全基因組甲基化測(cè)序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,對(duì)有參考基因組進(jìn)行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測(cè)序,是DNA甲基化檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關(guān)聯(lián)分析、基因調(diào)控分析、疾病的甲基化標(biāo)志物篩選等探索性課題的研究。技術(shù)優(yōu)勢(shì):DNA甲基化檢測(cè)**有力的工具,單堿基分辨率,檢測(cè)每個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài),全基因組范圍,**限度地獲得甲基化信息,適合所有有參考基因組的物種適合各種類(lèi)型的樣本。甲基化驗(yàn)證是甲基化研究必不可少的一環(huán)。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富
WGBS:科學(xué)方案設(shè)計(jì):從項(xiàng)目背景了解、協(xié)助方案設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)材料選取、建庫(kù)測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析每個(gè)項(xiàng)目有特定的科學(xué)問(wèn)題;需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì)及時(shí)高效的溝通;以保障高質(zhì)量研究成果。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>30ng/ul;無(wú)RNA和蛋白污染建庫(kù)測(cè)序:測(cè)序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測(cè)序深度:>=30X。信息分析:基于全基因組范圍的甲基化分析,數(shù)據(jù)質(zhì)控,5mCCalling,5mC在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本甲基化差異聚類(lèi),差異甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,結(jié)合項(xiàng)目背景和科學(xué)問(wèn)題的數(shù)據(jù)亮點(diǎn)挖掘。安徽WGBSDNA甲基化口碑推薦ATAC-seq實(shí)驗(yàn)過(guò)程短,從實(shí)驗(yàn)到分析可達(dá)2周。
DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體,將活性甲基轉(zhuǎn)移至DNA鏈中特定堿基上的化學(xué)修飾過(guò)程。哺乳動(dòng)物基因組中,DNA甲基化多發(fā)生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一種表觀(epigenetic)修飾,它在不改變DNA序列的情況下,對(duì)個(gè)體的生長(zhǎng)、發(fā)育、基因表達(dá)模式以及基因組的穩(wěn)定性起到重要的調(diào)控作用,這種修飾是可逆的,并且這種修飾在發(fā)育和細(xì)胞增殖的過(guò)程中是可以穩(wěn)定傳遞的。近年來(lái)的大量研究表明,DNA異常甲基化與**的發(fā)生、發(fā)展、細(xì)胞*變有著密切的聯(lián)系。
industryTemplateRRBS用于人、哺乳動(dòng)物及魚(yú)類(lèi)方向的高水平甲基化研究。
羥甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通過(guò)5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段,然后結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,快速、高效地尋找羥甲基化區(qū)域??蓮V泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過(guò)程中的研究。技術(shù)優(yōu)勢(shì):從項(xiàng)目背景了解、協(xié)助方案設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)材料選取、建庫(kù)測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析每個(gè)項(xiàng)目有特定的科學(xué)問(wèn)題;需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì)及時(shí)高效的溝通;以保障高質(zhì)量研究成果強(qiáng)化版RRBS技術(shù)及應(yīng)用是高性價(jià)比方案。四川RRBSDNA甲基化口碑推薦
中小樣本篩選, 大樣本中進(jìn)一步驗(yàn)證。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富
甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通過(guò)5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段,然后結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,快速、高效地尋找甲基化區(qū)域??蓮V泛應(yīng)用于甲基化與疾病關(guān)系研究。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>50ng/ul;無(wú)RNA和蛋白污染,建庫(kù)測(cè)序:測(cè)序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測(cè)序深度:20-30Mreads。信息分析:基于全基因組范圍的羥甲基化分析,數(shù)據(jù)質(zhì)控,Peak鋒Calling,Peak鋒在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本羥甲基化差異聚類(lèi),差異羥甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,結(jié)合項(xiàng)目背景和科學(xué)問(wèn)題的數(shù)據(jù)亮點(diǎn)挖掘。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富