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生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部無費用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。目前,生工生物已開展10x單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!生工生物 高通量測序應(yīng)用
懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢?單細胞懸液質(zhì)控要求:?細胞濃度:700-1200cells/μl;?細胞活率>80%(當(dāng)細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理);細胞團及碎片雜質(zhì)<5%(無細胞粘連,無明顯的細胞碎片和細胞團,并保證細胞的完整性);?細胞狀態(tài):細胞直徑在7-40um之間(細胞直徑過大則建議進行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細胞的核酸分子。上海單細胞測序高通量測序公司單細胞轉(zhuǎn)錄組測序指在單細胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析的技術(shù)。
對于細胞樣品,送樣量需達到 5 × 106(5乘10的6次方)數(shù)量級。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重懸,注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強烈建議細胞樣品先做細胞鑒定及支原體/衣原體污染之后,再送出來。對于血液樣本,只接收未凍存過的抗凝血新鮮樣本。抗凝劑不可使用肝素鈉,可用EDTA或ACD抗凝劑,取血后以冰袋保存,切記不能使血液凍結(jié),從取血之時開始計算,須在48小時之內(nèi)送達生工上海總部高通量測序部。如果不能提供新鮮樣本,則請?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見B、RNA 樣品。
生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。
為什么要用單細胞測序技術(shù)?細胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長發(fā)育的過程中,因細胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細胞系或個體的細胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細胞異質(zhì)性。細胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個細胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細胞、動植物組織甚至是整個生物體。在過去的20多年中,人們對轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無法揭示細胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細胞群的平均基因組,而單細胞測序測量的是細胞群中單個細胞的基因組[7]。現(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。上海轉(zhuǎn)錄組高通量測序平臺
生工生物接受客戶自備文庫測序項目。生工生物 高通量測序應(yīng)用
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序,其研究主要包括3個方面:第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測序,是對未知基因組序列的物種進行基因組測序,并綜合利用不同測序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對研究物種進行序列拼接和修正,進而獲得該物種的基因組序列圖譜;第二種為常見的全基因組重測序,是對已知基因組序列的物種進行個體或群體的測序研究,建立一個測序文庫進行單個個體或不同個體混合池測序,發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記,進行后續(xù)的研究;第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上,對不同品種的具有代表性個體建立多個文庫進行全基因組從頭組裝測序,此方法能夠進一步的進行參考基因組的修補和發(fā)現(xiàn)短序列比對難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才,可進行專業(yè)的項目分析,為客戶提供個性化服務(wù)。生工生物 高通量測序應(yīng)用
生工生物工程(上海)股份有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實現(xiàn)高質(zhì)量管理的追求。生工生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā)。生工生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。生工生物創(chuàng)始人王啟松,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。