多重擴增高通量測序平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-10-21

AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細胞膜,嵌入所有細胞(活細胞和死細胞)的細胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細胞膜,即死細胞的細胞膜,嵌入所有死細胞的細胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細胞和死細胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細胞計數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細胞濃度(總細胞,活細胞,死細胞)、細胞存活率(臺盼藍和雙熒光AO/PI染色)、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結(jié)果的展示。ChIP項目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測為準。其余具體咨詢生工高通量測序部。多重擴增高通量測序平臺

高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標準實驗室(通過了國家ISO認證)以及10PB級運算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團隊建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。上海地區(qū)多重PCR高通量測序原理生工一直秉持只要生工已經(jīng)標準化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準),全部無費用。

生工CHIP-Seq,項目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具,還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達的關(guān)系。通過高通量測序,可以一次性得到目的蛋白在整個基因組上的結(jié)合分布,得到目的蛋白精確的結(jié)合位點以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段,并對其進行純化與文庫構(gòu)建;然后對富集得到的DNA的片段進行高通量測序,將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。

使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應(yīng)當計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。RNA樣品建議用足量干冰運輸。

生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。全質(zhì)粒測序高通量測序公司

現(xiàn)在也有學者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。多重擴增高通量測序平臺

簡化基因組測序,項目介紹:通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進行酶切,并對酶切片段進行高通量測序,這種通過酶切降低基因組的復雜度的測序技術(shù)統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術(shù)。利用生物信息學方法,進行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序,項目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進行大規(guī)模高通量測序(shotgun 策 略)。測到數(shù)據(jù)后,先進行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運用。多重擴增高通量測序平臺

生工生物工程(上海)股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中,一直處在一個不斷銳意進取,不斷制造創(chuàng)新的市場高度,多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價值理念的產(chǎn)品標準,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑,成績讓我們喜悅,但不會讓我們止步,殘酷的市場磨煉了我們堅強不屈的意志,和諧溫馨的工作環(huán)境,富有營養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新,勇于進取的無限潛力,生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來,回首過去,我們不會因為取得了一點點成績而沾沾自喜,相反的是面對競爭越來越激烈的市場氛圍,我們更要明確自己的不足,做好迎接新挑戰(zhàn)的準備,要不畏困難,激流勇進,以一個更嶄新的精神面貌迎接大家,共同走向輝煌回來!

標簽: 高通量測序