。由于細(xì)胞內(nèi)蛋白表達(dá)復(fù)雜,非特異性結(jié)合可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果失真。其次,嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)條件,如細(xì)胞裂解和洗滌條件,以避免破壞蛋白質(zhì)相互作用或引入非特異性蛋白。溫和地釋放細(xì)胞內(nèi)蛋白,保證釋放出的蛋白不被蛋白酶分解,同時(shí)實(shí)驗(yàn)過程需保持低溫。此外,注意樣本的采集和處理。樣本應(yīng)盡快處理,避免蛋白降解,同時(shí)防止樣本在運(yùn)輸過程中溫度過高導(dǎo)致變質(zhì)。另外,結(jié)合其他實(shí)驗(yàn)方法進(jìn)行驗(yàn)證,如Western Blot等,以確認(rèn)Co-IP實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。綜上所述,Co-IP實(shí)驗(yàn)的內(nèi)源檢測(cè)需要關(guān)注抗體選擇、實(shí)驗(yàn)條件控制、樣本處理以及結(jié)果驗(yàn)證等方面,以確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。四川互作機(jī)制CoIP WB檢測(cè)

標(biāo)簽: 蛋白組芯片 CoIP ChIP RIP