上海多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序測(cè)序

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式，可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、人基因組重測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、宏基因組測(cè)序、微生物分類測(cè)序等服務(wù)；IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式，可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測(cè)序/Denovo測(cè)序、微生物分類測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、核酸適配體測(cè)序等服務(wù)；LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序、基因組重測(cè)序服務(wù)；PacBioSequel/RSII該測(cè)序平臺(tái)讀長超長，平均可達(dá)10kb以上，主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、***基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長轉(zhuǎn)錄本測(cè)序等服務(wù)；生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例。上海多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序測(cè)序

AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細(xì)胞濃度（總細(xì)胞，活細(xì)胞，死細(xì)胞）、細(xì)胞存活率（臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色）、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。上海地區(qū)單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序測(cè)序PacBio Sequel/RSII 該測(cè)序平臺(tái)主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、fungus基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長轉(zhuǎn)錄本測(cè)序服務(wù)。

2021年11月1日，在這個(gè)平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量測(cè)序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X！不要看我們個(gè)頭小，我們可是百萬級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢？多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞）。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)，每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞，去除雙細(xì)胞率后，每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。

使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計(jì)數(shù)室潔凈無瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻；3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù)，一般建議不要超過10分鐘；4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過多，難以數(shù)清，應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù)；5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計(jì)數(shù)。組織材料樣品（提取RNA用），請(qǐng)預(yù)先用液氮速凍，然后轉(zhuǎn)移到干冰中運(yùn)輸。

生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部free。生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目，一站式解決問題。同時(shí)生工生物單細(xì)胞團(tuán)隊(duì)目前已同時(shí)擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺(tái)，可為您提供超高通量和低通量單細(xì)胞樣本雙重。RNA樣品建議用足量干冰運(yùn)輸。上海市宏基因組高通量測(cè)序高通量

什么是KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序？上海多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序測(cè)序

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中，制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢？單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求：?細(xì)胞濃度：700-1200cells/μl；?細(xì)胞活率>80%（當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理）；細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%（無細(xì)胞粘連，無明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán)，并保證細(xì)胞的完整性）；?細(xì)胞狀態(tài)：細(xì)胞直徑在7-40um之間（細(xì)胞直徑過大則建議進(jìn)行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。上海多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序測(cè)序

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