2021年11月1日，在這個(gè)平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X！不要看我們個(gè)頭小，我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢？多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞）。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)，每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞，去除雙細(xì)胞率后，每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。生工生物接受客戶自備文庫(kù)測(cè)序項(xiàng)目。上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序應(yīng)用
生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部free。生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目，一站式解決問(wèn)題。同時(shí)生工生物單細(xì)胞團(tuán)隊(duì)目前已同時(shí)擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺(tái)，可為您提供超高通量和低通量單細(xì)胞樣本雙重。上海地區(qū)18s高通量測(cè)序原理DNA樣品建議用藍(lán)冰運(yùn)輸。
生工高通量測(cè)序樣品要求，RNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品，樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來(lái)源。比較好附上QC數(shù)據(jù)，可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒，可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法（如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等）或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間，管口使用Parafilm封口。在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中，再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運(yùn)輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。
通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果：明場(chǎng)（細(xì)胞未染色）：主要可以觀察懸液背景質(zhì)量（背景干凈，無(wú)雜質(zhì)碎片，無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊）；臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)（細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后）：主要可以觀察活性（主要為活細(xì)胞，未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞）；通過(guò)臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)計(jì)算活率：90%>80%；細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來(lái)看，血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn)，屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。以上就是我們本次的單細(xì)胞懸液質(zhì)檢指南分享啦。高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。
為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)？細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位，在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中，因細(xì)胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同，其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程，以及在細(xì)胞分裂和分化過(guò)程中出現(xiàn)的誤差造成來(lái)自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息，如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過(guò)去的20多年中，人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，卻無(wú)法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組，而單細(xì)胞測(cè)序測(cè)量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]?，F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別，將傳統(tǒng)方法稱為批量測(cè)序。組織材料樣品（提取RNA用），請(qǐng)預(yù)先用液氮速凍，然后轉(zhuǎn)移到干冰中運(yùn)輸。上海地區(qū)轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序應(yīng)用
在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中，再將50 ml管放在封口袋中。上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序應(yīng)用
使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無(wú)雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計(jì)數(shù)室潔凈無(wú)瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口gun頭吹打混勻；3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù)，一般建議不要超過(guò)10分鐘；4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過(guò)多，難以數(shù)清，應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù)；5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計(jì)數(shù)。上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序應(yīng)用
生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明，攜手共畫藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來(lái)公司能成為*****，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息，斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績(jī)，一直以來(lái)，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針，員工精誠(chéng)努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng)，我們一直在路上！