上海地區(qū)SNP高通量測序NGS

高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來，逐步引進(jìn)了Illumina，Life，PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室（通過了國家ISO認(rèn)證）以及10PB級運(yùn)算能力的服務(wù)器集群，能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí)，生工高通量測序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中，目前有50余專職員工，其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上，5年來，通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過1000分以上。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海地區(qū)SNP高通量測序NGS

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式，可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務(wù)；IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式，可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴(kuò)增子測序、核酸適配體測序等服務(wù)；LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù)；PacBioSequel/RSII該測序平臺讀長超長，平均可達(dá)10kb以上，主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、***基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序等服務(wù)；上海市宏基因組高通量測序高通量單細(xì)胞測序技術(shù)可以檢測復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性.

懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢？單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求：?細(xì)胞濃度：700-1200cells/μl；?細(xì)胞活率>80%（當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理）；細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%（無細(xì)胞粘連，無明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán)，并保證細(xì)胞的完整性）；?細(xì)胞狀態(tài)：細(xì)胞直徑在7-40um之間（細(xì)胞直徑過大則建議進(jìn)行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。

轉(zhuǎn)錄組測序，項(xiàng)目介紹：RNA-Seq，是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集，然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝，從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而可以對該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化，針對關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建。小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。

small RNA測序，項(xiàng)目簡介：Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，長度在18-30 nt之間，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默，參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化，以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測序和表達(dá)定量，從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后，進(jìn)行Clean reads 長度分布統(tǒng)計(jì)，small RNA注釋，已知 miRNA 注釋，已知piRNA注釋，ncRNA分析，新 miRNA 預(yù)測（有參考基因組），差異基因可視化分析，miRNA 家族分析，差異表達(dá) miRNA 聚類分析，miRNA靶基因預(yù)測，靶基因GO、KEGG富集分析。DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子。高通量測序高通量

準(zhǔn)確、迅速，可以說是KBSeq的代名詞了。上海地區(qū)SNP高通量測序NGS

2021年11月1日，在這個(gè)平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量測序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X！不要看我們個(gè)頭小，我們可是百萬級單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢？多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞）。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)，每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞，去除雙細(xì)胞率后，每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。上海地區(qū)SNP高通量測序NGS

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來、有夢想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來的道路上大放光明，攜手共畫藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來公司能成為*****，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息，斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績，一直以來，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠實(shí)守信的方針，員工精誠努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來贏得市場，我們一直在路上！